More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2924 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0803  NADH dehydrogenase subunit G  66.81 
 
 		 694 aa  944    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.727429  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  54.29 
 
 		 682 aa  754    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  66.95 
 
 		 694 aa  947    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  58.09 
 
 		 686 aa  765    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  51.16 
 
 		 685 aa  676    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  66.52 
 
 		 694 aa  939    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1720  NADH dehydrogenase subunit G  68.39 
 
 		 693 aa  956    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0421  NADH dehydrogenase subunit G  51.97 
 
 		 683 aa  698    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1881  NADH dehydrogenase subunit G  68.23 
 
 		 691 aa  932    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.296161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2827  NADH dehydrogenase subunit G  60.98 
 
 		 686 aa  799    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.655346  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1182  NADH dehydrogenase subunit G  59.85 
 
 		 673 aa  775    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.577988  normal  0.579246 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2521  NADH dehydrogenase subunit G  60.63 
 
 		 654 aa  763    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3292  NADH dehydrogenase subunit G  67.25 
 
 		 691 aa  942    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.995096  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1320  NADH dehydrogenase subunit G  59.5 
 
 		 672 aa  789    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568369  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  59.68 
 
 		 689 aa  769    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4132  NADH dehydrogenase subunit G  69.88 
 
 		 693 aa  988    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.915862  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1079  NADH dehydrogenase subunit G  66.19 
 
 		 708 aa  917    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.697159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1359  NADH dehydrogenase subunit G  68.92 
 
 		 693 aa  976    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  55.73 
 
 		 689 aa  736    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2580  NADH dehydrogenase subunit G  68.08 
 
 		 691 aa  935    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.105022  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  51.87 
 
 		 669 aa  653    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  52.69 
 
 		 683 aa  719    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1183  NADH dehydrogenase subunit G  60.15 
 
 		 672 aa  811    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.551845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2241  NADH dehydrogenase subunit G  58.71 
 
 		 674 aa  778    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2410  NADH dehydrogenase subunit G  69.06 
 
 		 692 aa  925    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  hitchhiker  0.00632886 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0784  NADH dehydrogenase subunit G  64.62 
 
 		 689 aa  894    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00939613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4555  NADH dehydrogenase subunit G  66.76 
 
 		 689 aa  927    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  54.82 
 
 		 667 aa  701    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2879  NADH dehydrogenase subunit G  66.76 
 
 		 691 aa  925    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.644938  normal  0.120527 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2392  NADH dehydrogenase subunit G  79.13 
 
 		 686 aa  1102    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00398656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2214  NADH dehydrogenase subunit G  68.81 
 
 		 691 aa  942    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1208  NADH dehydrogenase subunit G  66.04 
 
 		 688 aa  920    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1013  NADH dehydrogenase subunit G  66.19 
 
 		 688 aa  918    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.772369 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0751  NADH dehydrogenase subunit G  59.44 
 
 		 660 aa  773    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0442747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  53.45 
 
 		 670 aa  668    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4396  NADH dehydrogenase subunit G  68.73 
 
 		 693 aa  959    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1028  NADH dehydrogenase subunit G  68.2 
 
 		 693 aa  956    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0896  NADH dehydrogenase subunit G  68.49 
 
 		 693 aa  942    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  63.02 
 
 		 680 aa  832    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1267  NADH dehydrogenase subunit G  68.49 
 
 		 693 aa  974    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1361  NADH dehydrogenase subunit G  58.31 
 
 		 699 aa  802    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587534  normal  0.089712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2053  NADH dehydrogenase subunit G  68.13 
 
 		 693 aa  940    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4627  NADH dehydrogenase subunit G  70.95 
 
 		 692 aa  988    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2000  NADH dehydrogenase subunit G  59.94 
 
 		 671 aa  768    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2924  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 687 aa  1391    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01310  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  48.64 
 
 		 775 aa  629  1e-179  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.754341  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  45.91 
 
 		 679 aa  625  1e-178  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04288  NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit G, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04370)  47.78 
 
 		 738 aa  623  1e-177  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.503379  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85822  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 78K chain precursor, 5-prime end  46.92 
 
 		 722 aa  598  1e-170  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.28905  normal  0.0501454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.28 
 
 		 797 aa  428  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  37.41 
 
 		 797 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.46 
 
 		 798 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  37.04 
 
 		 784 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  38.47 
 
 		 779 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  38.01 
 
 		 797 aa  382  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.15 
 
 		 782 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  38.15 
 
 		 782 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  37.69 
 
 		 783 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  35.96 
 
 		 783 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  35.85 
 
 		 783 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  37.04 
 
 		 700 aa  375  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  36.22 
 
 		 809 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  38.76 
 
 		 791 aa  375  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  35.55 
 
 		 777 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  36.01 
 
 		 777 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  36.66 
 
 		 783 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  35.25 
 
 		 777 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  36.94 
 
 		 776 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  36.94 
 
 		 776 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  36.94 
 
 		 776 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  36.94 
 
 		 776 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  36.94 
 
 		 776 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  36.31 
 
 		 783 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  37.4 
 
 		 776 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  36.94 
 
 		 776 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  36.94 
 
 		 776 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  35.84 
 
 		 790 aa  369  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  36.79 
 
 		 776 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  36.94 
 
 		 776 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  36.21 
 
 		 715 aa  364  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  35.11 
 
 		 710 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  38.01 
 
 		 795 aa  363  8e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  35.76 
 
 		 771 aa  361  3e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  35.27 
 
 		 707 aa  360  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  36.17 
 
 		 776 aa  360  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  36.63 
 
 		 776 aa  360  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  34.51 
 
 		 808 aa  359  9e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  35.79 
 
 		 717 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  34.88 
 
 		 791 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  38.79 
 
 		 744 aa  356  6.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  36.01 
 
 		 776 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  35.86 
 
 		 776 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  35.86 
 
 		 776 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  36.27 
 
 		 721 aa  354  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  35.66 
 
 		 787 aa  353  7e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  35.66 
 
 		 787 aa  353  8e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.25 
 
 		 771 aa  352  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  36.06 
 
 		 716 aa  350  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.4 
 
 		 770 aa  348  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.74 
 
 		 771 aa  346  8e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>