More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03220 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5059  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  61.03 
 
 
830 aa  907    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697317  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0273  NADH dehydrogenase subunit G  54.19 
 
 
830 aa  795    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1544  NADH dehydrogenase subunit G  59.85 
 
 
801 aa  854    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0475  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  55.34 
 
 
868 aa  797    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4552  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  61.24 
 
 
818 aa  909    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 
829 aa  1665    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0526  NADH dehydrogenase subunit G  54.73 
 
 
811 aa  800    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  58.52 
 
 
801 aa  870    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  61.61 
 
 
827 aa  917    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  59.93 
 
 
839 aa  897    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3174  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  57.27 
 
 
777 aa  796    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1879  NADH dehydrogenase subunit G  60.77 
 
 
799 aa  840    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.780009  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07440  NADH dehydrogenase subunit G  56.74 
 
 
879 aa  828    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0653934 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13172  NADH dehydrogenase subunit G  57.49 
 
 
806 aa  835    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4412  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  61.16 
 
 
815 aa  874    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0396  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  56.58 
 
 
799 aa  802    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1280  NADH-quinone oxidoreductase chain G  57.67 
 
 
797 aa  879    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.47873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0544  NADH dehydrogenase subunit G  58.75 
 
 
835 aa  918    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242771  normal  0.39762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6676  NADH dehydrogenase subunit G  71.81 
 
 
815 aa  1155    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  59.69 
 
 
799 aa  899    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  55.76 
 
 
839 aa  843    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0590  molybdopterin oxidoreductase  57.13 
 
 
807 aa  855    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.726223  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2710  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  58.17 
 
 
884 aa  855    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0980  NADH dehydrogenase subunit G  58.26 
 
 
854 aa  889    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1574  NADH dehydrogenase subunit G  60.07 
 
 
801 aa  857    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3223  NADH dehydrogenase subunit G  55.4 
 
 
820 aa  783    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0251183 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0545  NADH dehydrogenase subunit G  53.94 
 
 
862 aa  833    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.941021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4059  NADH dehydrogenase subunit G  60.17 
 
 
839 aa  914    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1598  NADH dehydrogenase subunit G  60.07 
 
 
801 aa  857    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6088  NADH dehydrogenase subunit G  60.84 
 
 
863 aa  890    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.012959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.49 
 
 
913 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.79 
 
 
823 aa  369  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.73 
 
 
903 aa  346  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.29 
 
 
918 aa  333  6e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.94 
 
 
833 aa  333  1e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.54 
 
 
923 aa  332  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  33.05 
 
 
782 aa  323  8e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.05 
 
 
782 aa  323  8e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  33.84 
 
 
795 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  32.06 
 
 
797 aa  313  5.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.16 
 
 
798 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  35.11 
 
 
791 aa  304  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  33.24 
 
 
850 aa  303  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  29.29 
 
 
783 aa  302  1e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.7 
 
 
788 aa  302  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.82 
 
 
797 aa  303  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  30.85 
 
 
744 aa  299  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  28.93 
 
 
783 aa  298  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  30.47 
 
 
787 aa  298  3e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  30.47 
 
 
787 aa  297  6e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  31.62 
 
 
790 aa  295  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  32.5 
 
 
797 aa  295  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  31.46 
 
 
700 aa  292  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  32.29 
 
 
791 aa  291  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  31.99 
 
 
783 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  32.27 
 
 
783 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  31.92 
 
 
771 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.13 
 
 
898 aa  285  4.0000000000000003e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  32.81 
 
 
776 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  31.88 
 
 
715 aa  282  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  32.05 
 
 
783 aa  281  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  30.74 
 
 
808 aa  281  5e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  30.94 
 
 
710 aa  280  9e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  36.29 
 
 
689 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  30.75 
 
 
777 aa  278  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.07 
 
 
771 aa  278  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  30.74 
 
 
744 aa  277  5e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  30.98 
 
 
744 aa  277  7e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  31.25 
 
 
721 aa  277  7e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  31.88 
 
 
707 aa  276  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  32.23 
 
 
776 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  33.19 
 
 
779 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  32.37 
 
 
776 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  31.45 
 
 
719 aa  275  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  30.92 
 
 
777 aa  275  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  33.38 
 
 
776 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  33.38 
 
 
776 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  32.95 
 
 
776 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  32.37 
 
 
776 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  32.37 
 
 
776 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  32.37 
 
 
776 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.25 
 
 
770 aa  274  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  32.37 
 
 
776 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  32.37 
 
 
776 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  32.37 
 
 
776 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  31.54 
 
 
777 aa  274  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  29 
 
 
899 aa  273  8.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  31.31 
 
 
739 aa  273  8.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  32.37 
 
 
716 aa  273  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  32.66 
 
 
776 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  32.81 
 
 
776 aa  272  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1361  NADH dehydrogenase subunit G  33.8 
 
 
699 aa  272  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587534  normal  0.089712 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  32.08 
 
 
682 aa  271  2.9999999999999997e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  29.03 
 
 
784 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0661  molybdopterin oxidoreductase  28.92 
 
 
808 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.69 
 
 
796 aa  271  4e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1267  NADH dehydrogenase subunit G  33.44 
 
 
693 aa  270  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555052  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  32.23 
 
 
776 aa  269  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.09 
 
 
893 aa  270  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  29.93 
 
 
717 aa  269  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>