More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2564 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02208  NADH dehydrogenase subunit G  67.4 
 
 
910 aa  1292    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1374  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  67.29 
 
 
908 aa  1288    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00828707  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4124  NADH dehydrogenase subunit G  80.77 
 
 
904 aa  1494    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  53.86 
 
 
929 aa  937    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1868  NADH dehydrogenase subunit G  80.33 
 
 
904 aa  1487    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.052963 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2437  NADH dehydrogenase subunit G  67.29 
 
 
908 aa  1289    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2562  NADH dehydrogenase subunit G  67.18 
 
 
908 aa  1266    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1016  NADH dehydrogenase subunit G  65.31 
 
 
909 aa  1223    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3370  NADH dehydrogenase I, G subunit  80.77 
 
 
905 aa  1547    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3202  NADH dehydrogenase subunit G  80.55 
 
 
905 aa  1544    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119939  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  63.75 
 
 
1030 aa  713    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4738  NADH dehydrogenase subunit G  45.42 
 
 
877 aa  692    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656278  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1399  NADH dehydrogenase subunit G  66.96 
 
 
908 aa  1261    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3303  NADH dehydrogenase subunit G  66.85 
 
 
915 aa  1229    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113952  normal  0.988711 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1497  NADH dehydrogenase subunit G  66.08 
 
 
908 aa  1248    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.838261  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1122  NADH dehydrogenase subunit G  53.71 
 
 
909 aa  972    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.741047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3608  NADH dehydrogenase subunit G  80.66 
 
 
904 aa  1543    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0967194  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2564  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 
905 aa  1871    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2827  NADH dehydrogenase subunit G  67.11 
 
 
910 aa  1284    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0965571  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3820  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  47.43 
 
 
899 aa  843    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102025  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1018  NADH dehydrogenase subunit G  53.46 
 
 
942 aa  966    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2767  NADH dehydrogenase subunit G  65.97 
 
 
908 aa  1234    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124088  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0713  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  48.43 
 
 
896 aa  820    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1694  NADH dehydrogenase subunit G  62.01 
 
 
1010 aa  711    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2432  NADH dehydrogenase subunit G  67.29 
 
 
908 aa  1288    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1352  NADH dehydrogenase subunit G  43.94 
 
 
872 aa  650    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.236873 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1459  NADH dehydrogenase subunit G  68.09 
 
 
914 aa  1294    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2659  NADH dehydrogenase subunit G  67.4 
 
 
908 aa  1290    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322834  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2669  NADH dehydrogenase subunit G  67.18 
 
 
908 aa  1266    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  45.24 
 
 
871 aa  687    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1369  NADH dehydrogenase subunit G  67.29 
 
 
908 aa  1288    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852491  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  44.58 
 
 
872 aa  721    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1115  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  53.11 
 
 
902 aa  872    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3127  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  61.85 
 
 
920 aa  1127    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  63.15 
 
 
1039 aa  712    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0376  NADH dehydrogenase subunit G  59.93 
 
 
909 aa  1140    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0886279  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2551  NADH dehydrogenase subunit G  67.18 
 
 
908 aa  1266    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0113562  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2576  NADH dehydrogenase subunit G  67.29 
 
 
908 aa  1289    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1811  NADH dehydrogenase subunit G  67.76 
 
 
914 aa  1289    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.821067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2417  NADH dehydrogenase subunit G  79.12 
 
 
902 aa  1505    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58498  normal  0.233551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1741  NADH dehydrogenase subunit G  80.55 
 
 
904 aa  1492    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0398307  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2507  NADH dehydrogenase subunit G  67.07 
 
 
908 aa  1263    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2462  NADH dehydrogenase subunit G  67.07 
 
 
908 aa  1263    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289624  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02168  hypothetical protein  67.4 
 
 
910 aa  1292    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29940  NADH dehydrogenase subunit G  98.67 
 
 
905 aa  1855    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28490  NADH dehydrogenase subunit G  82.65 
 
 
903 aa  1543    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45196  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2545  NADH dehydrogenase subunit G  66.85 
 
 
908 aa  1258    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0568157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3422  NADH dehydrogenase subunit G  67.29 
 
 
908 aa  1287    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.722841  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1565  NADH dehydrogenase subunit G  67.98 
 
 
914 aa  1293    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3696  NADH dehydrogenase subunit G  80.66 
 
 
904 aa  1494    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267258  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2865  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.56 
 
 
947 aa  634  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119541  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0105  NADH dehydrogenase subunit G  41.54 
 
 
860 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.831692  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1694  NADH dehydrogenase subunit G  42.61 
 
 
860 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0130655  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1741  NADH dehydrogenase subunit G  41.32 
 
 
860 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.217192  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  39.5 
 
 
798 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  37.31 
 
 
642 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1954  NADH dehydrogenase subunit G  37.19 
 
 
818 aa  386  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.509944  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  36.69 
 
 
677 aa  379  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0326  NADH dehydrogenase subunit G  35.07 
 
 
631 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  45.05 
 
 
648 aa  334  5e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0157  NADH dehydrogenase subunit G  44.31 
 
 
648 aa  330  7e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.735826 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  29.38 
 
 
795 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.73 
 
 
782 aa  239  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  28.73 
 
 
782 aa  239  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.36 
 
 
797 aa  236  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  29.78 
 
 
689 aa  227  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  28.74 
 
 
717 aa  226  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  26.62 
 
 
822 aa  226  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  28.33 
 
 
809 aa  225  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  26.14 
 
 
903 aa  225  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  27.61 
 
 
844 aa  224  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  28.88 
 
 
784 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  29 
 
 
771 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  28.11 
 
 
707 aa  221  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  26.76 
 
 
808 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  28.81 
 
 
783 aa  221  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  28.82 
 
 
715 aa  220  8.999999999999998e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  27.66 
 
 
831 aa  220  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  27.38 
 
 
714 aa  220  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.15 
 
 
771 aa  219  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3349  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  27.52 
 
 
828 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.407234  normal  0.217544 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  26.22 
 
 
822 aa  218  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4238  molybdopterin oxidoreductase  26.65 
 
 
828 aa  218  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  29.99 
 
 
791 aa  217  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  27.82 
 
 
797 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  27.45 
 
 
686 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  28.65 
 
 
779 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  28.38 
 
 
777 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  29.27 
 
 
783 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  28.34 
 
 
777 aa  215  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.66 
 
 
923 aa  212  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.44 
 
 
771 aa  212  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  26.68 
 
 
679 aa  212  3e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  27.3 
 
 
689 aa  211  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.51 
 
 
788 aa  211  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.47 
 
 
823 aa  211  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  24.15 
 
 
783 aa  211  7e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.65 
 
 
913 aa  211  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  26.96 
 
 
826 aa  210  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  27.41 
 
 
710 aa  209  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>