109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4159 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  130  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  84.38 
 
 
64 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  82.81 
 
 
65 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  82.81 
 
 
65 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  82.81 
 
 
65 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.88 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  46.03 
 
 
63 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  51.67 
 
 
63 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  51.67 
 
 
63 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  51.67 
 
 
63 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  49.18 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  45.31 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  42.19 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.19 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.19 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  40.62 
 
 
69 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  48.33 
 
 
63 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  40.62 
 
 
63 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  44.44 
 
 
62 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  39.06 
 
 
69 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  46.03 
 
 
62 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  46.03 
 
 
62 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  39.06 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  38.71 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  42.19 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  42.62 
 
 
60 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  42.19 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  43.75 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  42.19 
 
 
349 aa  50.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  42.62 
 
 
63 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  41.94 
 
 
63 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  43.55 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  37.5 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  37.5 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  39.06 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.26 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  37.5 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  38.1 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.62 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  42.19 
 
 
66 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11816  ferredoxin  39.06 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.454511  normal  0.975573 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  38.71 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  39.06 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  42.42 
 
 
60 aa  47.4  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  37.5 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.19 
 
 
60 aa  47.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  39.06 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  38.1 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  39.06 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  38.1 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  39.06 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  38.1 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  43.28 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5292  FdxD  40 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887025  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.67 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  40.62 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4202  ferredoxin  35.48 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0571776  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  36.51 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  36.51 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  36.51 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  37.5 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4428  oxidoreductase  38.81 
 
 
63 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  37.5 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.62 
 
 
60 aa  44.7  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  36.51 
 
 
62 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  39.39 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  37.5 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  37.1 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0549  ferredoxin  38.98 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  40 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0129  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.08 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.91407  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  40.62 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  40.62 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  34.92 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2133  protein of unknown function DUF1271  44.62 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  40.62 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  40.62 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2631  hypothetical protein  38.67 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338821  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3704  hypothetical protein  38.33 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623768  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4034  putative ferredoxin  40.62 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  38.1 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  33.33 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.62 
 
 
60 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  38.71 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2133  hypothetical protein  32.81 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111886  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  33.87 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  39.68 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3691  hypothetical protein  38.33 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  39.68 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3764  hypothetical protein  38.33 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310706  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  39.68 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  35.94 
 
 
65 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  32.81 
 
 
65 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  34.38 
 
 
77 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2729  protein of unknown function DUF1271  43.33 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295977  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0158  ferredoxin protein  34.92 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  38.71 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  37.5 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>