21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4473 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4473  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  193  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2240  hypothetical protein  72.83 
 
 
97 aa  136  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.295643  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2357  hypothetical protein  70.65 
 
 
97 aa  130  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.107773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2422  hypothetical protein  61.86 
 
 
102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1183  hypothetical protein  60 
 
 
103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296724  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4883  hypothetical protein  62.22 
 
 
107 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190233  normal  0.299907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2631  hypothetical protein  56.47 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338821  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0906  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.35 
 
 
78 aa  70.9  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.181195  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0918  4Fe-4S ferredoxin  57.58 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.72 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0129  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.07 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.91407  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  33.8 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  33.8 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.77 
 
 
68 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  30.14 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  45 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  32.39 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  32.39 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.17 
 
 
62 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.17 
 
 
62 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  32.89 
 
 
65 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>