More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6676 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  57.88 
 
 		 839 aa  867    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4412  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  61.72 
 
 		 815 aa  914    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07440  NADH dehydrogenase subunit G  56.87 
 
 		 879 aa  806    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0653934 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1879  NADH dehydrogenase subunit G  60.57 
 
 		 799 aa  841    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.780009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3223  NADH dehydrogenase subunit G  54.4 
 
 		 820 aa  764    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251183 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13172  NADH dehydrogenase subunit G  60.68 
 
 		 806 aa  899    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5059  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  62.92 
 
 		 830 aa  927    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0526  NADH dehydrogenase subunit G  55.1 
 
 		 811 aa  802    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  63.69 
 
 		 827 aa  953    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6676  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 815 aa  1625    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  71.81 
 
 		 829 aa  1179    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1544  NADH dehydrogenase subunit G  61.92 
 
 		 801 aa  875    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0475  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  55.28 
 
 		 868 aa  787    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4059  NADH dehydrogenase subunit G  60.99 
 
 		 839 aa  944    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0590  molybdopterin oxidoreductase  60 
 
 		 807 aa  905    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.726223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  60.69 
 
 		 799 aa  904    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0396  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  58.59 
 
 		 799 aa  838    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  59.98 
 
 		 801 aa  921    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6088  NADH dehydrogenase subunit G  62.97 
 
 		 863 aa  913    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.012959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0544  NADH dehydrogenase subunit G  60.73 
 
 		 835 aa  922    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242771  normal  0.39762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0980  NADH dehydrogenase subunit G  62.83 
 
 		 854 aa  942    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0273  NADH dehydrogenase subunit G  57.38 
 
 		 830 aa  848    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1280  NADH-quinone oxidoreductase chain G  58.51 
 
 		 797 aa  894    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.47873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1574  NADH dehydrogenase subunit G  61.56 
 
 		 801 aa  875    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3174  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  59.19 
 
 		 777 aa  808    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2710  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  57.04 
 
 		 884 aa  845    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4552  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  62.81 
 
 		 818 aa  937    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  61.36 
 
 		 839 aa  934    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0545  NADH dehydrogenase subunit G  54.08 
 
 		 862 aa  823    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.941021 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1598  NADH dehydrogenase subunit G  61.56 
 
 		 801 aa  875    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.92 
 
 		 823 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.53 
 
 		 913 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.45 
 
 		 903 aa  348  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  34.03 
 
 		 797 aa  348  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.9 
 
 		 788 aa  340  5e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  32.14 
 
 		 850 aa  340  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.2 
 
 		 798 aa  333  6e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.24 
 
 		 833 aa  332  2e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.72 
 
 		 797 aa  329  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.92 
 
 		 782 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  33.92 
 
 		 782 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  34.74 
 
 		 795 aa  318  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  34.48 
 
 		 797 aa  316  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  34.14 
 
 		 791 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  41.03 
 
 		 923 aa  308  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  31.94 
 
 		 744 aa  306  7e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  41.36 
 
 		 918 aa  306  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  35.71 
 
 		 686 aa  305  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  32.95 
 
 		 700 aa  302  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  32.31 
 
 		 783 aa  299  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  31.48 
 
 		 777 aa  299  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  29.9 
 
 		 787 aa  299  1e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  29.9 
 
 		 787 aa  298  4e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  30.7 
 
 		 899 aa  296  9e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  32.31 
 
 		 783 aa  296  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  36.06 
 
 		 689 aa  296  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1361  NADH dehydrogenase subunit G  35.25 
 
 		 699 aa  296  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587534  normal  0.089712 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  33.18 
 
 		 682 aa  295  2e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  32.37 
 
 		 808 aa  295  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1267  NADH dehydrogenase subunit G  35.43 
 
 		 693 aa  293  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555052  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  30.09 
 
 		 844 aa  291  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1359  NADH dehydrogenase subunit G  34.8 
 
 		 693 aa  291  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  35.03 
 
 		 680 aa  290  9e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4627  NADH dehydrogenase subunit G  36.32 
 
 		 692 aa  289  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  32.8 
 
 		 707 aa  288  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  34.93 
 
 		 689 aa  288  4e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1028  NADH dehydrogenase subunit G  34.03 
 
 		 693 aa  287  5.999999999999999e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 		 721 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  31.78 
 
 		 790 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  34.34 
 
 		 776 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  34.34 
 
 		 776 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  34.34 
 
 		 776 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  34.34 
 
 		 776 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  34.34 
 
 		 776 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  34.34 
 
 		 776 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3292  NADH dehydrogenase subunit G  32.32 
 
 		 691 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.995096  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  31.72 
 
 		 744 aa  284  6.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.84 
 
 		 796 aa  283  6.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  34.34 
 
 		 776 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  33.28 
 
 		 776 aa  283  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  33.09 
 
 		 791 aa  282  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  35.08 
 
 		 667 aa  283  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  32.7 
 
 		 783 aa  283  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  33.95 
 
 		 670 aa  283  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  31.33 
 
 		 717 aa  282  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  33.23 
 
 		 744 aa  282  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  30.54 
 
 		 771 aa  282  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.71 
 
 		 770 aa  281  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1881  NADH dehydrogenase subunit G  34.8 
 
 		 691 aa  281  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.296161 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  32.55 
 
 		 739 aa  281  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2214  NADH dehydrogenase subunit G  34.29 
 
 		 691 aa  280  8e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  31.83 
 
 		 714 aa  280  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  35.08 
 
 		 779 aa  280  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  33.04 
 
 		 783 aa  280  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  34.39 
 
 		 669 aa  280  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  34.39 
 
 		 685 aa  280  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  32.59 
 
 		 783 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.31 
 
 		 898 aa  278  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0784  NADH dehydrogenase subunit G  31.99 
 
 		 689 aa  279  2e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00939613  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  34.33 
 
 		 694 aa  278  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>