More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1811 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1694  NADH dehydrogenase subunit G  58.86 
 
 
1010 aa  672    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02208  NADH dehydrogenase subunit G  79.76 
 
 
910 aa  1562    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1374  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  79.87 
 
 
908 aa  1564    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00828707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4738  NADH dehydrogenase subunit G  44.1 
 
 
877 aa  677    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656278  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4124  NADH dehydrogenase subunit G  66.34 
 
 
904 aa  1244    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  51.72 
 
 
929 aa  902    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3422  NADH dehydrogenase subunit G  79.87 
 
 
908 aa  1563    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.722841  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2462  NADH dehydrogenase subunit G  80.96 
 
 
908 aa  1557    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1399  NADH dehydrogenase subunit G  81.07 
 
 
908 aa  1569    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1016  NADH dehydrogenase subunit G  64.92 
 
 
909 aa  1227    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3370  NADH dehydrogenase I, G subunit  66.52 
 
 
905 aa  1266    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2669  NADH dehydrogenase subunit G  80.96 
 
 
908 aa  1558    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3202  NADH dehydrogenase subunit G  66.52 
 
 
905 aa  1269    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119939  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  57.33 
 
 
1030 aa  647    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1811  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 
914 aa  1905    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.821067 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2507  NADH dehydrogenase subunit G  80.96 
 
 
908 aa  1556    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1565  NADH dehydrogenase subunit G  99.78 
 
 
914 aa  1902    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1741  NADH dehydrogenase subunit G  66.45 
 
 
904 aa  1247    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0398307  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1122  NADH dehydrogenase subunit G  51.65 
 
 
909 aa  937    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.741047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3608  NADH dehydrogenase subunit G  65.97 
 
 
904 aa  1263    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0967194  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2551  NADH dehydrogenase subunit G  81.07 
 
 
908 aa  1559    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0113562  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1459  NADH dehydrogenase subunit G  99.67 
 
 
914 aa  1900    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1018  NADH dehydrogenase subunit G  50.48 
 
 
942 aa  933    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181039  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0713  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  47.95 
 
 
896 aa  812    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1868  NADH dehydrogenase subunit G  66.08 
 
 
904 aa  1239    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.052963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2562  NADH dehydrogenase subunit G  81.07 
 
 
908 aa  1560    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3303  NADH dehydrogenase subunit G  87.09 
 
 
915 aa  1651    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113952  normal  0.988711 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1115  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  48.94 
 
 
902 aa  816    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2564  NADH dehydrogenase subunit G  67.76 
 
 
905 aa  1276    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2659  NADH dehydrogenase subunit G  79.76 
 
 
908 aa  1563    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322834  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  43.98 
 
 
871 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2417  NADH dehydrogenase subunit G  66.85 
 
 
902 aa  1273    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58498  normal  0.233551 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02168  hypothetical protein  79.76 
 
 
910 aa  1562    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3820  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  47.3 
 
 
899 aa  842    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102025  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  43.24 
 
 
872 aa  688    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3127  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  56.78 
 
 
920 aa  1034    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2437  NADH dehydrogenase subunit G  79.87 
 
 
908 aa  1566    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  58.03 
 
 
1039 aa  649    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0376  NADH dehydrogenase subunit G  68.97 
 
 
909 aa  1342    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0886279  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2545  NADH dehydrogenase subunit G  80.53 
 
 
908 aa  1566    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0568157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2432  NADH dehydrogenase subunit G  79.87 
 
 
908 aa  1563    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2576  NADH dehydrogenase subunit G  79.65 
 
 
908 aa  1562    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3696  NADH dehydrogenase subunit G  66.23 
 
 
904 aa  1243    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267258  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28490  NADH dehydrogenase subunit G  67.18 
 
 
903 aa  1266    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1497  NADH dehydrogenase subunit G  83.81 
 
 
908 aa  1616    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.838261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1369  NADH dehydrogenase subunit G  79.87 
 
 
908 aa  1564    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852491  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2767  NADH dehydrogenase subunit G  83.59 
 
 
908 aa  1597    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29940  NADH dehydrogenase subunit G  67.43 
 
 
905 aa  1266    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2827  NADH dehydrogenase subunit G  81.58 
 
 
910 aa  1588    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0965571  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2865  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.23 
 
 
947 aa  612  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119541  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1352  NADH dehydrogenase subunit G  41 
 
 
872 aa  612  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.236873 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0105  NADH dehydrogenase subunit G  39.6 
 
 
860 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.831692  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1694  NADH dehydrogenase subunit G  40.66 
 
 
860 aa  538  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0130655  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1741  NADH dehydrogenase subunit G  49.47 
 
 
860 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.217192  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1954  NADH dehydrogenase subunit G  37.6 
 
 
818 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.509944  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  37.52 
 
 
642 aa  389  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  36.88 
 
 
677 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  37.56 
 
 
798 aa  385  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0326  NADH dehydrogenase subunit G  38.91 
 
 
631 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0157  NADH dehydrogenase subunit G  36.18 
 
 
648 aa  361  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.735826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  36.03 
 
 
648 aa  360  7e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  27.31 
 
 
797 aa  242  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  27.68 
 
 
717 aa  230  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  27.52 
 
 
795 aa  228  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  28.4 
 
 
784 aa  228  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  28.24 
 
 
777 aa  226  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  26.45 
 
 
715 aa  225  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  28.79 
 
 
720 aa  224  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  27.09 
 
 
903 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  27.34 
 
 
714 aa  222  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 
790 aa  222  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  27.57 
 
 
791 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  27.46 
 
 
777 aa  221  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  27.05 
 
 
710 aa  221  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  31.95 
 
 
782 aa  219  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.95 
 
 
782 aa  219  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  27.2 
 
 
809 aa  218  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  26.36 
 
 
913 aa  218  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  27.26 
 
 
779 aa  218  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 
721 aa  217  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  26.15 
 
 
783 aa  217  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  26.51 
 
 
797 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  26.03 
 
 
808 aa  217  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  26.43 
 
 
771 aa  215  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  26.15 
 
 
783 aa  214  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  27.63 
 
 
776 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  27.48 
 
 
776 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  25.93 
 
 
776 aa  211  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  27.88 
 
 
771 aa  211  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  31.02 
 
 
707 aa  211  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  27.48 
 
 
776 aa  210  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  27.55 
 
 
683 aa  210  1e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  25.5 
 
 
679 aa  209  2e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  27.23 
 
 
776 aa  208  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  27.22 
 
 
700 aa  208  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  26.45 
 
 
776 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  26.41 
 
 
777 aa  208  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  27.01 
 
 
716 aa  208  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  26.16 
 
 
719 aa  208  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0915  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.16 
 
 
721 aa  207  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>