More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0915 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0915  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  100 
 
 
721 aa  1457    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1871  NADH-quinone oxidoreductase chain G  49.7 
 
 
788 aa  567  1e-160  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1277  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  47.63 
 
 
791 aa  538  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.47 
 
 
903 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.66 
 
 
923 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.29 
 
 
913 aa  326  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.86 
 
 
918 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  32.89 
 
 
689 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0803  NADH dehydrogenase subunit G  33.04 
 
 
694 aa  283  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.727429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  33.04 
 
 
694 aa  283  6.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  33.48 
 
 
694 aa  281  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  32.96 
 
 
689 aa  280  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1280  NADH-quinone oxidoreductase chain G  33.1 
 
 
797 aa  280  8e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.47873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  33 
 
 
827 aa  279  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2392  NADH dehydrogenase subunit G  33.03 
 
 
686 aa  278  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00398656  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1359  NADH dehydrogenase subunit G  31.95 
 
 
693 aa  278  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113832  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1267  NADH dehydrogenase subunit G  32.25 
 
 
693 aa  278  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555052  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0896  NADH dehydrogenase subunit G  32.25 
 
 
693 aa  276  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4132  NADH dehydrogenase subunit G  33.38 
 
 
693 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.915862  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0784  NADH dehydrogenase subunit G  32.59 
 
 
689 aa  275  3e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00939613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  30.88 
 
 
715 aa  275  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3292  NADH dehydrogenase subunit G  32.63 
 
 
691 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.995096  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  30.49 
 
 
710 aa  274  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4396  NADH dehydrogenase subunit G  32.73 
 
 
693 aa  272  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.77 
 
 
797 aa  272  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  33.81 
 
 
797 aa  272  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.46 
 
 
833 aa  270  7e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  32.26 
 
 
686 aa  270  8e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1720  NADH dehydrogenase subunit G  32.73 
 
 
693 aa  268  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6676  NADH dehydrogenase subunit G  37.74 
 
 
815 aa  268  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2053  NADH dehydrogenase subunit G  32.73 
 
 
693 aa  266  8e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328842  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  32.26 
 
 
797 aa  266  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1079  NADH dehydrogenase subunit G  32.37 
 
 
708 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.697159 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1028  NADH dehydrogenase subunit G  32.84 
 
 
693 aa  265  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.78 
 
 
823 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  30.36 
 
 
771 aa  264  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  30.36 
 
 
777 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  37.3 
 
 
839 aa  263  8e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  30.67 
 
 
776 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  30.67 
 
 
776 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  30.67 
 
 
776 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  30.67 
 
 
776 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  30.67 
 
 
776 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  30.67 
 
 
776 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  32.4 
 
 
680 aa  263  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6088  NADH dehydrogenase subunit G  37.13 
 
 
863 aa  263  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.012959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2924  NADH dehydrogenase subunit G  31.42 
 
 
687 aa  263  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  31.12 
 
 
777 aa  262  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  30.52 
 
 
776 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2879  NADH dehydrogenase subunit G  32.27 
 
 
691 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.644938  normal  0.120527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4059  NADH dehydrogenase subunit G  37.73 
 
 
839 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  29.88 
 
 
716 aa  262  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1208  NADH dehydrogenase subunit G  32.47 
 
 
688 aa  262  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1013  NADH dehydrogenase subunit G  31.57 
 
 
688 aa  261  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.772369 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  31.52 
 
 
685 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4552  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.27 
 
 
818 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  33.02 
 
 
670 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0590  molybdopterin oxidoreductase  32.13 
 
 
807 aa  260  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.726223  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  33.59 
 
 
667 aa  259  9e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.95 
 
 
801 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  30.69 
 
 
782 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  32.65 
 
 
795 aa  258  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.69 
 
 
782 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2580  NADH dehydrogenase subunit G  32.07 
 
 
691 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.105022  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  30.28 
 
 
683 aa  258  3e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.76 
 
 
788 aa  258  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  31.28 
 
 
776 aa  257  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  36.67 
 
 
839 aa  257  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4627  NADH dehydrogenase subunit G  32.63 
 
 
692 aa  256  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.02 
 
 
798 aa  256  8e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4555  NADH dehydrogenase subunit G  31.42 
 
 
689 aa  256  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  30.56 
 
 
682 aa  256  1.0000000000000001e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  36.19 
 
 
799 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4412  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.5 
 
 
815 aa  254  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  30.34 
 
 
776 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  36.72 
 
 
829 aa  254  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  30.32 
 
 
719 aa  254  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  32.22 
 
 
669 aa  254  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3920  molybdopterin oxidoreductase  30.32 
 
 
821 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.403816  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  30.76 
 
 
776 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3174  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.33 
 
 
777 aa  254  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2410  NADH dehydrogenase subunit G  31.56 
 
 
692 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  hitchhiker  0.00632886 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  30.19 
 
 
776 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  30.12 
 
 
720 aa  253  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  28.39 
 
 
717 aa  253  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  30.68 
 
 
776 aa  253  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  29.96 
 
 
776 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  30.39 
 
 
776 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5059  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.97 
 
 
830 aa  252  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697317  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  30.04 
 
 
721 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  29.18 
 
 
809 aa  250  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2827  NADH dehydrogenase subunit G  32.04 
 
 
686 aa  250  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.655346  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13172  NADH dehydrogenase subunit G  32.48 
 
 
806 aa  250  8e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  31.02 
 
 
779 aa  249  9e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2214  NADH dehydrogenase subunit G  31.26 
 
 
691 aa  249  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  29.81 
 
 
776 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0980  NADH dehydrogenase subunit G  36.6 
 
 
854 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1879  NADH dehydrogenase subunit G  36.12 
 
 
799 aa  249  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.780009  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0396  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.97 
 
 
799 aa  248  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4004  molybdopterin oxidoreductase  29.89 
 
 
821 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08061e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>