More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3820 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3422  NADH dehydrogenase subunit G  47.14 
 
 		 908 aa  827    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02208  NADH dehydrogenase subunit G  47.25 
 
 		 910 aa  831    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1374  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  47.14 
 
 		 908 aa  827    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00828707  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2659  NADH dehydrogenase subunit G  47.14 
 
 		 908 aa  827    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322834  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0713  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  44.72 
 
 		 896 aa  716    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4124  NADH dehydrogenase subunit G  47.34 
 
 		 904 aa  832    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  46.88 
 
 		 929 aa  806    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2767  NADH dehydrogenase subunit G  47.02 
 
 		 908 aa  820    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2576  NADH dehydrogenase subunit G  47.03 
 
 		 908 aa  826    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2551  NADH dehydrogenase subunit G  48.49 
 
 		 908 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0113562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2827  NADH dehydrogenase subunit G  47.71 
 
 		 910 aa  836    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0965571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1016  NADH dehydrogenase subunit G  47.34 
 
 		 909 aa  815    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3370  NADH dehydrogenase I, G subunit  47.79 
 
 		 905 aa  862    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1565  NADH dehydrogenase subunit G  47.41 
 
 		 914 aa  842    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2669  NADH dehydrogenase subunit G  48.49 
 
 		 908 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2562  NADH dehydrogenase subunit G  48.49 
 
 		 908 aa  824    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3202  NADH dehydrogenase subunit G  47.9 
 
 		 905 aa  866    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119939  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3696  NADH dehydrogenase subunit G  47.23 
 
 		 904 aa  830    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28490  NADH dehydrogenase subunit G  47.71 
 
 		 903 aa  838    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2432  NADH dehydrogenase subunit G  47.14 
 
 		 908 aa  827    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1122  NADH dehydrogenase subunit G  49.83 
 
 		 909 aa  888    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.741047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3608  NADH dehydrogenase subunit G  48.77 
 
 		 904 aa  871    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0967194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1018  NADH dehydrogenase subunit G  48.66 
 
 		 942 aa  892    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1399  NADH dehydrogenase subunit G  46.81 
 
 		 908 aa  825    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2437  NADH dehydrogenase subunit G  47.14 
 
 		 908 aa  828    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1811  NADH dehydrogenase subunit G  47.3 
 
 		 914 aa  842    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.821067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2545  NADH dehydrogenase subunit G  47.42 
 
 		 908 aa  832    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0568157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1741  NADH dehydrogenase subunit G  47.34 
 
 		 904 aa  832    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0398307  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  44.34 
 
 		 871 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  42.65 
 
 		 872 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1369  NADH dehydrogenase subunit G  47.14 
 
 		 908 aa  827    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852491  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3127  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  47.61 
 
 		 920 aa  815    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2564  NADH dehydrogenase subunit G  47.43 
 
 		 905 aa  838    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0376  NADH dehydrogenase subunit G  46.15 
 
 		 909 aa  787    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0886279  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1115  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  46.41 
 
 		 902 aa  780    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2507  NADH dehydrogenase subunit G  48.38 
 
 		 908 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2462  NADH dehydrogenase subunit G  48.61 
 
 		 908 aa  826    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289624  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3820  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  100 
 
 		 899 aa  1885    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1459  NADH dehydrogenase subunit G  47.52 
 
 		 914 aa  845    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02168  hypothetical protein  47.25 
 
 		 910 aa  831    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4738  NADH dehydrogenase subunit G  42.55 
 
 		 877 aa  679    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2417  NADH dehydrogenase subunit G  47.79 
 
 		 902 aa  863    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58498  normal  0.233551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1868  NADH dehydrogenase subunit G  47.56 
 
 		 904 aa  835    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.052963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29940  NADH dehydrogenase subunit G  47.54 
 
 		 905 aa  834    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1497  NADH dehydrogenase subunit G  47.02 
 
 		 908 aa  825    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.838261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3303  NADH dehydrogenase subunit G  46.6 
 
 		 915 aa  802    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113952  normal  0.988711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1352  NADH dehydrogenase subunit G  41.16 
 
 		 872 aa  632  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.236873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2865  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.08 
 
 		 947 aa  617  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119541  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1694  NADH dehydrogenase subunit G  38.17 
 
 		 860 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0130655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0105  NADH dehydrogenase subunit G  37.88 
 
 		 860 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.831692  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1694  NADH dehydrogenase subunit G  48.63 
 
 		 1010 aa  525  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  49.07 
 
 		 1039 aa  520  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1741  NADH dehydrogenase subunit G  37.85 
 
 		 860 aa  519  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.217192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  49.25 
 
 		 1030 aa  515  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  39.32 
 
 		 798 aa  405  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1954  NADH dehydrogenase subunit G  37.21 
 
 		 818 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0326  NADH dehydrogenase subunit G  38.22 
 
 		 631 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  36.57 
 
 		 642 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  46.4 
 
 		 677 aa  360  9e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  43.56 
 
 		 648 aa  347  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0157  NADH dehydrogenase subunit G  43.96 
 
 		 648 aa  344  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.735826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.38 
 
 		 797 aa  256  9e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  28.26 
 
 		 797 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  28.15 
 
 		 808 aa  228  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  37.19 
 
 		 782 aa  228  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.19 
 
 		 782 aa  228  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  28.88 
 
 		 784 aa  226  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  26.39 
 
 		 795 aa  223  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  27.93 
 
 		 717 aa  222  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  28.25 
 
 		 779 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.04 
 
 		 771 aa  222  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  28.18 
 
 		 689 aa  223  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  27.54 
 
 		 686 aa  221  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  28.16 
 
 		 771 aa  221  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0915  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.29 
 
 		 721 aa  220  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  28.2 
 
 		 783 aa  217  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  27.31 
 
 		 918 aa  216  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  27.71 
 
 		 913 aa  215  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  27.14 
 
 		 777 aa  213  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  28.59 
 
 		 783 aa  213  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  26.93 
 
 		 796 aa  214  9e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  28.31 
 
 		 783 aa  213  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  26.99 
 
 		 777 aa  213  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  27.16 
 
 		 715 aa  212  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  27.6 
 
 		 714 aa  211  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  27.1 
 
 		 710 aa  211  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  26.9 
 
 		 923 aa  211  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  27.3 
 
 		 776 aa  211  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  27.18 
 
 		 903 aa  211  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  27.05 
 
 		 809 aa  210  9e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  27.15 
 
 		 776 aa  210  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  27.15 
 
 		 776 aa  210  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.2 
 
 		 771 aa  210  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  27.15 
 
 		 776 aa  210  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  27.15 
 
 		 776 aa  210  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  27.15 
 
 		 776 aa  210  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  27.15 
 
 		 776 aa  210  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  26.86 
 
 		 797 aa  209  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  27.48 
 
 		 721 aa  208  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  25.97 
 
 		 776 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>