More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0369 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  100 
 
 
833 aa  1637    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.81 
 
 
913 aa  364  5.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1280  NADH-quinone oxidoreductase chain G  38.33 
 
 
797 aa  363  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.47873 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4059  NADH dehydrogenase subunit G  37.46 
 
 
839 aa  345  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  37.24 
 
 
839 aa  343  5.999999999999999e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  38.15 
 
 
827 aa  343  7e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0544  NADH dehydrogenase subunit G  38.02 
 
 
835 aa  342  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242771  normal  0.39762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  34.08 
 
 
829 aa  340  8e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6088  NADH dehydrogenase subunit G  40.41 
 
 
863 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.012959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  38.54 
 
 
799 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5059  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.78 
 
 
830 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697317  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.23 
 
 
801 aa  337  5e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4552  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.35 
 
 
818 aa  337  5.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6676  NADH dehydrogenase subunit G  36.08 
 
 
815 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0590  molybdopterin oxidoreductase  35.17 
 
 
807 aa  332  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.726223  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  36.28 
 
 
839 aa  327  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13172  NADH dehydrogenase subunit G  36.91 
 
 
806 aa  321  3e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.73 
 
 
823 aa  320  5e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.54 
 
 
797 aa  317  6e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1544  NADH dehydrogenase subunit G  37.74 
 
 
801 aa  317  8e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.86 
 
 
918 aa  316  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.09 
 
 
923 aa  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1598  NADH dehydrogenase subunit G  36.61 
 
 
801 aa  313  9e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1574  NADH dehydrogenase subunit G  36.61 
 
 
801 aa  313  9e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1879  NADH dehydrogenase subunit G  42.11 
 
 
799 aa  312  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.780009  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.68 
 
 
903 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0396  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  42.63 
 
 
799 aa  311  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0980  NADH dehydrogenase subunit G  39.37 
 
 
854 aa  310  6.999999999999999e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0273  NADH dehydrogenase subunit G  42.62 
 
 
830 aa  310  9e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4412  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.87 
 
 
815 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0526  NADH dehydrogenase subunit G  35.16 
 
 
811 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  34.84 
 
 
689 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  34.16 
 
 
795 aa  301  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2710  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.51 
 
 
884 aa  300  5e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.61 
 
 
782 aa  298  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  32.61 
 
 
782 aa  298  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  31.56 
 
 
714 aa  297  5e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  34.05 
 
 
776 aa  295  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3174  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.05 
 
 
777 aa  295  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  34.05 
 
 
776 aa  295  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  34.05 
 
 
776 aa  295  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  34.05 
 
 
776 aa  295  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  34.05 
 
 
776 aa  295  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  34.05 
 
 
776 aa  295  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  34.05 
 
 
776 aa  295  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  31.63 
 
 
721 aa  294  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0545  NADH dehydrogenase subunit G  37.55 
 
 
862 aa  292  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.941021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  32.25 
 
 
771 aa  291  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07440  NADH dehydrogenase subunit G  39.3 
 
 
879 aa  289  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0653934 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  30.92 
 
 
717 aa  289  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.65 
 
 
771 aa  288  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  30.55 
 
 
809 aa  288  4e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  33.54 
 
 
776 aa  287  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  33.08 
 
 
776 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  30.83 
 
 
797 aa  284  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  31.27 
 
 
715 aa  284  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  39.95 
 
 
669 aa  283  8.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  31.54 
 
 
777 aa  283  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0475  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.55 
 
 
868 aa  282  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  31.68 
 
 
707 aa  282  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  31.3 
 
 
777 aa  281  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  31.22 
 
 
797 aa  281  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  29.51 
 
 
700 aa  281  4e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  34.21 
 
 
642 aa  281  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.05 
 
 
771 aa  280  8e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  30.77 
 
 
720 aa  280  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3223  NADH dehydrogenase subunit G  36.29 
 
 
820 aa  280  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0251183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 
677 aa  278  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0915  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.46 
 
 
721 aa  278  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  32.77 
 
 
776 aa  277  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  32.77 
 
 
776 aa  277  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  30 
 
 
779 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  31.84 
 
 
685 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  31.49 
 
 
777 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  30.59 
 
 
682 aa  275  3e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  29.2 
 
 
783 aa  275  3e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  29.77 
 
 
808 aa  275  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  32.62 
 
 
776 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  30.8 
 
 
710 aa  275  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  32.31 
 
 
776 aa  275  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  28.42 
 
 
783 aa  274  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  38.31 
 
 
783 aa  274  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  32.74 
 
 
850 aa  274  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  38.31 
 
 
783 aa  273  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  38.63 
 
 
776 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  31.35 
 
 
783 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  32.15 
 
 
776 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  31.35 
 
 
790 aa  271  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  37.68 
 
 
719 aa  270  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.6 
 
 
770 aa  270  5.9999999999999995e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  30.9 
 
 
683 aa  269  1e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  31.03 
 
 
791 aa  269  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  30.28 
 
 
787 aa  267  5.999999999999999e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  30.37 
 
 
777 aa  266  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  32.5 
 
 
689 aa  266  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  30.28 
 
 
787 aa  266  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2879  NADH dehydrogenase subunit G  32.2 
 
 
691 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.644938  normal  0.120527 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.16 
 
 
798 aa  266  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  37.11 
 
 
716 aa  266  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  30.43 
 
 
784 aa  265  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>