More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1868 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02208  NADH dehydrogenase subunit G  65.53 
 
 		 910 aa  1250    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1374  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  65.42 
 
 		 908 aa  1248    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00828707  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0713  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  49.33 
 
 		 896 aa  816    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4124  NADH dehydrogenase subunit G  98.12 
 
 		 904 aa  1831    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  54.33 
 
 		 929 aa  921    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1811  NADH dehydrogenase subunit G  66.08 
 
 		 914 aa  1259    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.821067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3820  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  47.56 
 
 		 899 aa  850    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3696  NADH dehydrogenase subunit G  97.68 
 
 		 904 aa  1788    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1016  NADH dehydrogenase subunit G  63.55 
 
 		 909 aa  1186    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3370  NADH dehydrogenase I, G subunit  87.51 
 
 		 905 aa  1660    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2545  NADH dehydrogenase subunit G  65.2 
 
 		 908 aa  1232    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0568157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2562  NADH dehydrogenase subunit G  65.53 
 
 		 908 aa  1234    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3202  NADH dehydrogenase subunit G  87.62 
 
 		 905 aa  1663    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119939  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  61.52 
 
 		 1030 aa  686    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2437  NADH dehydrogenase subunit G  65.42 
 
 		 908 aa  1248    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3303  NADH dehydrogenase subunit G  65.83 
 
 		 915 aa  1228    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113952  normal  0.988711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1868  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 904 aa  1859    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.052963 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1122  NADH dehydrogenase subunit G  53.5 
 
 		 909 aa  955    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.741047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3608  NADH dehydrogenase subunit G  89.16 
 
 		 904 aa  1692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0967194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2576  NADH dehydrogenase subunit G  65.2 
 
 		 908 aa  1245    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4738  NADH dehydrogenase subunit G  45.2 
 
 		 877 aa  683    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656278  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2551  NADH dehydrogenase subunit G  65.53 
 
 		 908 aa  1233    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0113562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1018  NADH dehydrogenase subunit G  52.74 
 
 		 942 aa  940    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181039  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2669  NADH dehydrogenase subunit G  65.53 
 
 		 908 aa  1234    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1497  NADH dehydrogenase subunit G  65.31 
 
 		 908 aa  1239    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.838261  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1459  NADH dehydrogenase subunit G  66.3 
 
 		 914 aa  1264    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2432  NADH dehydrogenase subunit G  65.42 
 
 		 908 aa  1247    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2659  NADH dehydrogenase subunit G  65.42 
 
 		 908 aa  1246    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322834  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  47.69 
 
 		 871 aa  694    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  47.25 
 
 		 872 aa  695    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1694  NADH dehydrogenase subunit G  51.77 
 
 		 1010 aa  975    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3127  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  60.64 
 
 		 920 aa  1107    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1115  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  52.68 
 
 		 902 aa  867    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  61.48 
 
 		 1039 aa  689    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0376  NADH dehydrogenase subunit G  57.4 
 
 		 909 aa  1090    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0886279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3422  NADH dehydrogenase subunit G  65.42 
 
 		 908 aa  1246    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1565  NADH dehydrogenase subunit G  66.3 
 
 		 914 aa  1264    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2564  NADH dehydrogenase subunit G  80.33 
 
 		 905 aa  1504    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2507  NADH dehydrogenase subunit G  65.42 
 
 		 908 aa  1231    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2462  NADH dehydrogenase subunit G  65.53 
 
 		 908 aa  1233    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289624  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2827  NADH dehydrogenase subunit G  65.34 
 
 		 910 aa  1244    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0965571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1741  NADH dehydrogenase subunit G  98.34 
 
 		 904 aa  1834    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0398307  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2767  NADH dehydrogenase subunit G  65.24 
 
 		 908 aa  1226    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28490  NADH dehydrogenase subunit G  78.43 
 
 		 903 aa  1471    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29940  NADH dehydrogenase subunit G  80.55 
 
 		 905 aa  1494    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02168  hypothetical protein  65.53 
 
 		 910 aa  1250    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2417  NADH dehydrogenase subunit G  78.54 
 
 		 902 aa  1489    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58498  normal  0.233551 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1369  NADH dehydrogenase subunit G  65.42 
 
 		 908 aa  1248    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852491  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1399  NADH dehydrogenase subunit G  65.75 
 
 		 908 aa  1238    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1352  NADH dehydrogenase subunit G  45.77 
 
 		 872 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.236873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2865  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.31 
 
 		 947 aa  587  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119541  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0105  NADH dehydrogenase subunit G  41.31 
 
 		 860 aa  552  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.831692  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1694  NADH dehydrogenase subunit G  42.55 
 
 		 860 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0130655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1741  NADH dehydrogenase subunit G  41.31 
 
 		 860 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.217192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  40.28 
 
 		 642 aa  415  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  39.94 
 
 		 677 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  39.81 
 
 		 798 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1954  NADH dehydrogenase subunit G  37.9 
 
 		 818 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0326  NADH dehydrogenase subunit G  40.09 
 
 		 631 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  47.09 
 
 		 648 aa  347  8e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0157  NADH dehydrogenase subunit G  46.36 
 
 		 648 aa  344  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.735826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.25 
 
 		 797 aa  254  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  29.24 
 
 		 795 aa  235  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.57 
 
 		 782 aa  234  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  29.57 
 
 		 782 aa  234  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  27.23 
 
 		 822 aa  230  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  28.55 
 
 		 831 aa  226  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  26.35 
 
 		 913 aa  224  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  29.43 
 
 		 784 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  29.24 
 
 		 777 aa  224  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  28.29 
 
 		 715 aa  222  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  28.74 
 
 		 686 aa  221  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.2 
 
 		 903 aa  221  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  29.09 
 
 		 777 aa  221  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  28.96 
 
 		 822 aa  220  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  27.42 
 
 		 808 aa  220  8.999999999999998e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  27.34 
 
 		 717 aa  219  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  27.2 
 
 		 714 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.14 
 
 		 823 aa  218  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  27.37 
 
 		 844 aa  217  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  28.75 
 
 		 797 aa  217  8e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  28.13 
 
 		 779 aa  217  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  28.13 
 
 		 669 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  27.61 
 
 		 771 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 		 791 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  27.49 
 
 		 790 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.46 
 
 		 771 aa  216  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.13 
 
 		 771 aa  214  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  28.4 
 
 		 783 aa  214  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  28.04 
 
 		 809 aa  214  5.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  29.05 
 
 		 783 aa  214  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  27.23 
 
 		 710 aa  214  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  26.31 
 
 		 679 aa  214  7e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  27.68 
 
 		 689 aa  213  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  28.51 
 
 		 783 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.4 
 
 		 923 aa  211  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3639  molybdopterin oxidoreductase  27.22 
 
 		 843 aa  211  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.424964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.89 
 
 		 918 aa  208  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  27.96 
 
 		 776 aa  208  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  27.57 
 
 		 776 aa  208  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>