More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4552 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3223  NADH dehydrogenase subunit G  57.92 
 
 		 820 aa  794    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1544  NADH dehydrogenase subunit G  64.44 
 
 		 801 aa  913    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6676  NADH dehydrogenase subunit G  62.81 
 
 		 815 aa  943    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0526  NADH dehydrogenase subunit G  57.33 
 
 		 811 aa  814    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4412  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  64.41 
 
 		 815 aa  926    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2710  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  58.02 
 
 		 884 aa  843    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0273  NADH dehydrogenase subunit G  61.25 
 
 		 830 aa  879    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5059  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  62.06 
 
 		 830 aa  900    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  64.49 
 
 		 827 aa  949    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1280  NADH-quinone oxidoreductase chain G  60.75 
 
 		 797 aa  929    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.47873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  61.77 
 
 		 801 aa  910    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3174  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  59.97 
 
 		 777 aa  821    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4059  NADH dehydrogenase subunit G  61.67 
 
 		 839 aa  940    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0475  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  57.41 
 
 		 868 aa  812    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  61.7 
 
 		 839 aa  934    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  60.65 
 
 		 839 aa  922    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0590  molybdopterin oxidoreductase  60.47 
 
 		 807 aa  902    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.726223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0544  NADH dehydrogenase subunit G  63.8 
 
 		 835 aa  959    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242771  normal  0.39762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6088  NADH dehydrogenase subunit G  62.48 
 
 		 863 aa  906    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.012959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  64.78 
 
 		 799 aa  952    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  61.24 
 
 		 829 aa  931    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07440  NADH dehydrogenase subunit G  57.85 
 
 		 879 aa  832    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0653934 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0545  NADH dehydrogenase subunit G  53.65 
 
 		 862 aa  829    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.941021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1574  NADH dehydrogenase subunit G  64.77 
 
 		 801 aa  918    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1598  NADH dehydrogenase subunit G  64.77 
 
 		 801 aa  918    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1879  NADH dehydrogenase subunit G  63.66 
 
 		 799 aa  879    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.780009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0396  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  63.98 
 
 		 799 aa  908    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4552  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  100 
 
 		 818 aa  1614    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13172  NADH dehydrogenase subunit G  63.43 
 
 		 806 aa  946    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0980  NADH dehydrogenase subunit G  58.3 
 
 		 854 aa  852    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.78 
 
 		 913 aa  385  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.79 
 
 		 903 aa  357  5e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.19 
 
 		 823 aa  346  8e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.92 
 
 		 833 aa  342  2e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.61 
 
 		 923 aa  339  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.09 
 
 		 782 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  33.09 
 
 		 782 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.06 
 
 		 788 aa  335  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  31.45 
 
 		 850 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  42.32 
 
 		 918 aa  330  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  29.66 
 
 		 899 aa  328  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  32.88 
 
 		 797 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.38 
 
 		 797 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.71 
 
 		 798 aa  312  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1538  molybdopterin oxidoreductase  29.89 
 
 		 879 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.13 
 
 		 898 aa  302  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  29.89 
 
 		 844 aa  296  9e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  33.19 
 
 		 791 aa  296  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  31.32 
 
 		 744 aa  290  6e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  28.5 
 
 		 783 aa  290  8e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  33.13 
 
 		 795 aa  289  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  32.76 
 
 		 797 aa  288  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  28.07 
 
 		 783 aa  287  5.999999999999999e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  43.98 
 
 		 689 aa  284  5.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  28.64 
 
 		 826 aa  282  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  32.29 
 
 		 715 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  34.29 
 
 		 739 aa  281  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0661  molybdopterin oxidoreductase  29.99 
 
 		 808 aa  281  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1361  NADH dehydrogenase subunit G  34.01 
 
 		 699 aa  281  5e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587534  normal  0.089712 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  31.85 
 
 		 783 aa  280  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.93 
 
 		 893 aa  280  6e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  29.62 
 
 		 831 aa  280  7e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  32.79 
 
 		 808 aa  280  7e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  32.2 
 
 		 717 aa  280  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  32.31 
 
 		 721 aa  280  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.57 
 
 		 893 aa  280  8e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  31.56 
 
 		 791 aa  280  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  34.77 
 
 		 686 aa  279  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  32.57 
 
 		 694 aa  279  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  31.09 
 
 		 784 aa  278  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.09 
 
 		 900 aa  277  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  29.81 
 
 		 787 aa  276  8e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  32.29 
 
 		 783 aa  276  9e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  32.12 
 
 		 694 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  29.81 
 
 		 787 aa  275  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0803  NADH dehydrogenase subunit G  32.12 
 
 		 694 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.727429  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0915  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.57 
 
 		 721 aa  275  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  30.69 
 
 		 822 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  30.89 
 
 		 783 aa  276  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  33.72 
 
 		 680 aa  275  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.63 
 
 		 796 aa  275  3e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  30.18 
 
 		 700 aa  274  5.000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2214  NADH dehydrogenase subunit G  34.76 
 
 		 691 aa  273  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  33.09 
 
 		 790 aa  273  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  31.11 
 
 		 682 aa  272  1e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  31.42 
 
 		 710 aa  273  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  31.2 
 
 		 714 aa  273  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1267  NADH dehydrogenase subunit G  32.65 
 
 		 693 aa  272  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  29.62 
 
 		 822 aa  272  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  31.51 
 
 		 776 aa  272  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3132  molybdopterin oxidoreductase  26.63 
 
 		 815 aa  269  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4627  NADH dehydrogenase subunit G  34.99 
 
 		 692 aa  269  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3292  NADH dehydrogenase subunit G  31.12 
 
 		 691 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.995096  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  32.39 
 
 		 776 aa  269  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2580  NADH dehydrogenase subunit G  33.86 
 
 		 691 aa  269  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.105022  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2879  NADH dehydrogenase subunit G  33.75 
 
 		 691 aa  269  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.644938  normal  0.120527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1028  NADH dehydrogenase subunit G  32.18 
 
 		 693 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  33.33 
 
 		 685 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  31.14 
 
 		 744 aa  268  4e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  31.95 
 
 		 776 aa  267  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>