More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0589 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2462  NADH dehydrogenase subunit G  59.41 
 
 		 908 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02208  NADH dehydrogenase subunit G  59.52 
 
 		 910 aa  682    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1374  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  59.34 
 
 		 908 aa  680    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00828707  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4124  NADH dehydrogenase subunit G  61.52 
 
 		 904 aa  704    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3422  NADH dehydrogenase subunit G  59.34 
 
 		 908 aa  679    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28490  NADH dehydrogenase subunit G  63.05 
 
 		 903 aa  718    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2432  NADH dehydrogenase subunit G  59.34 
 
 		 908 aa  680    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1016  NADH dehydrogenase subunit G  57.78 
 
 		 909 aa  652    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3370  NADH dehydrogenase I, G subunit  61.9 
 
 		 905 aa  710    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1694  NADH dehydrogenase subunit G  74.4 
 
 		 1010 aa  1564    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3202  NADH dehydrogenase subunit G  61.52 
 
 		 905 aa  709    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119939  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 1030 aa  2154    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3696  NADH dehydrogenase subunit G  61.34 
 
 		 904 aa  702    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2564  NADH dehydrogenase subunit G  63.75 
 
 		 905 aa  730    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1565  NADH dehydrogenase subunit G  57.51 
 
 		 914 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2417  NADH dehydrogenase subunit G  61.9 
 
 		 902 aa  702    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58498  normal  0.233551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3608  NADH dehydrogenase subunit G  60.04 
 
 		 904 aa  699    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0967194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1741  NADH dehydrogenase subunit G  61.34 
 
 		 904 aa  703    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0398307  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1369  NADH dehydrogenase subunit G  59.34 
 
 		 908 aa  680    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852491  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2576  NADH dehydrogenase subunit G  59.52 
 
 		 908 aa  681    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02168  hypothetical protein  59.52 
 
 		 910 aa  682    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2767  NADH dehydrogenase subunit G  57.14 
 
 		 908 aa  648    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2545  NADH dehydrogenase subunit G  58.42 
 
 		 908 aa  658    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0568157  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1811  NADH dehydrogenase subunit G  57.33 
 
 		 914 aa  663    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.821067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1399  NADH dehydrogenase subunit G  58.42 
 
 		 908 aa  660    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1868  NADH dehydrogenase subunit G  61.52 
 
 		 904 aa  703    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.052963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2562  NADH dehydrogenase subunit G  59.41 
 
 		 908 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2659  NADH dehydrogenase subunit G  59.34 
 
 		 908 aa  680    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322834  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  94.71 
 
 		 1039 aa  2024    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2437  NADH dehydrogenase subunit G  59.34 
 
 		 908 aa  679    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1497  NADH dehydrogenase subunit G  57.33 
 
 		 908 aa  661    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.838261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2827  NADH dehydrogenase subunit G  45.49 
 
 		 910 aa  830    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0965571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2669  NADH dehydrogenase subunit G  59.16 
 
 		 908 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1459  NADH dehydrogenase subunit G  57.51 
 
 		 914 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2507  NADH dehydrogenase subunit G  59.41 
 
 		 908 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29940  NADH dehydrogenase subunit G  63.75 
 
 		 905 aa  731    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2551  NADH dehydrogenase subunit G  59.41 
 
 		 908 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0113562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3303  NADH dehydrogenase subunit G  58.24 
 
 		 915 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113952  normal  0.988711 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3127  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  54.86 
 
 		 920 aa  635  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0376  NADH dehydrogenase subunit G  56.9 
 
 		 909 aa  623  1e-177  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0886279  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  38.88 
 
 		 872 aa  599  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2865  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.47 
 
 		 947 aa  552  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119541  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1122  NADH dehydrogenase subunit G  49.63 
 
 		 909 aa  546  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.741047  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  47.3 
 
 		 929 aa  545  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1115  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  51.16 
 
 		 902 aa  538  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0713  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  49.05 
 
 		 896 aa  533  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1018  NADH dehydrogenase subunit G  47.96 
 
 		 942 aa  526  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3820  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  49.25 
 
 		 899 aa  528  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4738  NADH dehydrogenase subunit G  46.73 
 
 		 877 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656278  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  45.71 
 
 		 871 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1352  NADH dehydrogenase subunit G  45.84 
 
 		 872 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.236873 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1741  NADH dehydrogenase subunit G  46.85 
 
 		 860 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.217192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0105  NADH dehydrogenase subunit G  47.07 
 
 		 860 aa  429  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.831692  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1694  NADH dehydrogenase subunit G  46.85 
 
 		 860 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0130655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0326  NADH dehydrogenase subunit G  39.56 
 
 		 631 aa  365  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  45.97 
 
 		 798 aa  361  4e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1954  NADH dehydrogenase subunit G  44.52 
 
 		 818 aa  345  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  44.55 
 
 		 642 aa  343  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  43.58 
 
 		 677 aa  340  9e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0157  NADH dehydrogenase subunit G  42.68 
 
 		 648 aa  314  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.735826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  42.34 
 
 		 648 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.26 
 
 		 797 aa  239  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.02 
 
 		 782 aa  228  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  34.02 
 
 		 782 aa  228  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.6 
 
 		 913 aa  218  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.4 
 
 		 903 aa  215  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.54 
 
 		 923 aa  211  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  31.55 
 
 		 685 aa  211  5e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  31.77 
 
 		 784 aa  210  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.54 
 
 		 918 aa  209  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  28.28 
 
 		 795 aa  208  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  29.92 
 
 		 777 aa  208  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  30.43 
 
 		 797 aa  207  9e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  30.49 
 
 		 744 aa  207  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  29.42 
 
 		 777 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  30.96 
 
 		 808 aa  206  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.56 
 
 		 788 aa  206  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  30.6 
 
 		 783 aa  205  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  30.6 
 
 		 783 aa  204  7e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0915  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30 
 
 		 721 aa  204  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  31.07 
 
 		 683 aa  203  9.999999999999999e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  29.93 
 
 		 850 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  28.09 
 
 		 679 aa  202  1.9999999999999998e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  31.42 
 
 		 689 aa  202  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  30.08 
 
 		 739 aa  202  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4132  NADH dehydrogenase subunit G  33.17 
 
 		 693 aa  199  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.915862  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  31.57 
 
 		 791 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  30.6 
 
 		 791 aa  197  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  30.58 
 
 		 790 aa  197  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 		 797 aa  197  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  29.06 
 
 		 809 aa  197  9e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.94 
 
 		 833 aa  197  9e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  29.04 
 
 		 682 aa  197  1e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01310  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  32.11 
 
 		 775 aa  197  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.754341  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  31.51 
 
 		 669 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  33.42 
 
 		 686 aa  196  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  30.14 
 
 		 700 aa  196  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  30.6 
 
 		 777 aa  196  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2410  NADH dehydrogenase subunit G  31.58 
 
 		 692 aa  196  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  hitchhiker  0.00632886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  30.07 
 
 		 715 aa  195  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>