More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1409 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  72.14 
 
 
707 aa  989    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  71.91 
 
 
719 aa  964    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  72.21 
 
 
715 aa  1032    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  66.24 
 
 
776 aa  1001    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  65.68 
 
 
783 aa  1017    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  71.85 
 
 
710 aa  1018    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  66.24 
 
 
776 aa  1001    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  75.26 
 
 
770 aa  1145    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  66.24 
 
 
776 aa  1001    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  58.77 
 
 
777 aa  902    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  65.47 
 
 
776 aa  1007    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  65.9 
 
 
777 aa  1009    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  64.27 
 
 
791 aa  986    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  57.02 
 
 
784 aa  861    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  66.24 
 
 
776 aa  1001    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  45.23 
 
 
787 aa  679    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  60.2 
 
 
779 aa  894    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  46.54 
 
 
797 aa  686    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  50.44 
 
 
791 aa  721    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  65.73 
 
 
776 aa  1006    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  50 
 
 
700 aa  686    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  55.43 
 
 
809 aa  877    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  60.59 
 
 
771 aa  895    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  67.27 
 
 
776 aa  999    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  45.23 
 
 
787 aa  680    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  65.98 
 
 
776 aa  1008    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  64.09 
 
 
783 aa  979    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  66.24 
 
 
776 aa  1001    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  69.93 
 
 
721 aa  965    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  46.19 
 
 
795 aa  673    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  50.88 
 
 
808 aa  795    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  71.61 
 
 
717 aa  1017    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  100 
 
 
771 aa  1575    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  66.15 
 
 
777 aa  1023    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  66.24 
 
 
776 aa  1002    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  64.91 
 
 
790 aa  994    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  64.35 
 
 
783 aa  977    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  45.56 
 
 
798 aa  637    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  65.85 
 
 
776 aa  1004    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  66.58 
 
 
776 aa  1009    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  68.03 
 
 
714 aa  964    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  48.86 
 
 
797 aa  691    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  71.83 
 
 
720 aa  976    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  74.26 
 
 
716 aa  1004    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  66.58 
 
 
776 aa  1009    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  65.98 
 
 
776 aa  1007    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  65.64 
 
 
777 aa  1021    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  66.24 
 
 
776 aa  1001    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  60.98 
 
 
771 aa  931    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  43.55 
 
 
796 aa  629  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  41.87 
 
 
783 aa  620  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  41.79 
 
 
783 aa  615  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  43.04 
 
 
782 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  43.04 
 
 
782 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  42.65 
 
 
744 aa  569  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  41.78 
 
 
739 aa  530  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  41.64 
 
 
744 aa  528  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  40.99 
 
 
744 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.5 
 
 
797 aa  449  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  38.15 
 
 
686 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  38.91 
 
 
689 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  38.44 
 
 
689 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  38.69 
 
 
680 aa  413  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  38.44 
 
 
694 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  37.52 
 
 
685 aa  413  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  37.91 
 
 
682 aa  411  1e-113  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1267  NADH dehydrogenase subunit G  37.29 
 
 
693 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555052  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  36.69 
 
 
694 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1359  NADH dehydrogenase subunit G  36.69 
 
 
693 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113832  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  36.42 
 
 
669 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0803  NADH dehydrogenase subunit G  36.69 
 
 
694 aa  402  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.727429  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  35.98 
 
 
683 aa  402  9.999999999999999e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0896  NADH dehydrogenase subunit G  36.95 
 
 
693 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2580  NADH dehydrogenase subunit G  38.54 
 
 
691 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.105022  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  36.99 
 
 
679 aa  395  1e-108  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3292  NADH dehydrogenase subunit G  37.96 
 
 
691 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.995096  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2879  NADH dehydrogenase subunit G  37.89 
 
 
691 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.644938  normal  0.120527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1028  NADH dehydrogenase subunit G  37.31 
 
 
693 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2410  NADH dehydrogenase subunit G  36.59 
 
 
692 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  hitchhiker  0.00632886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4555  NADH dehydrogenase subunit G  34.91 
 
 
689 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0784  NADH dehydrogenase subunit G  36.36 
 
 
689 aa  388  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00939613  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  35.42 
 
 
670 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1361  NADH dehydrogenase subunit G  35.53 
 
 
699 aa  388  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587534  normal  0.089712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4132  NADH dehydrogenase subunit G  38.45 
 
 
693 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.915862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4627  NADH dehydrogenase subunit G  37.41 
 
 
692 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0421  NADH dehydrogenase subunit G  36.15 
 
 
683 aa  381  1e-104  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  34.98 
 
 
667 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1720  NADH dehydrogenase subunit G  37.19 
 
 
693 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2827  NADH dehydrogenase subunit G  37.1 
 
 
686 aa  381  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.655346  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1881  NADH dehydrogenase subunit G  37.11 
 
 
691 aa  378  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.296161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2053  NADH dehydrogenase subunit G  37.3 
 
 
693 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328842  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1182  NADH dehydrogenase subunit G  36.83 
 
 
673 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.577988  normal  0.579246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4396  NADH dehydrogenase subunit G  37.46 
 
 
693 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2521  NADH dehydrogenase subunit G  37.1 
 
 
654 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2214  NADH dehydrogenase subunit G  36.59 
 
 
691 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01310  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  35.79 
 
 
775 aa  368  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.754341  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1183  NADH dehydrogenase subunit G  35.48 
 
 
672 aa  368  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.551845  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85822  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 78K chain precursor, 5-prime end  34.74 
 
 
722 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.28905  normal  0.0501454 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04288  NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit G, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04370)  34.01 
 
 
738 aa  365  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.503379  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2000  NADH dehydrogenase subunit G  37.25 
 
 
671 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>