126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4179 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  100 
 
 
63 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  80.95 
 
 
63 aa  104  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  80.95 
 
 
63 aa  104  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  79.37 
 
 
63 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  64.41 
 
 
62 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  53.33 
 
 
68 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.33 
 
 
68 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.33 
 
 
68 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  46.67 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.94 
 
 
62 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.55 
 
 
62 aa  57.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  45.76 
 
 
62 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.26 
 
 
62 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.32 
 
 
62 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  48.33 
 
 
64 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
61 aa  55.1  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.83 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  46.67 
 
 
61 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  42.86 
 
 
74 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  48.33 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  48.33 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  48.33 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  45.76 
 
 
349 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  42.37 
 
 
60 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  45 
 
 
64 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  44.62 
 
 
63 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  44.62 
 
 
63 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  46.67 
 
 
62 aa  50.8  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  46.67 
 
 
62 aa  50.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  42.37 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  43.55 
 
 
71 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  46.77 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.21 
 
 
61 aa  50.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128448  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  37.29 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  41.94 
 
 
60 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0906  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.1 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.181195  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  35.59 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  36.51 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  49.18 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  36.51 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  37.29 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  36.51 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  37.29 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.62 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00122069  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  43.33 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  40.68 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  45.9 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  43.33 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  41.27 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  43.33 
 
 
64 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  38.33 
 
 
64 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  43.33 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  36.21 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4034  putative ferredoxin  45 
 
 
64 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  44.26 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  34.43 
 
 
505 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.71 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5292  FdxD  42.62 
 
 
59 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887025  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  41.67 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  41.27 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  44.26 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  45.9 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45 
 
 
60 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  38.98 
 
 
62 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  38.98 
 
 
62 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  40.32 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3704  hypothetical protein  39.68 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623768  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5004  FdxD  41.27 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849859  normal  0.681013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  37.29 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  38.98 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  38.98 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  38.98 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3691  hypothetical protein  39.68 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3764  hypothetical protein  39.68 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310706  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  45 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  41.82 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4202  ferredoxin  37.29 
 
 
74 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0571776  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.98 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4098  hypothetical protein  30.51 
 
 
64 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594471  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7444  putative ferredoxin  41.67 
 
 
65 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4214  hypothetical protein  38.71 
 
 
64 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  43.55 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  34.33 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  43.55 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  43.55 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  40.98 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  41.27 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  38.1 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  38.6 
 
 
63 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  37.1 
 
 
64 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4621  FdxD  38.1 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1206  hypothetical protein  37.74 
 
 
317 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  41.67 
 
 
65 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  40.98 
 
 
62 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4709  FdxD  38.1 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0549  ferredoxin  40 
 
 
69 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  40.68 
 
 
62 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  40.62 
 
 
77 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>