More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1148 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  54.06 
 
 		 777 aa  819    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  44.93 
 
 		 787 aa  670    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  44.93 
 
 		 787 aa  669    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  56.16 
 
 		 783 aa  843    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  58.28 
 
 		 710 aa  778    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  52.1 
 
 		 771 aa  756    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  54.67 
 
 		 776 aa  807    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  45.58 
 
 		 783 aa  687    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  45.83 
 
 		 783 aa  687    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  54.14 
 
 		 770 aa  795    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  54.83 
 
 		 777 aa  838    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  54.67 
 
 		 776 aa  807    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  55.6 
 
 		 791 aa  843    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 784 aa  1612    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  54.67 
 
 		 776 aa  807    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  51.27 
 
 		 771 aa  726    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  49.06 
 
 		 797 aa  719    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  52.42 
 
 		 791 aa  773    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  54.76 
 
 		 776 aa  832    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  55.29 
 
 		 776 aa  837    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  47.62 
 
 		 700 aa  674    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  54.67 
 
 		 776 aa  808    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  59.78 
 
 		 809 aa  956    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  54.67 
 
 		 776 aa  798    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  53.98 
 
 		 777 aa  816    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  57.22 
 
 		 779 aa  852    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  45.78 
 
 		 795 aa  660    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  58.33 
 
 		 716 aa  748    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  56.6 
 
 		 783 aa  839    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  55.43 
 
 		 721 aa  729    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  54.76 
 
 		 776 aa  826    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  57.26 
 
 		 715 aa  772    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  56.12 
 
 		 771 aa  840    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  52.55 
 
 		 808 aa  825    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  57.73 
 
 		 717 aa  784    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  53.93 
 
 		 777 aa  816    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  54.67 
 
 		 776 aa  807    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  55.17 
 
 		 719 aa  715    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  55.91 
 
 		 790 aa  840    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  54.67 
 
 		 776 aa  807    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  55.46 
 
 		 707 aa  740    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  47.29 
 
 		 796 aa  681    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  54.89 
 
 		 776 aa  828    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  55.28 
 
 		 714 aa  735    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  47.28 
 
 		 797 aa  668    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  48.63 
 
 		 798 aa  686    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  57.24 
 
 		 720 aa  743    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  56.02 
 
 		 776 aa  836    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  56.02 
 
 		 776 aa  836    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  56.98 
 
 		 783 aa  840    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  54.89 
 
 		 776 aa  828    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  54.67 
 
 		 776 aa  807    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  43.62 
 
 		 782 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  43.62 
 
 		 782 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  44.04 
 
 		 744 aa  589  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  42.69 
 
 		 739 aa  551  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  42.28 
 
 		 744 aa  550  1e-155  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  41.76 
 
 		 744 aa  546  1e-154  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.13 
 
 		 797 aa  458  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  38.4 
 
 		 689 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  41.18 
 
 		 689 aa  446  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  39.78 
 
 		 685 aa  444  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  37.31 
 
 		 686 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  39.44 
 
 		 680 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0803  NADH dehydrogenase subunit G  39.51 
 
 		 694 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.727429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  39.36 
 
 		 694 aa  422  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  36.55 
 
 		 683 aa  421  1e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  39.17 
 
 		 694 aa  422  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  37.35 
 
 		 682 aa  417  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0896  NADH dehydrogenase subunit G  37.98 
 
 		 693 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1267  NADH dehydrogenase subunit G  36.15 
 
 		 693 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1359  NADH dehydrogenase subunit G  36.11 
 
 		 693 aa  416  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3292  NADH dehydrogenase subunit G  37.97 
 
 		 691 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.995096  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04288  NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit G, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04370)  35.42 
 
 		 738 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.503379  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1881  NADH dehydrogenase subunit G  38.12 
 
 		 691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.296161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2580  NADH dehydrogenase subunit G  37.44 
 
 		 691 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.105022  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2053  NADH dehydrogenase subunit G  38.06 
 
 		 693 aa  405  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  36.31 
 
 		 679 aa  401  9.999999999999999e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2410  NADH dehydrogenase subunit G  37.99 
 
 		 692 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  hitchhiker  0.00632886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4555  NADH dehydrogenase subunit G  38.19 
 
 		 689 aa  402  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1028  NADH dehydrogenase subunit G  39.81 
 
 		 693 aa  402  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0421  NADH dehydrogenase subunit G  36.15 
 
 		 683 aa  396  1e-109  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4132  NADH dehydrogenase subunit G  38.19 
 
 		 693 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.915862  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2879  NADH dehydrogenase subunit G  37.69 
 
 		 691 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.644938  normal  0.120527 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2214  NADH dehydrogenase subunit G  38.33 
 
 		 691 aa  398  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0784  NADH dehydrogenase subunit G  37.12 
 
 		 689 aa  398  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00939613  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85822  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 78K chain precursor, 5-prime end  35.69 
 
 		 722 aa  394  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.28905  normal  0.0501454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4627  NADH dehydrogenase subunit G  38.44 
 
 		 692 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1182  NADH dehydrogenase subunit G  38.6 
 
 		 673 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.577988  normal  0.579246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1720  NADH dehydrogenase subunit G  37.93 
 
 		 693 aa  395  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2827  NADH dehydrogenase subunit G  38.66 
 
 		 686 aa  395  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.655346  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1361  NADH dehydrogenase subunit G  36.7 
 
 		 699 aa  392  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587534  normal  0.089712 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01310  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  34.82 
 
 		 775 aa  387  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.754341  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2521  NADH dehydrogenase subunit G  38.89 
 
 		 654 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1013  NADH dehydrogenase subunit G  37.77 
 
 		 688 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.772369 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  34.81 
 
 		 670 aa  388  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1079  NADH dehydrogenase subunit G  37.77 
 
 		 708 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.697159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1208  NADH dehydrogenase subunit G  37.93 
 
 		 688 aa  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  34.5 
 
 		 667 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2392  NADH dehydrogenase subunit G  37.52 
 
 		 686 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00398656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>