39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0129 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0129  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
83 aa  168  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.91407  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1503  hypothetical protein  56.16 
 
 
75 aa  80.9  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.37 
 
 
68 aa  72  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0705  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.3 
 
 
75 aa  71.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.11788  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2282  hypothetical protein  42.25 
 
 
74 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.43 
 
 
62 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2079  ferredoxin  40.54 
 
 
76 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.071924 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.36 
 
 
62 aa  54.3  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1829  ferredoxin  39.19 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.493143  hitchhiker  0.000000000927289 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.11 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0906  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.26 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.181195  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2117  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  37.84 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000643855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  33.78 
 
 
66 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  35.14 
 
 
349 aa  47  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.11 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1017  ferredoxin  35.9 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.194367 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.78 
 
 
60 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.62 
 
 
59 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.27215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.43 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  34.25 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  31.08 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.14 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1289  ferredoxin  36.49 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.29 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.44 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.14 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.86 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00122069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.51 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4473  hypothetical protein  34.07 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  32 
 
 
73 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.71 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0902  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.84 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.457587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.25 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128448  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  33.8 
 
 
63 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  31.43 
 
 
75 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  35.06 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  36.49 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  38.36 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2631  hypothetical protein  35.9 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338821  normal  0.255777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>