More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2559 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  46.54 
 
 		 771 aa  670    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  47.32 
 
 		 776 aa  688    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  45.68 
 
 		 777 aa  685    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  47.32 
 
 		 776 aa  686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  44.93 
 
 		 777 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  55.11 
 
 		 791 aa  856    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  46.87 
 
 		 783 aa  702    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  47.23 
 
 		 796 aa  717    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  48.06 
 
 		 787 aa  749    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  47.87 
 
 		 783 aa  699    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  47.42 
 
 		 714 aa  636    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  47.32 
 
 		 776 aa  688    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  47.53 
 
 		 783 aa  766    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  46.91 
 
 		 783 aa  756    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  45.32 
 
 		 777 aa  657    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  46.98 
 
 		 791 aa  699    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  49.06 
 
 		 784 aa  719    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  47.32 
 
 		 776 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 797 aa  1637    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  44.28 
 
 		 782 aa  647    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  47.32 
 
 		 776 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  46.81 
 
 		 776 aa  684    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  45.62 
 
 		 771 aa  688    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  47.13 
 
 		 776 aa  687    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  47.93 
 
 		 787 aa  747    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  44.14 
 
 		 771 aa  661    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  48.68 
 
 		 700 aa  702    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  46.39 
 
 		 779 aa  655    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  47.11 
 
 		 809 aa  736    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  48.03 
 
 		 776 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  49.62 
 
 		 798 aa  761    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  48.43 
 
 		 715 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  48.5 
 
 		 710 aa  640    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  47.45 
 
 		 776 aa  689    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  46.39 
 
 		 808 aa  726    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  48.91 
 
 		 717 aa  670    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  45.62 
 
 		 777 aa  686    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  47.32 
 
 		 776 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  49.5 
 
 		 795 aa  746    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  47.7 
 
 		 790 aa  704    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  47.3 
 
 		 783 aa  698    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  47.26 
 
 		 776 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  47.19 
 
 		 776 aa  682    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  52.3 
 
 		 797 aa  752    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  47.32 
 
 		 776 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  47.19 
 
 		 776 aa  685    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  47.19 
 
 		 776 aa  682    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  44.28 
 
 		 782 aa  647    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  45.79 
 
 		 770 aa  632  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  47.62 
 
 		 721 aa  626  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  45.87 
 
 		 707 aa  616  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  47.16 
 
 		 716 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  47.62 
 
 		 720 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  45.68 
 
 		 719 aa  586  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  42.68 
 
 		 744 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  40.81 
 
 		 744 aa  544  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  41.42 
 
 		 744 aa  541  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  41.39 
 
 		 739 aa  535  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.83 
 
 		 797 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  37.87 
 
 		 682 aa  431  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  40.3 
 
 		 686 aa  432  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1028  NADH dehydrogenase subunit G  39.5 
 
 		 693 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  38.83 
 
 		 694 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  39.06 
 
 		 694 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0803  NADH dehydrogenase subunit G  38.98 
 
 		 694 aa  421  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.727429  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  39.91 
 
 		 689 aa  422  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1359  NADH dehydrogenase subunit G  38.76 
 
 		 693 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  38.46 
 
 		 680 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  40 
 
 		 689 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1267  NADH dehydrogenase subunit G  38.48 
 
 		 693 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0896  NADH dehydrogenase subunit G  39.42 
 
 		 693 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  37.72 
 
 		 683 aa  413  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  36.65 
 
 		 685 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2580  NADH dehydrogenase subunit G  39.02 
 
 		 691 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.105022  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0784  NADH dehydrogenase subunit G  37.7 
 
 		 689 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00939613  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2214  NADH dehydrogenase subunit G  39.55 
 
 		 691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4627  NADH dehydrogenase subunit G  39.97 
 
 		 692 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2392  NADH dehydrogenase subunit G  36.86 
 
 		 686 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00398656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  38.53 
 
 		 667 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1881  NADH dehydrogenase subunit G  38.38 
 
 		 691 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.296161 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1720  NADH dehydrogenase subunit G  38.66 
 
 		 693 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2410  NADH dehydrogenase subunit G  37.13 
 
 		 692 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  hitchhiker  0.00632886 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2879  NADH dehydrogenase subunit G  38.07 
 
 		 691 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.644938  normal  0.120527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3292  NADH dehydrogenase subunit G  38.27 
 
 		 691 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.995096  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  35.77 
 
 		 679 aa  388  1e-106  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4132  NADH dehydrogenase subunit G  39.15 
 
 		 693 aa  389  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.915862  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2053  NADH dehydrogenase subunit G  38.66 
 
 		 693 aa  389  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1361  NADH dehydrogenase subunit G  36.76 
 
 		 699 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587534  normal  0.089712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1079  NADH dehydrogenase subunit G  37.56 
 
 		 708 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.697159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1013  NADH dehydrogenase subunit G  37.71 
 
 		 688 aa  382  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.772369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4555  NADH dehydrogenase subunit G  37.91 
 
 		 689 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1208  NADH dehydrogenase subunit G  37.71 
 
 		 688 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2924  NADH dehydrogenase subunit G  37.59 
 
 		 687 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0421  NADH dehydrogenase subunit G  36.52 
 
 		 683 aa  374  1e-102  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04288  NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit G, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04370)  45.61 
 
 		 738 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.503379  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01310  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  45.3 
 
 		 775 aa  372  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.754341  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4396  NADH dehydrogenase subunit G  38.05 
 
 		 693 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  46.57 
 
 		 669 aa  369  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0751  NADH dehydrogenase subunit G  45.02 
 
 		 660 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0442747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.04 
 
 		 913 aa  363  5.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>