43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4428 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4428  oxidoreductase  100 
 
 		 63 aa  127  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  46.67 
 
 		 505 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2588  hypothetical protein  45.59 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449874  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  44.26 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  44.26 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  44.26 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  36.07 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  37.1 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3832  hypothetical protein  45.9 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00188009  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  40.98 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0997  oxidoreductase  46.67 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.611298  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4098  hypothetical protein  39.68 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  40.98 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  34.43 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  41.94 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  42.86 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4214  hypothetical protein  38.98 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  40.32 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  38.81 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11816  ferredoxin  38.1 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.454511  normal  0.975573 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.65 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  37.7 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  38.71 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  39.68 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  35.59 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  36.36 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  36.36 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  38.98 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  36.36 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  37.7 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  37.5 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  39.68 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  34.92 
 
 		 67 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  38.98 
 
 		 63 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  38.98 
 
 		 63 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  41.94 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4344  putative ferredoxin  34.43 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.268959  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  36.07 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  41.79 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4246  hypothetical protein  33.87 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  34.33 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  37.1 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  35.48 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>