57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4202 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  100 
 
 
63 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4429  putative ferredoxin  98.41 
 
 
63 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  51.56 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  51.56 
 
 
64 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  54.69 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  48.39 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  48.39 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  48.39 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  48.44 
 
 
64 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3841  putative ferredoxin  57.81 
 
 
64 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3780  putative ferredoxin  57.81 
 
 
64 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3768  putative ferredoxin  57.81 
 
 
64 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  44.26 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  45.31 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  43.55 
 
 
64 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  41.27 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  42.19 
 
 
66 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  48.44 
 
 
63 aa  57.4  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  45.31 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  41.27 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  42.19 
 
 
65 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2417  putative ferredoxin  53.12 
 
 
64 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0533344  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  48.44 
 
 
66 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  39.06 
 
 
68 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  39.68 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  40.62 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  42.86 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  42.19 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  41.94 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  37.1 
 
 
64 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  39.68 
 
 
64 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  43.55 
 
 
64 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.68 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.34 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  37.7 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  36.51 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  38.1 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  40.62 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  37.1 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.29 
 
 
62 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  38.33 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  39.06 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  48.28 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  40.62 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0944  putative ferredoxin  38.71 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  38.1 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  41.27 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  33.87 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.29 
 
 
62 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  35.48 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.9 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  33.33 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  36.07 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  33.33 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>