More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1871 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1277  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  71.21 
 
 
791 aa  1087    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1871  NADH-quinone oxidoreductase chain G  100 
 
 
788 aa  1611    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0915  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  49.41 
 
 
721 aa  585  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.53 
 
 
913 aa  298  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.95 
 
 
903 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  32.66 
 
 
776 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  32.66 
 
 
776 aa  281  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  32.51 
 
 
776 aa  280  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  31.73 
 
 
777 aa  279  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  32.41 
 
 
776 aa  279  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  31.49 
 
 
777 aa  279  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  32.41 
 
 
776 aa  279  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  32.23 
 
 
776 aa  276  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.98 
 
 
823 aa  271  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  32.51 
 
 
776 aa  269  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  31.64 
 
 
771 aa  269  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  31.39 
 
 
694 aa  268  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  31.69 
 
 
686 aa  267  5e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0803  NADH dehydrogenase subunit G  31.26 
 
 
694 aa  267  7e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.727429  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  31 
 
 
689 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1280  NADH-quinone oxidoreductase chain G  32.64 
 
 
797 aa  263  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.47873 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  30.6 
 
 
777 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  30.91 
 
 
776 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  31.33 
 
 
685 aa  261  5.0000000000000005e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  30.77 
 
 
776 aa  260  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  30.77 
 
 
776 aa  260  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  30.77 
 
 
776 aa  260  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  30.77 
 
 
776 aa  260  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  30.77 
 
 
776 aa  260  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  30.77 
 
 
776 aa  260  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  30.9 
 
 
791 aa  258  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0545  NADH dehydrogenase subunit G  29.54 
 
 
862 aa  257  5e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.941021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  28.68 
 
 
777 aa  257  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4059  NADH dehydrogenase subunit G  31.1 
 
 
839 aa  257  7e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.14 
 
 
918 aa  256  9e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  29.73 
 
 
694 aa  256  9e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  30.76 
 
 
776 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  31.74 
 
 
799 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  31.01 
 
 
783 aa  255  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  30.82 
 
 
790 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  30.99 
 
 
795 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  30.38 
 
 
717 aa  254  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  30.43 
 
 
715 aa  255  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.64 
 
 
923 aa  254  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  30.46 
 
 
783 aa  254  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  30.58 
 
 
784 aa  254  6e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2053  NADH dehydrogenase subunit G  31.71 
 
 
693 aa  254  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328842  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  32.46 
 
 
689 aa  253  7e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3292  NADH dehydrogenase subunit G  31.07 
 
 
691 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.995096  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  29.17 
 
 
797 aa  251  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  30.43 
 
 
779 aa  251  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  30.65 
 
 
714 aa  251  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4132  NADH dehydrogenase subunit G  30.92 
 
 
693 aa  250  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.915862  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.43 
 
 
770 aa  250  8e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  29.76 
 
 
783 aa  249  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1267  NADH dehydrogenase subunit G  30.19 
 
 
693 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555052  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  30 
 
 
710 aa  249  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2580  NADH dehydrogenase subunit G  31.03 
 
 
691 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.105022  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4412  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.14 
 
 
815 aa  249  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  30.51 
 
 
797 aa  249  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  29.78 
 
 
839 aa  248  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  30.7 
 
 
670 aa  248  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  29.68 
 
 
783 aa  248  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  30.7 
 
 
683 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  30.22 
 
 
783 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  31.17 
 
 
669 aa  247  6e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2710  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.21 
 
 
884 aa  247  6e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  30.22 
 
 
721 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  30.82 
 
 
827 aa  246  8e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1028  NADH dehydrogenase subunit G  31.15 
 
 
693 aa  246  9e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2392  NADH dehydrogenase subunit G  30.96 
 
 
686 aa  246  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00398656  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6088  NADH dehydrogenase subunit G  32.94 
 
 
863 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.012959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1359  NADH dehydrogenase subunit G  30.29 
 
 
693 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113832  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  31 
 
 
716 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6676  NADH dehydrogenase subunit G  30.58 
 
 
815 aa  245  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  30.98 
 
 
719 aa  245  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  29.33 
 
 
682 aa  243  7e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  27.5 
 
 
808 aa  243  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  29.49 
 
 
787 aa  242  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1320  NADH dehydrogenase subunit G  30.12 
 
 
672 aa  242  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568369  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  28.94 
 
 
679 aa  242  2e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2879  NADH dehydrogenase subunit G  30.03 
 
 
691 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.644938  normal  0.120527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4396  NADH dehydrogenase subunit G  30.58 
 
 
693 aa  242  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  29.49 
 
 
787 aa  241  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07440  NADH dehydrogenase subunit G  30.86 
 
 
879 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0653934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  31.23 
 
 
829 aa  241  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.24 
 
 
771 aa  241  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  30.83 
 
 
680 aa  240  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.84 
 
 
771 aa  240  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0526  NADH dehydrogenase subunit G  34.22 
 
 
811 aa  240  9e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0544  NADH dehydrogenase subunit G  31.65 
 
 
835 aa  240  9e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242771  normal  0.39762 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  30.5 
 
 
791 aa  240  9e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1208  NADH dehydrogenase subunit G  28.92 
 
 
688 aa  239  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1013  NADH dehydrogenase subunit G  29.34 
 
 
688 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.772369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  36.29 
 
 
720 aa  239  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0896  NADH dehydrogenase subunit G  34.78 
 
 
693 aa  239  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1079  NADH dehydrogenase subunit G  29.94 
 
 
708 aa  239  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.697159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 
839 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.5 
 
 
798 aa  238  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4627  NADH dehydrogenase subunit G  31.16 
 
 
692 aa  237  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>