21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0620 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0620  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  165  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2729  protein of unknown function DUF1271  49.12 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295977  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  46.55 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  45 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  42.86 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.98 
 
 
68 aa  47  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  41.18 
 
 
73 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  45.61 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.64 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.84 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  43.33 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  39.68 
 
 
349 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  43.86 
 
 
65 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  43.33 
 
 
64 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.71 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  45 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  42.62 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.67 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1196  hypothetical protein  46.67 
 
 
73 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1871  NADH-quinone oxidoreductase chain G  38.46 
 
 
788 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>