More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0751 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0896  NADH dehydrogenase subunit G  58.54 
 
 
693 aa  769    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2827  NADH dehydrogenase subunit G  55.82 
 
 
686 aa  677    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.655346  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1720  NADH dehydrogenase subunit G  59.27 
 
 
693 aa  787    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  52.65 
 
 
682 aa  671    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  62.19 
 
 
694 aa  816    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  51.7 
 
 
667 aa  639    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1079  NADH dehydrogenase subunit G  56.87 
 
 
708 aa  703    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.697159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1013  NADH dehydrogenase subunit G  55.46 
 
 
688 aa  697    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.772369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1267  NADH dehydrogenase subunit G  57.99 
 
 
693 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555052  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0421  NADH dehydrogenase subunit G  50.96 
 
 
683 aa  638    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1881  NADH dehydrogenase subunit G  56.73 
 
 
691 aa  753    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.296161 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2241  NADH dehydrogenase subunit G  79.36 
 
 
674 aa  1075    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  57.73 
 
 
680 aa  729    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1208  NADH dehydrogenase subunit G  56.62 
 
 
688 aa  705    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2521  NADH dehydrogenase subunit G  79.05 
 
 
654 aa  1060    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2053  NADH dehydrogenase subunit G  54.66 
 
 
693 aa  702    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328842  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0803  NADH dehydrogenase subunit G  62.04 
 
 
694 aa  813    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.727429  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  54.56 
 
 
689 aa  659    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4555  NADH dehydrogenase subunit G  58.62 
 
 
689 aa  773    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4132  NADH dehydrogenase subunit G  59.01 
 
 
693 aa  763    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.915862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2580  NADH dehydrogenase subunit G  58.2 
 
 
691 aa  759    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.105022  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0784  NADH dehydrogenase subunit G  57.82 
 
 
689 aa  766    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00939613  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  50.37 
 
 
683 aa  644    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1183  NADH dehydrogenase subunit G  73.4 
 
 
672 aa  1013    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.551845  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2410  NADH dehydrogenase subunit G  58.26 
 
 
692 aa  758    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  hitchhiker  0.00632886 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1182  NADH dehydrogenase subunit G  79.2 
 
 
673 aa  1089    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.577988  normal  0.579246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1320  NADH dehydrogenase subunit G  80.39 
 
 
672 aa  1098    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568369  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  52.05 
 
 
686 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2879  NADH dehydrogenase subunit G  58.14 
 
 
691 aa  763    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.644938  normal  0.120527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4396  NADH dehydrogenase subunit G  57.12 
 
 
693 aa  740    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2214  NADH dehydrogenase subunit G  57.45 
 
 
691 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  60.88 
 
 
694 aa  806    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0751  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 
660 aa  1343    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0442747  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1028  NADH dehydrogenase subunit G  60.49 
 
 
693 aa  782    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2924  NADH dehydrogenase subunit G  59 
 
 
687 aa  770    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2000  NADH dehydrogenase subunit G  78.84 
 
 
671 aa  1064    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4627  NADH dehydrogenase subunit G  59.65 
 
 
692 aa  773    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1361  NADH dehydrogenase subunit G  57.94 
 
 
699 aa  743    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587534  normal  0.089712 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2392  NADH dehydrogenase subunit G  58.54 
 
 
686 aa  750    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00398656  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3292  NADH dehydrogenase subunit G  57.91 
 
 
691 aa  760    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.995096  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1359  NADH dehydrogenase subunit G  58.27 
 
 
693 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113832  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  51.64 
 
 
670 aa  631  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  50.74 
 
 
669 aa  617  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  48.94 
 
 
689 aa  618  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  49.49 
 
 
685 aa  617  1e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04288  NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit G, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04370)  48.42 
 
 
738 aa  612  9.999999999999999e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.503379  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01310  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  46.88 
 
 
775 aa  592  1e-168  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.754341  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  45.53 
 
 
679 aa  592  1e-168  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85822  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 78K chain precursor, 5-prime end  46.28 
 
 
722 aa  570  1e-161  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.28905  normal  0.0501454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.66 
 
 
797 aa  402  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  38.16 
 
 
779 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.52 
 
 
798 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  37.19 
 
 
784 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  37.29 
 
 
791 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  39.63 
 
 
744 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  36.18 
 
 
715 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  37.52 
 
 
782 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  36.9 
 
 
777 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  36.4 
 
 
710 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  37.1 
 
 
809 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.52 
 
 
782 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  36.16 
 
 
808 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  36.91 
 
 
790 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  37.33 
 
 
791 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  35.64 
 
 
700 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  36.35 
 
 
777 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  35.54 
 
 
777 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  45.02 
 
 
797 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  43.84 
 
 
797 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  36.57 
 
 
783 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  37.36 
 
 
783 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  36.27 
 
 
783 aa  364  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  36.38 
 
 
771 aa  360  6e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  43.26 
 
 
783 aa  358  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  36.05 
 
 
777 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  43.02 
 
 
783 aa  357  3.9999999999999996e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  36.17 
 
 
776 aa  355  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  35.9 
 
 
714 aa  353  5e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  36.21 
 
 
776 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  36.93 
 
 
739 aa  353  5e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  36.71 
 
 
716 aa  352  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  36.06 
 
 
776 aa  352  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  35.91 
 
 
776 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  35.91 
 
 
776 aa  352  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  35.91 
 
 
776 aa  351  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  45.32 
 
 
795 aa  350  6e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  35.87 
 
 
776 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  35.87 
 
 
776 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  35.87 
 
 
776 aa  349  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  35.87 
 
 
776 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  38.47 
 
 
744 aa  350  7e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  35.87 
 
 
776 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  35.87 
 
 
776 aa  349  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  35.54 
 
 
776 aa  349  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  35.71 
 
 
776 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  37.8 
 
 
744 aa  347  4e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  36.17 
 
 
776 aa  347  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  35.35 
 
 
717 aa  346  7e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.82 
 
 
771 aa  345  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.1 
 
 
771 aa  341  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>