More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1115 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1565  NADH dehydrogenase subunit G  49.05 
 
 		 914 aa  856    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02208  NADH dehydrogenase subunit G  50.62 
 
 		 910 aa  884    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1374  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  50.51 
 
 		 908 aa  879    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00828707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3422  NADH dehydrogenase subunit G  50.51 
 
 		 908 aa  878    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4124  NADH dehydrogenase subunit G  52.13 
 
 		 904 aa  877    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  52.43 
 
 		 929 aa  876    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1868  NADH dehydrogenase subunit G  52.57 
 
 		 904 aa  883    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.052963 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2437  NADH dehydrogenase subunit G  50.51 
 
 		 908 aa  880    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1741  NADH dehydrogenase subunit G  52.13 
 
 		 904 aa  879    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0398307  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1016  NADH dehydrogenase subunit G  50.62 
 
 		 909 aa  852    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3370  NADH dehydrogenase I, G subunit  51.86 
 
 		 905 aa  897    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2827  NADH dehydrogenase subunit G  50.39 
 
 		 910 aa  880    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0965571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1497  NADH dehydrogenase subunit G  49.49 
 
 		 908 aa  863    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.838261  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0713  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  52.83 
 
 		 896 aa  839    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4738  NADH dehydrogenase subunit G  46.07 
 
 		 877 aa  689    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3202  NADH dehydrogenase subunit G  51.97 
 
 		 905 aa  902    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119939  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2507  NADH dehydrogenase subunit G  49.78 
 
 		 908 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28490  NADH dehydrogenase subunit G  52.56 
 
 		 903 aa  867    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1369  NADH dehydrogenase subunit G  50.51 
 
 		 908 aa  879    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852491  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2545  NADH dehydrogenase subunit G  50.06 
 
 		 908 aa  862    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0568157  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3696  NADH dehydrogenase subunit G  52.01 
 
 		 904 aa  879    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2564  NADH dehydrogenase subunit G  53.11 
 
 		 905 aa  899    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1122  NADH dehydrogenase subunit G  52.24 
 
 		 909 aa  917    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.741047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3608  NADH dehydrogenase subunit G  51.68 
 
 		 904 aa  894    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0967194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2659  NADH dehydrogenase subunit G  50.39 
 
 		 908 aa  878    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322834  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1399  NADH dehydrogenase subunit G  50.28 
 
 		 908 aa  860    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2767  NADH dehydrogenase subunit G  49.49 
 
 		 908 aa  850    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124088  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1018  NADH dehydrogenase subunit G  51.27 
 
 		 942 aa  918    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181039  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2462  NADH dehydrogenase subunit G  49.78 
 
 		 908 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289624  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2669  NADH dehydrogenase subunit G  49.78 
 
 		 908 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1459  NADH dehydrogenase subunit G  49.05 
 
 		 914 aa  857    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1352  NADH dehydrogenase subunit G  46.56 
 
 		 872 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.236873 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2576  NADH dehydrogenase subunit G  50.51 
 
 		 908 aa  880    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2562  NADH dehydrogenase subunit G  49.78 
 
 		 908 aa  859    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2432  NADH dehydrogenase subunit G  50.51 
 
 		 908 aa  880    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  48.71 
 
 		 871 aa  710    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  46.79 
 
 		 872 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3127  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  50.49 
 
 		 920 aa  833    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0376  NADH dehydrogenase subunit G  47.75 
 
 		 909 aa  806    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0886279  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2551  NADH dehydrogenase subunit G  49.78 
 
 		 908 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0113562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3303  NADH dehydrogenase subunit G  49.61 
 
 		 915 aa  831    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113952  normal  0.988711 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02168  hypothetical protein  50.62 
 
 		 910 aa  884    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2417  NADH dehydrogenase subunit G  53.32 
 
 		 902 aa  898    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58498  normal  0.233551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29940  NADH dehydrogenase subunit G  52.67 
 
 		 905 aa  888    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3820  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  46.41 
 
 		 899 aa  808    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1811  NADH dehydrogenase subunit G  48.94 
 
 		 914 aa  855    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.821067 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1115  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  100 
 
 		 902 aa  1813    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2865  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.96 
 
 		 947 aa  592  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119541  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1694  NADH dehydrogenase subunit G  45.58 
 
 		 860 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0130655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0105  NADH dehydrogenase subunit G  44.77 
 
 		 860 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.831692  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  50.19 
 
 		 1030 aa  545  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1694  NADH dehydrogenase subunit G  49.72 
 
 		 1010 aa  545  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  50.64 
 
 		 1039 aa  543  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1741  NADH dehydrogenase subunit G  53.85 
 
 		 860 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.217192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  37.84 
 
 		 798 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1954  NADH dehydrogenase subunit G  38.19 
 
 		 818 aa  369  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  38.27 
 
 		 677 aa  365  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  38.03 
 
 		 642 aa  365  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0326  NADH dehydrogenase subunit G  44.73 
 
 		 631 aa  365  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  42.99 
 
 		 648 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0157  NADH dehydrogenase subunit G  47.92 
 
 		 648 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.735826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  31.62 
 
 		 791 aa  253  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.17 
 
 		 797 aa  252  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30 
 
 		 771 aa  251  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  29.61 
 
 		 777 aa  249  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.25 
 
 		 771 aa  247  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  28.76 
 
 		 808 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  29.62 
 
 		 809 aa  244  5e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  31.03 
 
 		 779 aa  243  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  30.19 
 
 		 776 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  28.9 
 
 		 777 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  30.04 
 
 		 776 aa  241  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  30.04 
 
 		 776 aa  241  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  30.04 
 
 		 776 aa  241  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  30.04 
 
 		 776 aa  241  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  30.04 
 
 		 776 aa  241  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  30.04 
 
 		 776 aa  241  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  28.99 
 
 		 777 aa  240  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  27.89 
 
 		 784 aa  239  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  27.3 
 
 		 797 aa  239  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  29.15 
 
 		 776 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  29.15 
 
 		 776 aa  238  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  29.32 
 
 		 715 aa  237  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  29 
 
 		 776 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  27.64 
 
 		 717 aa  236  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  29.15 
 
 		 776 aa  235  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  29.33 
 
 		 795 aa  233  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.54 
 
 		 918 aa  232  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  28.86 
 
 		 776 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  33.49 
 
 		 771 aa  231  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  28.86 
 
 		 776 aa  231  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  29.65 
 
 		 790 aa  231  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  30.43 
 
 		 791 aa  231  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  28.15 
 
 		 783 aa  230  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  27.68 
 
 		 714 aa  228  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.07 
 
 		 782 aa  228  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  26.62 
 
 		 913 aa  228  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  35.07 
 
 		 782 aa  228  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  32.27 
 
 		 776 aa  226  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 		 710 aa  225  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>