34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2586 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  100 
 
 
80 aa  158  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  38.1 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  45.76 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  41.54 
 
 
66 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0620  hypothetical protein  42.86 
 
 
83 aa  48.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  42.42 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  44.44 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  44.83 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  45.61 
 
 
64 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  43.55 
 
 
77 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  43.33 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  44.26 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  42.19 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  39.06 
 
 
63 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  41.94 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  44.83 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  39.06 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  45.16 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  39.39 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  43.33 
 
 
65 aa  42.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  39.06 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  40.32 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  46.55 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  46.55 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0944  putative ferredoxin  35.21 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  38.1 
 
 
65 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  37.5 
 
 
64 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0824  hypothetical protein  44.93 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  43.33 
 
 
64 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  39.06 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  36.36 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0705  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.11788  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  45.61 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  37.1 
 
 
64 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>