More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1016 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3303  NADH dehydrogenase subunit G  63.38 
 
 		 915 aa  1175    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113952  normal  0.988711 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02208  NADH dehydrogenase subunit G  63.33 
 
 		 910 aa  1217    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1374  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  63.22 
 
 		 908 aa  1214    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00828707  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4124  NADH dehydrogenase subunit G  63.77 
 
 		 904 aa  1175    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  52.12 
 
 		 929 aa  897    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2562  NADH dehydrogenase subunit G  63.33 
 
 		 908 aa  1199    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2507  NADH dehydrogenase subunit G  63.22 
 
 		 908 aa  1197    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28490  NADH dehydrogenase subunit G  65.42 
 
 		 903 aa  1185    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45196  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1016  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 909 aa  1884    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3370  NADH dehydrogenase I, G subunit  63.77 
 
 		 905 aa  1190    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1399  NADH dehydrogenase subunit G  64.65 
 
 		 908 aa  1206    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4738  NADH dehydrogenase subunit G  43.79 
 
 		 877 aa  685    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3202  NADH dehydrogenase subunit G  64.1 
 
 		 905 aa  1195    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119939  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  57.78 
 
 		 1030 aa  637    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2551  NADH dehydrogenase subunit G  63.33 
 
 		 908 aa  1199    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0113562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1741  NADH dehydrogenase subunit G  63.77 
 
 		 904 aa  1174    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0398307  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2576  NADH dehydrogenase subunit G  63.11 
 
 		 908 aa  1215    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2462  NADH dehydrogenase subunit G  63.22 
 
 		 908 aa  1196    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289624  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1122  NADH dehydrogenase subunit G  52.6 
 
 		 909 aa  903    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.741047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3608  NADH dehydrogenase subunit G  62.89 
 
 		 904 aa  1185    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0967194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2432  NADH dehydrogenase subunit G  63.22 
 
 		 908 aa  1213    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2437  NADH dehydrogenase subunit G  63.22 
 
 		 908 aa  1214    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1018  NADH dehydrogenase subunit G  49.78 
 
 		 942 aa  882    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181039  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1369  NADH dehydrogenase subunit G  63.22 
 
 		 908 aa  1214    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852491  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3422  NADH dehydrogenase subunit G  63.22 
 
 		 908 aa  1213    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2417  NADH dehydrogenase subunit G  64.72 
 
 		 902 aa  1192    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58498  normal  0.233551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3696  NADH dehydrogenase subunit G  63.44 
 
 		 904 aa  1169    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3820  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  47.34 
 
 		 899 aa  815    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2545  NADH dehydrogenase subunit G  65.31 
 
 		 908 aa  1212    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0568157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2564  NADH dehydrogenase subunit G  65.31 
 
 		 905 aa  1209    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  43.85 
 
 		 871 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02168  hypothetical protein  63.33 
 
 		 910 aa  1217    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2767  NADH dehydrogenase subunit G  63.77 
 
 		 908 aa  1187    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1497  NADH dehydrogenase subunit G  63.88 
 
 		 908 aa  1197    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.838261  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  44.27 
 
 		 872 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3127  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  58.2 
 
 		 920 aa  1055    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1694  NADH dehydrogenase subunit G  45.38 
 
 		 1010 aa  813    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  57.3 
 
 		 1039 aa  635    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2669  NADH dehydrogenase subunit G  63.33 
 
 		 908 aa  1199    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0376  NADH dehydrogenase subunit G  57.93 
 
 		 909 aa  1091    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0886279  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0713  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  50.24 
 
 		 896 aa  798    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1868  NADH dehydrogenase subunit G  63.55 
 
 		 904 aa  1165    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.052963 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1459  NADH dehydrogenase subunit G  65.03 
 
 		 914 aa  1229    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2827  NADH dehydrogenase subunit G  62.75 
 
 		 910 aa  1207    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0965571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1565  NADH dehydrogenase subunit G  65.14 
 
 		 914 aa  1230    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2659  NADH dehydrogenase subunit G  63.11 
 
 		 908 aa  1214    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29940  NADH dehydrogenase subunit G  65.53 
 
 		 905 aa  1206    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1115  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  50.62 
 
 		 902 aa  811    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1811  NADH dehydrogenase subunit G  64.92 
 
 		 914 aa  1227    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.821067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1352  NADH dehydrogenase subunit G  42.12 
 
 		 872 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.236873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2865  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.18 
 
 		 947 aa  610  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119541  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0105  NADH dehydrogenase subunit G  42.6 
 
 		 860 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.831692  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1694  NADH dehydrogenase subunit G  42.51 
 
 		 860 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0130655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1741  NADH dehydrogenase subunit G  42.37 
 
 		 860 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.217192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  38.27 
 
 		 798 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  37.36 
 
 		 677 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0326  NADH dehydrogenase subunit G  36.79 
 
 		 631 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1954  NADH dehydrogenase subunit G  38.77 
 
 		 818 aa  386  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  34.76 
 
 		 648 aa  365  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  46.38 
 
 		 642 aa  362  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0157  NADH dehydrogenase subunit G  33.38 
 
 		 648 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.735826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.77 
 
 		 797 aa  267  5.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  28.08 
 
 		 777 aa  244  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  28.49 
 
 		 777 aa  242  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  28.84 
 
 		 784 aa  241  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  27.53 
 
 		 808 aa  237  8e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  28.68 
 
 		 822 aa  237  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  29.15 
 
 		 809 aa  237  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  28.65 
 
 		 715 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  27.35 
 
 		 777 aa  234  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  28.43 
 
 		 782 aa  233  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.43 
 
 		 782 aa  233  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  28.65 
 
 		 779 aa  233  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  27.53 
 
 		 822 aa  232  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  27.79 
 
 		 710 aa  231  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  28.63 
 
 		 707 aa  231  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  26.64 
 
 		 797 aa  230  7e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  27.51 
 
 		 844 aa  230  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  27.86 
 
 		 831 aa  230  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  27.48 
 
 		 791 aa  227  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  27.13 
 
 		 776 aa  227  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  27.13 
 
 		 776 aa  227  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  28.03 
 
 		 795 aa  227  8e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  26.66 
 
 		 683 aa  227  1e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  27.13 
 
 		 776 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  26.98 
 
 		 776 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  27.98 
 
 		 783 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0915  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.55 
 
 		 721 aa  224  4.9999999999999996e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  28.01 
 
 		 771 aa  224  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4238  molybdopterin oxidoreductase  29.04 
 
 		 828 aa  223  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  26.71 
 
 		 783 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  27.87 
 
 		 776 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  27.06 
 
 		 776 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  27.98 
 
 		 783 aa  223  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  27.71 
 
 		 787 aa  223  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  26.02 
 
 		 714 aa  222  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  26.42 
 
 		 776 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  26.42 
 
 		 776 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  26.42 
 
 		 776 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  26.42 
 
 		 776 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>