More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0157 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  58.25 
 
 		 677 aa  717    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  58.44 
 
 		 642 aa  742    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  93.98 
 
 		 648 aa  1252    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0326  NADH dehydrogenase subunit G  56.88 
 
 		 631 aa  723    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0157  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 648 aa  1325    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.735826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1954  NADH dehydrogenase subunit G  43.16 
 
 		 818 aa  485  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  43.53 
 
 		 798 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02208  NADH dehydrogenase subunit G  37.99 
 
 		 910 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2437  NADH dehydrogenase subunit G  37.99 
 
 		 908 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02168  hypothetical protein  37.99 
 
 		 910 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2827  NADH dehydrogenase subunit G  36.99 
 
 		 910 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0965571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1497  NADH dehydrogenase subunit G  35.24 
 
 		 908 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.838261  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2659  NADH dehydrogenase subunit G  37.84 
 
 		 908 aa  368  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1374  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.84 
 
 		 908 aa  369  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00828707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3422  NADH dehydrogenase subunit G  37.84 
 
 		 908 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2432  NADH dehydrogenase subunit G  37.84 
 
 		 908 aa  368  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2545  NADH dehydrogenase subunit G  36.66 
 
 		 908 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0568157  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1369  NADH dehydrogenase subunit G  37.84 
 
 		 908 aa  369  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852491  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2576  NADH dehydrogenase subunit G  37.69 
 
 		 908 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1399  NADH dehydrogenase subunit G  36.02 
 
 		 908 aa  364  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2669  NADH dehydrogenase subunit G  36.99 
 
 		 908 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3303  NADH dehydrogenase subunit G  36.06 
 
 		 915 aa  363  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113952  normal  0.988711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2462  NADH dehydrogenase subunit G  36.99 
 
 		 908 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289624  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2507  NADH dehydrogenase subunit G  36.99 
 
 		 908 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2562  NADH dehydrogenase subunit G  36.99 
 
 		 908 aa  363  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2551  NADH dehydrogenase subunit G  36.99 
 
 		 908 aa  363  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0113562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1565  NADH dehydrogenase subunit G  36.64 
 
 		 914 aa  363  7.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1459  NADH dehydrogenase subunit G  36.64 
 
 		 914 aa  362  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1811  NADH dehydrogenase subunit G  36.18 
 
 		 914 aa  361  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.821067 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2767  NADH dehydrogenase subunit G  34.67 
 
 		 908 aa  361  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124088  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1016  NADH dehydrogenase subunit G  33.38 
 
 		 909 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1122  NADH dehydrogenase subunit G  45.45 
 
 		 909 aa  352  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.741047  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1741  NADH dehydrogenase subunit G  46.6 
 
 		 904 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0398307  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4124  NADH dehydrogenase subunit G  46.6 
 
 		 904 aa  347  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3696  NADH dehydrogenase subunit G  46.6 
 
 		 904 aa  346  7e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  36.41 
 
 		 871 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3820  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  43.96 
 
 		 899 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1868  NADH dehydrogenase subunit G  46.36 
 
 		 904 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.052963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2417  NADH dehydrogenase subunit G  47.03 
 
 		 902 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58498  normal  0.233551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28490  NADH dehydrogenase subunit G  45.52 
 
 		 903 aa  340  7e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3202  NADH dehydrogenase subunit G  46.04 
 
 		 905 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119939  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3608  NADH dehydrogenase subunit G  45.14 
 
 		 904 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0967194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0376  NADH dehydrogenase subunit G  45.14 
 
 		 909 aa  336  7e-91  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0886279  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3370  NADH dehydrogenase I, G subunit  46.04 
 
 		 905 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4738  NADH dehydrogenase subunit G  36.35 
 
 		 877 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29940  NADH dehydrogenase subunit G  44.31 
 
 		 905 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2564  NADH dehydrogenase subunit G  44.31 
 
 		 905 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  34.47 
 
 		 929 aa  323  4e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1018  NADH dehydrogenase subunit G  43 
 
 		 942 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181039  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3127  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  43.51 
 
 		 920 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  42.68 
 
 		 1030 aa  313  6.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  42.62 
 
 		 1039 aa  311  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0713  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  44.16 
 
 		 896 aa  311  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1115  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  47.92 
 
 		 902 aa  308  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  42.79 
 
 		 872 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1694  NADH dehydrogenase subunit G  41.13 
 
 		 1010 aa  303  8.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2865  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.82 
 
 		 947 aa  302  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119541  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1352  NADH dehydrogenase subunit G  41.65 
 
 		 872 aa  299  8e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.236873 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1694  NADH dehydrogenase subunit G  42.75 
 
 		 860 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0130655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0105  NADH dehydrogenase subunit G  41.45 
 
 		 860 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.831692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1741  NADH dehydrogenase subunit G  41.45 
 
 		 860 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.217192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30 
 
 		 782 aa  261  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  30 
 
 		 782 aa  261  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.78 
 
 		 797 aa  261  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.27 
 
 		 771 aa  256  7e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  32.11 
 
 		 777 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  32.1 
 
 		 777 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  31.21 
 
 		 670 aa  251  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  31.06 
 
 		 669 aa  247  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  30.97 
 
 		 667 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  38.84 
 
 		 776 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  38.84 
 
 		 776 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  38.84 
 
 		 776 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  38.84 
 
 		 776 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  38.84 
 
 		 776 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  38.84 
 
 		 776 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  38.84 
 
 		 776 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  30.11 
 
 		 771 aa  244  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  29.5 
 
 		 783 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  37.97 
 
 		 777 aa  243  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  30.78 
 
 		 791 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  38.05 
 
 		 809 aa  242  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  37.97 
 
 		 776 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  37.33 
 
 		 776 aa  241  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  37.33 
 
 		 776 aa  240  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  37.33 
 
 		 776 aa  240  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  37.33 
 
 		 776 aa  239  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  37.06 
 
 		 783 aa  239  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  32.12 
 
 		 689 aa  239  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  27.39 
 
 		 683 aa  239  1e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  38.82 
 
 		 720 aa  239  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  37.05 
 
 		 776 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  37.05 
 
 		 776 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.27 
 
 		 833 aa  237  6e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  41.08 
 
 		 784 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  27.62 
 
 		 808 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  37.06 
 
 		 717 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  37.97 
 
 		 790 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  38.55 
 
 		 776 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.31 
 
 		 770 aa  234  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>