More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1885 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  69.76 
 
 		 776 aa  1086    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  45.58 
 
 		 795 aa  662    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  64.08 
 
 		 716 aa  879    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  92.59 
 
 		 783 aa  1479    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  44.88 
 
 		 787 aa  677    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 783 aa  1600    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  62.61 
 
 		 779 aa  917    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  69.76 
 
 		 776 aa  1086    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  44.57 
 
 		 783 aa  665    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  44.71 
 
 		 783 aa  664    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  69.63 
 
 		 776 aa  1083    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  60.46 
 
 		 777 aa  949    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  69.11 
 
 		 776 aa  1060    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  61.74 
 
 		 714 aa  874    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  78.29 
 
 		 791 aa  1242    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  56.73 
 
 		 784 aa  855    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  69.76 
 
 		 776 aa  1086    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  64.05 
 
 		 710 aa  898    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  51.39 
 
 		 791 aa  757    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  47.3 
 
 		 797 aa  712    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  69.24 
 
 		 776 aa  1062    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  68.33 
 
 		 776 aa  1059    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  49.86 
 
 		 700 aa  684    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  44.88 
 
 		 787 aa  678    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  57.65 
 
 		 809 aa  906    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  62.64 
 
 		 771 aa  968    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  69.24 
 
 		 776 aa  1070    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  64.09 
 
 		 770 aa  964    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  62.32 
 
 		 721 aa  864    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  67.87 
 
 		 777 aa  1070    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  50.88 
 
 		 808 aa  806    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  63.4 
 
 		 717 aa  912    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  67.48 
 
 		 777 aa  1060    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  69.76 
 
 		 776 aa  1086    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  46.36 
 
 		 798 aa  669    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  45.76 
 
 		 796 aa  670    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  77.39 
 
 		 790 aa  1228    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  97.7 
 
 		 783 aa  1508    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  62.84 
 
 		 771 aa  993    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  69.11 
 
 		 776 aa  1060    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  68.6 
 
 		 776 aa  1072    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  61.27 
 
 		 719 aa  862    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  48.86 
 
 		 797 aa  702    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  64.22 
 
 		 771 aa  976    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  63.67 
 
 		 715 aa  904    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  69.24 
 
 		 776 aa  1061    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  69.11 
 
 		 776 aa  1061    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  69.76 
 
 		 776 aa  1086    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  62.67 
 
 		 720 aa  858    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  68.12 
 
 		 777 aa  1067    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  69.76 
 
 		 776 aa  1086    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  63.25 
 
 		 707 aa  880    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  43.82 
 
 		 782 aa  623  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  43.82 
 
 		 782 aa  623  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  42.75 
 
 		 744 aa  582  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  40.8 
 
 		 739 aa  535  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  41.05 
 
 		 744 aa  531  1e-149  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  40.65 
 
 		 744 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  38.5 
 
 		 686 aa  433  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.03 
 
 		 797 aa  436  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  37.38 
 
 		 689 aa  431  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  39.52 
 
 		 689 aa  415  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1267  NADH dehydrogenase subunit G  37.3 
 
 		 693 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  34.76 
 
 		 683 aa  403  1e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  35.16 
 
 		 685 aa  401  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1359  NADH dehydrogenase subunit G  37.37 
 
 		 693 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  36.62 
 
 		 669 aa  399  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0896  NADH dehydrogenase subunit G  36.55 
 
 		 693 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  34.65 
 
 		 682 aa  394  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  36.8 
 
 		 694 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  34.76 
 
 		 680 aa  396  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3292  NADH dehydrogenase subunit G  36.87 
 
 		 691 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.995096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1028  NADH dehydrogenase subunit G  38.12 
 
 		 693 aa  396  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2580  NADH dehydrogenase subunit G  36.59 
 
 		 691 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.105022  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2879  NADH dehydrogenase subunit G  35.9 
 
 		 691 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.644938  normal  0.120527 
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  36.02 
 
 		 694 aa  389  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0803  NADH dehydrogenase subunit G  36.17 
 
 		 694 aa  389  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.727429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  36.54 
 
 		 667 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04288  NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit G, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04370)  36.88 
 
 		 738 aa  385  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.503379  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01310  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  33.78 
 
 		 775 aa  383  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.754341  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4555  NADH dehydrogenase subunit G  35.98 
 
 		 689 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0784  NADH dehydrogenase subunit G  36.51 
 
 		 689 aa  385  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00939613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1182  NADH dehydrogenase subunit G  37.36 
 
 		 673 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.577988  normal  0.579246 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2521  NADH dehydrogenase subunit G  37.32 
 
 		 654 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1720  NADH dehydrogenase subunit G  36.01 
 
 		 693 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2827  NADH dehydrogenase subunit G  36.97 
 
 		 686 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.655346  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  36.74 
 
 		 670 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  36.2 
 
 		 679 aa  374  1e-102  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2410  NADH dehydrogenase subunit G  35.89 
 
 		 692 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  hitchhiker  0.00632886 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1183  NADH dehydrogenase subunit G  34.99 
 
 		 672 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.551845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4627  NADH dehydrogenase subunit G  35.82 
 
 		 692 aa  372  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1361  NADH dehydrogenase subunit G  35.13 
 
 		 699 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587534  normal  0.089712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4132  NADH dehydrogenase subunit G  37.67 
 
 		 693 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.915862  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2241  NADH dehydrogenase subunit G  36.73 
 
 		 674 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0751  NADH dehydrogenase subunit G  34.97 
 
 		 660 aa  368  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0442747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0421  NADH dehydrogenase subunit G  34.27 
 
 		 683 aa  365  2e-99  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1881  NADH dehydrogenase subunit G  37.74 
 
 		 691 aa  365  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.296161 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2000  NADH dehydrogenase subunit G  37.72 
 
 		 671 aa  365  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85822  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 78K chain precursor, 5-prime end  34.56 
 
 		 722 aa  362  1e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.28905  normal  0.0501454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4396  NADH dehydrogenase subunit G  37.69 
 
 		 693 aa  361  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>