102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2203 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 62 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  70 
 
 		 62 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.67 
 
 		 62 aa  85.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  63.33 
 
 		 62 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  58.33 
 
 		 62 aa  80.1  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  61.02 
 
 		 62 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00122069  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  49.18 
 
 		 62 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  49.18 
 
 		 62 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  50.82 
 
 		 61 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.54 
 
 		 63 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  50.82 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  33.87 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  33.87 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.26 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128448  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  41.67 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.46 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.82 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.82 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  32.79 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  40.98 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  40.98 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  40.98 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  41.94 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  42.37 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  42.37 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  32.79 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.98 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  40.68 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  41.67 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  40.68 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.46 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  39.34 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  39.34 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  36.07 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  40.32 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0129  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.11 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.91407  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  34.92 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  41.07 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2977  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.62 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  34.92 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4429  putative ferredoxin  37.7 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.83 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3343  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.07 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000237293  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0650  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  45.9 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000524122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  33.87 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  36.51 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  37.5 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1365  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  44.64 
 
 		 63 aa  44.3  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  37.29 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  35.48 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2919  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  44.64 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.74825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  35.48 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2133  hypothetical protein  35.48 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  35.48 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  31.15 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1607  ferredoxin  40.62 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1392  ferredoxin  40.62 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1365  ferredoxin  40.62 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.36587e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1364  ferredoxin  40.62 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000620183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0148  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  37.5 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1503  ferredoxin  40.62 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000800797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.915764  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  32.2 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  32.26 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1405  ferredoxin  40.62 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000280651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1644  ferredoxin  40.62 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000399057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1538  ferredoxin  40.62 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000879492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3807  ferredoxin  40.62 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000175659  hitchhiker  2.6375200000000003e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1577  ferredoxin  40.62 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.54272e-43 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0906  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.181195  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  35.48 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  29.51 
 
 		 76 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  37.29 
 
 		 60 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1206  ferredoxin  39.06 
 
 		 82 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000627013  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  35.48 
 
 		 65 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  39.06 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1206  hypothetical protein  38.98 
 
 		 317 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.68 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.68 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1051  ferredoxin  41.27 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.515037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3492  ferredoxin family protein, putative  40 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  32.79 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  33.33 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  37.1 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  38.18 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000199396  normal  0.668845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  33.87 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  34.43 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0549  ferredoxin  37.7 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  35.48 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0620  hypothetical protein  36.67 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  36.07 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2729  protein of unknown function DUF1271  36.07 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2240  hypothetical protein  34.21 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.295643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.34 
 
 		 59 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.27215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0429  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 64 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00643202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>