More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0159 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  85.76 
 
 		 677 aa  1089    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0157  NADH dehydrogenase subunit G  58.44 
 
 		 648 aa  742    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.735826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 642 aa  1309    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  58.75 
 
 		 648 aa  747    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0326  NADH dehydrogenase subunit G  69.06 
 
 		 631 aa  924    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  46.62 
 
 		 798 aa  543  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1954  NADH dehydrogenase subunit G  45.65 
 
 		 818 aa  517  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1122  NADH dehydrogenase subunit G  40.25 
 
 		 909 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.741047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3608  NADH dehydrogenase subunit G  39.97 
 
 		 904 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0967194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3202  NADH dehydrogenase subunit G  39.6 
 
 		 905 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119939  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3370  NADH dehydrogenase I, G subunit  39.44 
 
 		 905 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1868  NADH dehydrogenase subunit G  40.03 
 
 		 904 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.052963 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02208  NADH dehydrogenase subunit G  38.79 
 
 		 910 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2827  NADH dehydrogenase subunit G  38.63 
 
 		 910 aa  401  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0965571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4124  NADH dehydrogenase subunit G  39.88 
 
 		 904 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1018  NADH dehydrogenase subunit G  38.58 
 
 		 942 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181039  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02168  hypothetical protein  38.79 
 
 		 910 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2417  NADH dehydrogenase subunit G  38.63 
 
 		 902 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58498  normal  0.233551 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1374  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.63 
 
 		 908 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00828707  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2659  NADH dehydrogenase subunit G  38.63 
 
 		 908 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1369  NADH dehydrogenase subunit G  38.63 
 
 		 908 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852491  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2437  NADH dehydrogenase subunit G  38.63 
 
 		 908 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3696  NADH dehydrogenase subunit G  39.88 
 
 		 904 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2432  NADH dehydrogenase subunit G  38.63 
 
 		 908 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2576  NADH dehydrogenase subunit G  38.63 
 
 		 908 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3422  NADH dehydrogenase subunit G  38.63 
 
 		 908 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2545  NADH dehydrogenase subunit G  38.6 
 
 		 908 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0568157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1741  NADH dehydrogenase subunit G  39.88 
 
 		 904 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0398307  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1399  NADH dehydrogenase subunit G  38.7 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2462  NADH dehydrogenase subunit G  38.47 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289624  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2551  NADH dehydrogenase subunit G  38.47 
 
 		 908 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0113562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2669  NADH dehydrogenase subunit G  38.47 
 
 		 908 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2507  NADH dehydrogenase subunit G  38.47 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2562  NADH dehydrogenase subunit G  38.47 
 
 		 908 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1811  NADH dehydrogenase subunit G  37.52 
 
 		 914 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.821067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3820  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.57 
 
 		 899 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1459  NADH dehydrogenase subunit G  36.99 
 
 		 914 aa  389  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1497  NADH dehydrogenase subunit G  37.79 
 
 		 908 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.838261  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1565  NADH dehydrogenase subunit G  36.99 
 
 		 914 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28490  NADH dehydrogenase subunit G  38.16 
 
 		 903 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3303  NADH dehydrogenase subunit G  36.69 
 
 		 915 aa  385  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113952  normal  0.988711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2767  NADH dehydrogenase subunit G  37.64 
 
 		 908 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2564  NADH dehydrogenase subunit G  37.31 
 
 		 905 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  39.01 
 
 		 871 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  39.59 
 
 		 872 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0713  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.7 
 
 		 896 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0376  NADH dehydrogenase subunit G  35.97 
 
 		 909 aa  375  1e-102  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0886279  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3127  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.75 
 
 		 920 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29940  NADH dehydrogenase subunit G  37.64 
 
 		 905 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4738  NADH dehydrogenase subunit G  40.06 
 
 		 877 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656278  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  37.13 
 
 		 929 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1016  NADH dehydrogenase subunit G  46.38 
 
 		 909 aa  362  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1115  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.4 
 
 		 902 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1352  NADH dehydrogenase subunit G  38.83 
 
 		 872 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.236873 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  44.79 
 
 		 1039 aa  344  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  44.55 
 
 		 1030 aa  342  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1694  NADH dehydrogenase subunit G  45.01 
 
 		 1010 aa  339  9.999999999999999e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1694  NADH dehydrogenase subunit G  46.8 
 
 		 860 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0130655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1741  NADH dehydrogenase subunit G  45.13 
 
 		 860 aa  321  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.217192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0105  NADH dehydrogenase subunit G  45.13 
 
 		 860 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.831692  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2865  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.49 
 
 		 947 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119541  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  33.5 
 
 		 669 aa  279  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  29.6 
 
 		 714 aa  273  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  30.36 
 
 		 777 aa  273  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  31.06 
 
 		 782 aa  272  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.06 
 
 		 782 aa  272  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.21 
 
 		 833 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  30.04 
 
 		 777 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.11 
 
 		 771 aa  270  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  29.86 
 
 		 776 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  29.86 
 
 		 776 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  29.86 
 
 		 776 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  29.86 
 
 		 776 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  29.86 
 
 		 776 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  29.86 
 
 		 776 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  29.82 
 
 		 776 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  32.26 
 
 		 670 aa  266  8e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  33.9 
 
 		 667 aa  266  8e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  29.84 
 
 		 715 aa  266  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  29.32 
 
 		 717 aa  266  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.43 
 
 		 771 aa  264  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.41 
 
 		 797 aa  262  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  29.51 
 
 		 797 aa  261  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  32.01 
 
 		 689 aa  260  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.36 
 
 		 923 aa  259  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  30.08 
 
 		 776 aa  259  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.39 
 
 		 770 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  29.41 
 
 		 776 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  29.5 
 
 		 779 aa  258  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  28.78 
 
 		 808 aa  257  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  29.68 
 
 		 791 aa  257  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  29.61 
 
 		 710 aa  256  9e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  33.41 
 
 		 809 aa  256  9e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  31.15 
 
 		 795 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  28.25 
 
 		 720 aa  254  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  33.17 
 
 		 777 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  29.29 
 
 		 783 aa  252  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  34.47 
 
 		 707 aa  250  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  28.34 
 
 		 771 aa  249  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  28.53 
 
 		 721 aa  249  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>