More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0175 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  58.41 
 
 		 677 aa  715    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 648 aa  1327    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  58.75 
 
 		 642 aa  747    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0326  NADH dehydrogenase subunit G  56.54 
 
 		 631 aa  720    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0157  NADH dehydrogenase subunit G  93.98 
 
 		 648 aa  1252    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.735826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1954  NADH dehydrogenase subunit G  42.86 
 
 		 818 aa  478  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  43.6 
 
 		 798 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02208  NADH dehydrogenase subunit G  37.84 
 
 		 910 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02168  hypothetical protein  37.84 
 
 		 910 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1122  NADH dehydrogenase subunit G  36.11 
 
 		 909 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.741047  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2437  NADH dehydrogenase subunit G  37.84 
 
 		 908 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2576  NADH dehydrogenase subunit G  37.99 
 
 		 908 aa  365  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1016  NADH dehydrogenase subunit G  34.76 
 
 		 909 aa  365  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1374  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.69 
 
 		 908 aa  365  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00828707  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2659  NADH dehydrogenase subunit G  37.69 
 
 		 908 aa  365  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3422  NADH dehydrogenase subunit G  37.69 
 
 		 908 aa  365  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2432  NADH dehydrogenase subunit G  37.69 
 
 		 908 aa  365  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1369  NADH dehydrogenase subunit G  37.69 
 
 		 908 aa  365  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852491  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2827  NADH dehydrogenase subunit G  36.38 
 
 		 910 aa  362  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0965571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1565  NADH dehydrogenase subunit G  36.18 
 
 		 914 aa  362  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1459  NADH dehydrogenase subunit G  36.18 
 
 		 914 aa  362  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1811  NADH dehydrogenase subunit G  36.03 
 
 		 914 aa  360  4e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.821067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1497  NADH dehydrogenase subunit G  35.06 
 
 		 908 aa  357  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.838261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2545  NADH dehydrogenase subunit G  36.73 
 
 		 908 aa  355  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0568157  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2417  NADH dehydrogenase subunit G  36.01 
 
 		 902 aa  353  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58498  normal  0.233551 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2767  NADH dehydrogenase subunit G  34.63 
 
 		 908 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1741  NADH dehydrogenase subunit G  47.33 
 
 		 904 aa  349  8e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0398307  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4124  NADH dehydrogenase subunit G  47.33 
 
 		 904 aa  349  9e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3696  NADH dehydrogenase subunit G  47.33 
 
 		 904 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3820  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  43.56 
 
 		 899 aa  347  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1868  NADH dehydrogenase subunit G  47.09 
 
 		 904 aa  347  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.052963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  36.61 
 
 		 871 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3303  NADH dehydrogenase subunit G  46.4 
 
 		 915 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113952  normal  0.988711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3202  NADH dehydrogenase subunit G  46.78 
 
 		 905 aa  343  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119939  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3370  NADH dehydrogenase I, G subunit  46.78 
 
 		 905 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28490  NADH dehydrogenase subunit G  45.52 
 
 		 903 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4738  NADH dehydrogenase subunit G  36.83 
 
 		 877 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3608  NADH dehydrogenase subunit G  45.64 
 
 		 904 aa  339  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0967194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2669  NADH dehydrogenase subunit G  46.88 
 
 		 908 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2507  NADH dehydrogenase subunit G  46.88 
 
 		 908 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2462  NADH dehydrogenase subunit G  46.88 
 
 		 908 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289624  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2562  NADH dehydrogenase subunit G  46.88 
 
 		 908 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2551  NADH dehydrogenase subunit G  46.88 
 
 		 908 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0113562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1018  NADH dehydrogenase subunit G  34.17 
 
 		 942 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181039  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0376  NADH dehydrogenase subunit G  45.89 
 
 		 909 aa  338  1.9999999999999998e-91  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0886279  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1399  NADH dehydrogenase subunit G  45.89 
 
 		 908 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29940  NADH dehydrogenase subunit G  45.05 
 
 		 905 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2564  NADH dehydrogenase subunit G  45.05 
 
 		 905 aa  334  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  34.99 
 
 		 929 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3127  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  43.75 
 
 		 920 aa  322  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0713  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  44.19 
 
 		 896 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1115  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  48.81 
 
 		 902 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  42.34 
 
 		 1030 aa  311  2e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  41.77 
 
 		 1039 aa  310  5e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1694  NADH dehydrogenase subunit G  41.71 
 
 		 1010 aa  304  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  42.54 
 
 		 872 aa  302  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2865  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.77 
 
 		 947 aa  300  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119541  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1352  NADH dehydrogenase subunit G  41.4 
 
 		 872 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.236873 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1694  NADH dehydrogenase subunit G  43.01 
 
 		 860 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0130655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1741  NADH dehydrogenase subunit G  41.97 
 
 		 860 aa  294  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.217192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0105  NADH dehydrogenase subunit G  41.97 
 
 		 860 aa  293  6e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.831692  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.44 
 
 		 782 aa  270  8e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  30.44 
 
 		 782 aa  270  8e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.12 
 
 		 797 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.16 
 
 		 771 aa  258  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  31.46 
 
 		 777 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  29.06 
 
 		 783 aa  249  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.05 
 
 		 833 aa  248  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  31.14 
 
 		 777 aa  248  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  30.39 
 
 		 771 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  38.73 
 
 		 776 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  38.73 
 
 		 776 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  38.73 
 
 		 776 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  38.73 
 
 		 776 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  38.73 
 
 		 776 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  30.62 
 
 		 670 aa  244  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  38.73 
 
 		 776 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  38.73 
 
 		 776 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  38.05 
 
 		 809 aa  244  5e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  30.66 
 
 		 667 aa  243  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  37.06 
 
 		 783 aa  243  9e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  27.57 
 
 		 683 aa  240  5.999999999999999e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  29.97 
 
 		 791 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  29.17 
 
 		 700 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  31.62 
 
 		 689 aa  239  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1182  NADH dehydrogenase subunit G  32.94 
 
 		 673 aa  238  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.577988  normal  0.579246 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  37.1 
 
 		 777 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  29.93 
 
 		 669 aa  237  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.31 
 
 		 770 aa  236  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  38.24 
 
 		 720 aa  236  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  37.39 
 
 		 776 aa  236  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  36.77 
 
 		 776 aa  236  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  36.77 
 
 		 776 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  36.77 
 
 		 776 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  36.77 
 
 		 776 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  38.44 
 
 		 776 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  36.49 
 
 		 776 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  36.49 
 
 		 776 aa  234  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  27.26 
 
 		 808 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  37.01 
 
 		 784 aa  233  9e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>