More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0209 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 798 aa  1620    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1954  NADH dehydrogenase subunit G  44.4 
 
 		 818 aa  619  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0326  NADH dehydrogenase subunit G  48.6 
 
 		 631 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  48.02 
 
 		 677 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  47.04 
 
 		 642 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0157  NADH dehydrogenase subunit G  43.99 
 
 		 648 aa  491  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.735826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  44.05 
 
 		 648 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1016  NADH dehydrogenase subunit G  38.32 
 
 		 909 aa  420  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2417  NADH dehydrogenase subunit G  39.41 
 
 		 902 aa  422  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58498  normal  0.233551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3370  NADH dehydrogenase I, G subunit  40.9 
 
 		 905 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3202  NADH dehydrogenase subunit G  40.43 
 
 		 905 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119939  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3608  NADH dehydrogenase subunit G  39.66 
 
 		 904 aa  415  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0967194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3820  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.63 
 
 		 899 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102025  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02208  NADH dehydrogenase subunit G  38.11 
 
 		 910 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2564  NADH dehydrogenase subunit G  39.5 
 
 		 905 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28490  NADH dehydrogenase subunit G  39.78 
 
 		 903 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02168  hypothetical protein  38.11 
 
 		 910 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4124  NADH dehydrogenase subunit G  39.38 
 
 		 904 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3422  NADH dehydrogenase subunit G  37.96 
 
 		 908 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2659  NADH dehydrogenase subunit G  37.96 
 
 		 908 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322834  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2432  NADH dehydrogenase subunit G  37.96 
 
 		 908 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1868  NADH dehydrogenase subunit G  39.19 
 
 		 904 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.052963 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2576  NADH dehydrogenase subunit G  37.96 
 
 		 908 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2437  NADH dehydrogenase subunit G  37.96 
 
 		 908 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1741  NADH dehydrogenase subunit G  39.38 
 
 		 904 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0398307  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2545  NADH dehydrogenase subunit G  38.58 
 
 		 908 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0568157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3303  NADH dehydrogenase subunit G  38.66 
 
 		 915 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113952  normal  0.988711 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1374  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.96 
 
 		 908 aa  406  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00828707  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  39.61 
 
 		 929 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2827  NADH dehydrogenase subunit G  37.52 
 
 		 910 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0965571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1122  NADH dehydrogenase subunit G  38.29 
 
 		 909 aa  405  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.741047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1369  NADH dehydrogenase subunit G  37.96 
 
 		 908 aa  406  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852491  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1018  NADH dehydrogenase subunit G  38.37 
 
 		 942 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181039  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3696  NADH dehydrogenase subunit G  39.22 
 
 		 904 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0376  NADH dehydrogenase subunit G  37.95 
 
 		 909 aa  403  1e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0886279  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29940  NADH dehydrogenase subunit G  39.81 
 
 		 905 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3127  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.36 
 
 		 920 aa  402  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1565  NADH dehydrogenase subunit G  37.64 
 
 		 914 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1459  NADH dehydrogenase subunit G  37.5 
 
 		 914 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2669  NADH dehydrogenase subunit G  37.67 
 
 		 908 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1399  NADH dehydrogenase subunit G  38.54 
 
 		 908 aa  398  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1811  NADH dehydrogenase subunit G  37.48 
 
 		 914 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.821067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1497  NADH dehydrogenase subunit G  38.63 
 
 		 908 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.838261  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2562  NADH dehydrogenase subunit G  37.67 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0713  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.02 
 
 		 896 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2462  NADH dehydrogenase subunit G  37.67 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289624  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2507  NADH dehydrogenase subunit G  37.67 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2551  NADH dehydrogenase subunit G  37.67 
 
 		 908 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0113562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2767  NADH dehydrogenase subunit G  38.24 
 
 		 908 aa  389  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  39.5 
 
 		 872 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  35.67 
 
 		 871 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1115  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.07 
 
 		 902 aa  376  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4738  NADH dehydrogenase subunit G  39.31 
 
 		 877 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656278  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2865  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.97 
 
 		 947 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119541  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  45.72 
 
 		 1039 aa  366  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  45.97 
 
 		 1030 aa  365  1e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1694  NADH dehydrogenase subunit G  46.21 
 
 		 1010 aa  358  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1352  NADH dehydrogenase subunit G  39.31 
 
 		 872 aa  353  7e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.236873 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1694  NADH dehydrogenase subunit G  46.29 
 
 		 860 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0130655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0105  NADH dehydrogenase subunit G  45.01 
 
 		 860 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.831692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1741  NADH dehydrogenase subunit G  44.5 
 
 		 860 aa  320  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.217192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.05 
 
 		 797 aa  303  7.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  29.21 
 
 		 795 aa  290  7e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  27.55 
 
 		 831 aa  287  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.77 
 
 		 782 aa  287  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  31.77 
 
 		 782 aa  287  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.6 
 
 		 913 aa  286  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  28.91 
 
 		 809 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  26.9 
 
 		 844 aa  282  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  27.33 
 
 		 797 aa  282  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  30.51 
 
 		 808 aa  281  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  31.03 
 
 		 783 aa  278  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  31.02 
 
 		 771 aa  278  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  31.25 
 
 		 783 aa  277  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  31.57 
 
 		 783 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  29.21 
 
 		 744 aa  275  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  29.07 
 
 		 822 aa  274  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  28.52 
 
 		 822 aa  274  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.28 
 
 		 898 aa  274  6e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  31.1 
 
 		 791 aa  273  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  30.62 
 
 		 790 aa  272  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  30.74 
 
 		 777 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  28.12 
 
 		 787 aa  271  4e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3639  molybdopterin oxidoreductase  27.21 
 
 		 843 aa  271  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.424964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  27.12 
 
 		 826 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.97 
 
 		 903 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  30.74 
 
 		 777 aa  270  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  30.52 
 
 		 739 aa  270  8e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  27.97 
 
 		 787 aa  270  8.999999999999999e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  27.71 
 
 		 899 aa  268  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.71 
 
 		 771 aa  268  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.13 
 
 		 771 aa  268  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  31.18 
 
 		 776 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  31.18 
 
 		 776 aa  266  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  31.18 
 
 		 776 aa  266  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  27.92 
 
 		 783 aa  266  8e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  31.18 
 
 		 776 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  31.18 
 
 		 776 aa  266  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  31.18 
 
 		 776 aa  266  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.44 
 
 		 823 aa  266  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>