37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4202 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4202  ferredoxin  100 
 
 
74 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0571776  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  51.52 
 
 
76 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  43.55 
 
 
62 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0549  ferredoxin  46.55 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  44.07 
 
 
63 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  44.07 
 
 
63 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  42.37 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  41.67 
 
 
62 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1918  hypothetical protein  36.76 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.98 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  35.94 
 
 
64 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  35.48 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  45.16 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  34.92 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  37.29 
 
 
63 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  36.92 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  40.32 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.94 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  38.36 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  32.26 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  32.26 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  32.26 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4098  hypothetical protein  37.29 
 
 
64 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594471  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3704  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623768  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  32.76 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3764  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310706  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3691  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.29 
 
 
61 aa  40.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  37.29 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11816  ferredoxin  32.39 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.454511  normal  0.975573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  36.21 
 
 
60 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  35.48 
 
 
69 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>