More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1694 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0105  NADH dehydrogenase subunit G  90.8 
 
 		 860 aa  1418    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.831692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1741  NADH dehydrogenase subunit G  91.5 
 
 		 860 aa  1394    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.217192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1694  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 860 aa  1680    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0130655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1352  NADH dehydrogenase subunit G  53.96 
 
 		 872 aa  769    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.236873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  55.68 
 
 		 871 aa  824    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4738  NADH dehydrogenase subunit G  53.25 
 
 		 877 aa  813    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656278  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  55.81 
 
 		 872 aa  852    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2827  NADH dehydrogenase subunit G  43.21 
 
 		 910 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0965571  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02208  NADH dehydrogenase subunit G  42.51 
 
 		 910 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  44.79 
 
 		 929 aa  632  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2437  NADH dehydrogenase subunit G  42.51 
 
 		 908 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3608  NADH dehydrogenase subunit G  43.11 
 
 		 904 aa  630  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0967194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02168  hypothetical protein  42.51 
 
 		 910 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2659  NADH dehydrogenase subunit G  42.39 
 
 		 908 aa  629  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1374  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  42.39 
 
 		 908 aa  627  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00828707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3422  NADH dehydrogenase subunit G  42.39 
 
 		 908 aa  626  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1122  NADH dehydrogenase subunit G  42.78 
 
 		 909 aa  627  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.741047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1369  NADH dehydrogenase subunit G  42.39 
 
 		 908 aa  627  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852491  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1018  NADH dehydrogenase subunit G  42.47 
 
 		 942 aa  625  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2432  NADH dehydrogenase subunit G  41.71 
 
 		 908 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2576  NADH dehydrogenase subunit G  42.39 
 
 		 908 aa  627  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3370  NADH dehydrogenase I, G subunit  42.79 
 
 		 905 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3202  NADH dehydrogenase subunit G  42.91 
 
 		 905 aa  625  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119939  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1497  NADH dehydrogenase subunit G  40.59 
 
 		 908 aa  625  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.838261  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2417  NADH dehydrogenase subunit G  43.65 
 
 		 902 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58498  normal  0.233551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28490  NADH dehydrogenase subunit G  43.41 
 
 		 903 aa  622  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2767  NADH dehydrogenase subunit G  40.81 
 
 		 908 aa  618  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124088  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1016  NADH dehydrogenase subunit G  43.21 
 
 		 909 aa  615  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2564  NADH dehydrogenase subunit G  43.08 
 
 		 905 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1565  NADH dehydrogenase subunit G  41.01 
 
 		 914 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1811  NADH dehydrogenase subunit G  41.01 
 
 		 914 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.821067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1399  NADH dehydrogenase subunit G  42.28 
 
 		 908 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2669  NADH dehydrogenase subunit G  41.69 
 
 		 908 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2507  NADH dehydrogenase subunit G  41.81 
 
 		 908 aa  612  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1459  NADH dehydrogenase subunit G  40.89 
 
 		 914 aa  611  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2462  NADH dehydrogenase subunit G  41.69 
 
 		 908 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289624  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2562  NADH dehydrogenase subunit G  41.69 
 
 		 908 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2545  NADH dehydrogenase subunit G  42.23 
 
 		 908 aa  609  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0568157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29940  NADH dehydrogenase subunit G  43.08 
 
 		 905 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1115  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  45.53 
 
 		 902 aa  612  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2551  NADH dehydrogenase subunit G  41.4 
 
 		 908 aa  608  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0113562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3303  NADH dehydrogenase subunit G  41.02 
 
 		 915 aa  608  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113952  normal  0.988711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1741  NADH dehydrogenase subunit G  42.66 
 
 		 904 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0398307  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4124  NADH dehydrogenase subunit G  42.42 
 
 		 904 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3696  NADH dehydrogenase subunit G  42.87 
 
 		 904 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1868  NADH dehydrogenase subunit G  43.11 
 
 		 904 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.052963 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0376  NADH dehydrogenase subunit G  39.81 
 
 		 909 aa  591  1e-167  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0886279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3820  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.75 
 
 		 899 aa  592  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0713  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  43.04 
 
 		 896 aa  587  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3127  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  44.74 
 
 		 920 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1694  NADH dehydrogenase subunit G  34.57 
 
 		 1010 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2865  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.28 
 
 		 947 aa  498  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119541  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  46.85 
 
 		 1030 aa  444  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  43.2 
 
 		 1039 aa  446  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0326  NADH dehydrogenase subunit G  38.51 
 
 		 631 aa  369  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  39.77 
 
 		 677 aa  365  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  37.95 
 
 		 642 aa  362  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  38.46 
 
 		 798 aa  356  8.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  37.11 
 
 		 648 aa  334  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1954  NADH dehydrogenase subunit G  35.27 
 
 		 818 aa  327  5e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0157  NADH dehydrogenase subunit G  36.12 
 
 		 648 aa  321  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.735826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.62 
 
 		 797 aa  243  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  27.9 
 
 		 771 aa  217  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  29.75 
 
 		 797 aa  213  7.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  29.04 
 
 		 791 aa  213  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  29.93 
 
 		 689 aa  211  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  27.12 
 
 		 771 aa  210  7e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  28.64 
 
 		 784 aa  208  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  29.09 
 
 		 779 aa  207  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  28.01 
 
 		 715 aa  206  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  28.91 
 
 		 776 aa  204  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  28.91 
 
 		 776 aa  204  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  28.91 
 
 		 776 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  28.91 
 
 		 776 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  28.91 
 
 		 776 aa  204  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  28.91 
 
 		 776 aa  204  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.46 
 
 		 796 aa  204  6e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  29.47 
 
 		 783 aa  203  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  28.76 
 
 		 776 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  29.63 
 
 		 795 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  25.55 
 
 		 783 aa  201  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  27.31 
 
 		 798 aa  201  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  28.14 
 
 		 783 aa  201  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  26.6 
 
 		 787 aa  201  6e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  27.51 
 
 		 710 aa  200  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  29.05 
 
 		 776 aa  200  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1320  NADH dehydrogenase subunit G  27.44 
 
 		 672 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568369  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  29.09 
 
 		 776 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  29.09 
 
 		 776 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  26.46 
 
 		 787 aa  199  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0751  NADH dehydrogenase subunit G  26.03 
 
 		 660 aa  199  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0442747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  28.94 
 
 		 776 aa  199  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  26.51 
 
 		 782 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  26.51 
 
 		 782 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  29.46 
 
 		 776 aa  197  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  28.64 
 
 		 776 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  26.14 
 
 		 679 aa  196  1e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  27.8 
 
 		 721 aa  196  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.65 
 
 		 770 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  28.79 
 
 		 776 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>