More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1122 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2507  NADH dehydrogenase subunit G  50.55 
 
 		 908 aa  925    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02208  NADH dehydrogenase subunit G  50.44 
 
 		 910 aa  941    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1374  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  50.33 
 
 		 908 aa  939    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00828707  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1399  NADH dehydrogenase subunit G  50.17 
 
 		 908 aa  922    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2865  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.82 
 
 		 947 aa  650    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119541  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4124  NADH dehydrogenase subunit G  53.73 
 
 		 904 aa  956    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  55.78 
 
 		 929 aa  983    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0713  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  49.23 
 
 		 896 aa  868    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3422  NADH dehydrogenase subunit G  50.33 
 
 		 908 aa  937    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4738  NADH dehydrogenase subunit G  45.69 
 
 		 877 aa  714    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656278  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02168  hypothetical protein  50.44 
 
 		 910 aa  941    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1016  NADH dehydrogenase subunit G  52.44 
 
 		 909 aa  922    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3370  NADH dehydrogenase I, G subunit  53.34 
 
 		 905 aa  969    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2437  NADH dehydrogenase subunit G  50.33 
 
 		 908 aa  939    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2576  NADH dehydrogenase subunit G  50.22 
 
 		 908 aa  937    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3202  NADH dehydrogenase subunit G  53.9 
 
 		 905 aa  973    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119939  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2545  NADH dehydrogenase subunit G  50.28 
 
 		 908 aa  924    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0568157  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1122  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 909 aa  1888    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.741047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3608  NADH dehydrogenase subunit G  52.86 
 
 		 904 aa  966    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0967194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28490  NADH dehydrogenase subunit G  55.12 
 
 		 903 aa  981    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1811  NADH dehydrogenase subunit G  51.77 
 
 		 914 aa  956    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.821067 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2551  NADH dehydrogenase subunit G  50.66 
 
 		 908 aa  928    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0113562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3820  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  49.83 
 
 		 899 aa  905    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1018  NADH dehydrogenase subunit G  58.77 
 
 		 942 aa  1142    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181039  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1115  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  52.24 
 
 		 902 aa  905    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1497  NADH dehydrogenase subunit G  50.61 
 
 		 908 aa  937    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.838261  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1352  NADH dehydrogenase subunit G  45.35 
 
 		 872 aa  681    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.236873 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2659  NADH dehydrogenase subunit G  50.33 
 
 		 908 aa  937    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322834  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1565  NADH dehydrogenase subunit G  51.77 
 
 		 914 aa  956    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3303  NADH dehydrogenase subunit G  51.27 
 
 		 915 aa  922    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113952  normal  0.988711 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1369  NADH dehydrogenase subunit G  50.33 
 
 		 908 aa  939    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852491  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  46.51 
 
 		 871 aa  675    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  45.58 
 
 		 872 aa  720    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2669  NADH dehydrogenase subunit G  50.66 
 
 		 908 aa  927    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3127  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  51.51 
 
 		 920 aa  907    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2767  NADH dehydrogenase subunit G  50.28 
 
 		 908 aa  919    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124088  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0376  NADH dehydrogenase subunit G  47.85 
 
 		 909 aa  860    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0886279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3696  NADH dehydrogenase subunit G  53.5 
 
 		 904 aa  955    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1741  NADH dehydrogenase subunit G  53.62 
 
 		 904 aa  956    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0398307  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2432  NADH dehydrogenase subunit G  50.33 
 
 		 908 aa  940    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2562  NADH dehydrogenase subunit G  50.66 
 
 		 908 aa  927    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2462  NADH dehydrogenase subunit G  50.77 
 
 		 908 aa  929    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289624  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2827  NADH dehydrogenase subunit G  50.66 
 
 		 910 aa  942    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0965571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1868  NADH dehydrogenase subunit G  53.5 
 
 		 904 aa  952    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.052963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2564  NADH dehydrogenase subunit G  53.71 
 
 		 905 aa  982    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29940  NADH dehydrogenase subunit G  53.82 
 
 		 905 aa  974    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2417  NADH dehydrogenase subunit G  54.71 
 
 		 902 aa  975    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58498  normal  0.233551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1459  NADH dehydrogenase subunit G  51.77 
 
 		 914 aa  956    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0105  NADH dehydrogenase subunit G  42.55 
 
 		 860 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.831692  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1694  NADH dehydrogenase subunit G  41.87 
 
 		 860 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0130655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  49.63 
 
 		 1030 aa  535  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1694  NADH dehydrogenase subunit G  48.43 
 
 		 1010 aa  531  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  49.45 
 
 		 1039 aa  531  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1741  NADH dehydrogenase subunit G  50.74 
 
 		 860 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.217192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  40.25 
 
 		 642 aa  426  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0326  NADH dehydrogenase subunit G  39.76 
 
 		 631 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  40.67 
 
 		 677 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1954  NADH dehydrogenase subunit G  38.83 
 
 		 818 aa  402  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  38.33 
 
 		 798 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  36.11 
 
 		 648 aa  365  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0157  NADH dehydrogenase subunit G  45.45 
 
 		 648 aa  352  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.735826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.42 
 
 		 797 aa  271  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  28.87 
 
 		 717 aa  252  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  28.97 
 
 		 776 aa  250  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  29.11 
 
 		 776 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  29.11 
 
 		 776 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  28.88 
 
 		 776 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  29.21 
 
 		 776 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  28.88 
 
 		 776 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  27.71 
 
 		 923 aa  248  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  28.19 
 
 		 797 aa  248  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  29.54 
 
 		 689 aa  247  6e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  28.51 
 
 		 809 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  29.12 
 
 		 777 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  29.91 
 
 		 776 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  29.76 
 
 		 776 aa  244  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  29.76 
 
 		 776 aa  244  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  29.76 
 
 		 776 aa  244  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  29.76 
 
 		 776 aa  244  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  29.76 
 
 		 776 aa  244  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  29.76 
 
 		 776 aa  244  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  29.78 
 
 		 783 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  28.3 
 
 		 714 aa  241  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  28.24 
 
 		 686 aa  240  8e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  30.37 
 
 		 783 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  29.82 
 
 		 777 aa  239  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  28.12 
 
 		 776 aa  240  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  29.52 
 
 		 776 aa  239  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  28.86 
 
 		 808 aa  239  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  29.64 
 
 		 779 aa  238  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  28.59 
 
 		 795 aa  238  5.0000000000000005e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  29.66 
 
 		 783 aa  237  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  29.26 
 
 		 715 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  29.43 
 
 		 791 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.06 
 
 		 913 aa  234  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.12 
 
 		 782 aa  233  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  28.12 
 
 		 782 aa  233  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  28.25 
 
 		 710 aa  231  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  27.04 
 
 		 771 aa  229  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  27.6 
 
 		 721 aa  228  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>