More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3174 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6676  NADH dehydrogenase subunit G  58.89 
 
 		 815 aa  837    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1544  NADH dehydrogenase subunit G  65.86 
 
 		 801 aa  884    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5059  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  60.3 
 
 		 830 aa  831    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4412  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  61.31 
 
 		 815 aa  882    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1879  NADH dehydrogenase subunit G  62.37 
 
 		 799 aa  846    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.780009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  61.73 
 
 		 827 aa  884    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0545  NADH dehydrogenase subunit G  53.98 
 
 		 862 aa  785    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.941021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0526  NADH dehydrogenase subunit G  57.45 
 
 		 811 aa  781    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0590  molybdopterin oxidoreductase  59.92 
 
 		 807 aa  871    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.726223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13172  NADH dehydrogenase subunit G  63.02 
 
 		 806 aa  889    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4059  NADH dehydrogenase subunit G  58.38 
 
 		 839 aa  860    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1280  NADH-quinone oxidoreductase chain G  58.68 
 
 		 797 aa  865    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.47873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0980  NADH dehydrogenase subunit G  53.71 
 
 		 854 aa  758    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  63.02 
 
 		 799 aa  905    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0544  NADH dehydrogenase subunit G  60.58 
 
 		 835 aa  877    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242771  normal  0.39762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  60 
 
 		 801 aa  872    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4552  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  58.85 
 
 		 818 aa  840    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3223  NADH dehydrogenase subunit G  54.76 
 
 		 820 aa  749    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  58.25 
 
 		 839 aa  855    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1598  NADH dehydrogenase subunit G  65.86 
 
 		 801 aa  887    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  57.27 
 
 		 829 aa  838    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1574  NADH dehydrogenase subunit G  65.86 
 
 		 801 aa  887    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3174  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  100 
 
 		 777 aa  1527    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6088  NADH dehydrogenase subunit G  60.91 
 
 		 863 aa  840    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.012959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  57.81 
 
 		 839 aa  827    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2710  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  57.75 
 
 		 884 aa  790    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07440  NADH dehydrogenase subunit G  55.49 
 
 		 879 aa  773    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0653934 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0273  NADH dehydrogenase subunit G  59.48 
 
 		 830 aa  852    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0396  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  61.67 
 
 		 799 aa  850    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0475  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  53.8 
 
 		 868 aa  733    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.78 
 
 		 913 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.76 
 
 		 903 aa  359  9e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  35.34 
 
 		 782 aa  354  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.34 
 
 		 782 aa  354  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.39 
 
 		 918 aa  353  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.83 
 
 		 923 aa  351  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.59 
 
 		 823 aa  343  9e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  35 
 
 		 797 aa  334  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.06 
 
 		 797 aa  333  8e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  32.01 
 
 		 850 aa  312  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.92 
 
 		 788 aa  308  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  33.5 
 
 		 795 aa  306  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.03 
 
 		 833 aa  302  1e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  35.35 
 
 		 744 aa  301  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  35.7 
 
 		 744 aa  300  7e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  35.24 
 
 		 791 aa  297  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  31.38 
 
 		 899 aa  293  7e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  35.57 
 
 		 744 aa  292  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  28.89 
 
 		 783 aa  290  6e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.24 
 
 		 798 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  28.64 
 
 		 783 aa  287  5.999999999999999e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  32.13 
 
 		 808 aa  287  5.999999999999999e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1538  molybdopterin oxidoreductase  30.89 
 
 		 879 aa  287  5.999999999999999e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  36.3 
 
 		 689 aa  286  8e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  33.43 
 
 		 715 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  32.74 
 
 		 700 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  35.74 
 
 		 667 aa  284  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  34.64 
 
 		 680 aa  283  9e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  32.53 
 
 		 791 aa  283  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  32.08 
 
 		 844 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  34.52 
 
 		 790 aa  281  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  31.47 
 
 		 717 aa  280  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.66 
 
 		 898 aa  280  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.22 
 
 		 771 aa  278  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  29.48 
 
 		 787 aa  278  3e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  32.59 
 
 		 721 aa  278  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  29.61 
 
 		 787 aa  278  4e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  38.69 
 
 		 797 aa  276  8e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  30.07 
 
 		 826 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  32.86 
 
 		 777 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  35.62 
 
 		 739 aa  275  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  33.08 
 
 		 777 aa  273  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.87 
 
 		 893 aa  273  8.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  33.28 
 
 		 783 aa  273  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  33.58 
 
 		 783 aa  273  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  30.83 
 
 		 784 aa  273  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  32.67 
 
 		 707 aa  272  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.26 
 
 		 770 aa  272  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  32.63 
 
 		 686 aa  272  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  32.11 
 
 		 776 aa  271  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0751  NADH dehydrogenase subunit G  34.16 
 
 		 660 aa  270  8.999999999999999e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0442747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  38.18 
 
 		 716 aa  269  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1320  NADH dehydrogenase subunit G  33.92 
 
 		 672 aa  270  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568369  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  32.21 
 
 		 682 aa  268  2.9999999999999995e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  33.1 
 
 		 783 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  37.16 
 
 		 685 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  29.85 
 
 		 777 aa  268  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1182  NADH dehydrogenase subunit G  33.05 
 
 		 673 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.577988  normal  0.579246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  32.76 
 
 		 776 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  32.76 
 
 		 776 aa  268  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  32.33 
 
 		 776 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  37.1 
 
 		 720 aa  267  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  37.9 
 
 		 710 aa  267  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0915  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.33 
 
 		 721 aa  266  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.86 
 
 		 917 aa  266  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  32.04 
 
 		 776 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  32.29 
 
 		 694 aa  265  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  39.8 
 
 		 670 aa  265  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.99 
 
 		 771 aa  265  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  37.47 
 
 		 776 aa  264  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>