More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2865 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  41.35 
 
 		 929 aa  656    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1122  NADH dehydrogenase subunit G  39.82 
 
 		 909 aa  636    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.741047  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2865  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  100 
 
 		 947 aa  1972    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119541  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2827  NADH dehydrogenase subunit G  38.22 
 
 		 910 aa  631  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0965571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2564  NADH dehydrogenase subunit G  38.56 
 
 		 905 aa  626  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02208  NADH dehydrogenase subunit G  37.65 
 
 		 910 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02168  hypothetical protein  37.65 
 
 		 910 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28490  NADH dehydrogenase subunit G  39.57 
 
 		 903 aa  623  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1369  NADH dehydrogenase subunit G  37.54 
 
 		 908 aa  621  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852491  normal  0.369744 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1374  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.54 
 
 		 908 aa  621  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00828707  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2659  NADH dehydrogenase subunit G  37.79 
 
 		 908 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322834  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2576  NADH dehydrogenase subunit G  37.43 
 
 		 908 aa  619  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2432  NADH dehydrogenase subunit G  37.54 
 
 		 908 aa  621  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2437  NADH dehydrogenase subunit G  37.43 
 
 		 908 aa  618  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1018  NADH dehydrogenase subunit G  38.57 
 
 		 942 aa  617  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181039  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3422  NADH dehydrogenase subunit G  37.43 
 
 		 908 aa  617  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3820  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.08 
 
 		 899 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2669  NADH dehydrogenase subunit G  37.95 
 
 		 908 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1016  NADH dehydrogenase subunit G  39.18 
 
 		 909 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2462  NADH dehydrogenase subunit G  38.13 
 
 		 908 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289624  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2562  NADH dehydrogenase subunit G  37.95 
 
 		 908 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2551  NADH dehydrogenase subunit G  37.95 
 
 		 908 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0113562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1811  NADH dehydrogenase subunit G  39.23 
 
 		 914 aa  612  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.821067 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1459  NADH dehydrogenase subunit G  39.23 
 
 		 914 aa  611  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2507  NADH dehydrogenase subunit G  37.95 
 
 		 908 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1565  NADH dehydrogenase subunit G  39.23 
 
 		 914 aa  611  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29940  NADH dehydrogenase subunit G  38.25 
 
 		 905 aa  612  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1497  NADH dehydrogenase subunit G  38.67 
 
 		 908 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.838261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3202  NADH dehydrogenase subunit G  40.8 
 
 		 905 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119939  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3608  NADH dehydrogenase subunit G  41.22 
 
 		 904 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0967194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3303  NADH dehydrogenase subunit G  39.52 
 
 		 915 aa  603  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113952  normal  0.988711 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1399  NADH dehydrogenase subunit G  39.36 
 
 		 908 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3370  NADH dehydrogenase I, G subunit  40.56 
 
 		 905 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2767  NADH dehydrogenase subunit G  38.56 
 
 		 908 aa  601  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2545  NADH dehydrogenase subunit G  38.67 
 
 		 908 aa  599  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0568157  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0376  NADH dehydrogenase subunit G  38.31 
 
 		 909 aa  594  1e-168  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0886279  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2417  NADH dehydrogenase subunit G  40.26 
 
 		 902 aa  586  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58498  normal  0.233551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3127  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.85 
 
 		 920 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4124  NADH dehydrogenase subunit G  40.23 
 
 		 904 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1741  NADH dehydrogenase subunit G  40.46 
 
 		 904 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0398307  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3696  NADH dehydrogenase subunit G  40.33 
 
 		 904 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1868  NADH dehydrogenase subunit G  40.33 
 
 		 904 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.052963 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1115  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.13 
 
 		 902 aa  568  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0713  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.63 
 
 		 896 aa  562  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1694  NADH dehydrogenase subunit G  34.78 
 
 		 1010 aa  547  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4738  NADH dehydrogenase subunit G  35.38 
 
 		 877 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656278  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  35.91 
 
 		 872 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  37.94 
 
 		 871 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1352  NADH dehydrogenase subunit G  37.43 
 
 		 872 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.236873 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  44.07 
 
 		 1039 aa  480  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  44.24 
 
 		 1030 aa  477  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1694  NADH dehydrogenase subunit G  43.25 
 
 		 860 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0130655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0105  NADH dehydrogenase subunit G  42.18 
 
 		 860 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.831692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1741  NADH dehydrogenase subunit G  42.18 
 
 		 860 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.217192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1954  NADH dehydrogenase subunit G  32.82 
 
 		 818 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  34.82 
 
 		 798 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0326  NADH dehydrogenase subunit G  33.69 
 
 		 631 aa  351  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  32.2 
 
 		 677 aa  331  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  40.49 
 
 		 642 aa  317  5e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0157  NADH dehydrogenase subunit G  31.82 
 
 		 648 aa  302  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.735826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  31.77 
 
 		 648 aa  300  8e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  26.28 
 
 		 797 aa  244  7e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  27.04 
 
 		 782 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  27.04 
 
 		 782 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.33 
 
 		 913 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3132  molybdopterin oxidoreductase  25.61 
 
 		 815 aa  232  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  27.32 
 
 		 795 aa  224  6e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  26.84 
 
 		 923 aa  221  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3920  molybdopterin oxidoreductase  25.11 
 
 		 821 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.403816  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  25.77 
 
 		 771 aa  219  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4238  molybdopterin oxidoreductase  25.73 
 
 		 828 aa  217  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  26.8 
 
 		 777 aa  215  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  26.55 
 
 		 777 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  24.75 
 
 		 784 aa  214  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  26.72 
 
 		 809 aa  214  7e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  26.7 
 
 		 903 aa  213  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  26.88 
 
 		 918 aa  213  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4004  molybdopterin oxidoreductase  24.79 
 
 		 821 aa  213  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08061e-23 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  27.11 
 
 		 685 aa  213  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  26 
 
 		 822 aa  213  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  24.85 
 
 		 717 aa  211  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0421  NADH dehydrogenase subunit G  26.09 
 
 		 683 aa  209  3e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  26.89 
 
 		 788 aa  209  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  24.89 
 
 		 776 aa  208  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  25.67 
 
 		 808 aa  207  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  27.11 
 
 		 777 aa  207  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3349  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  25.03 
 
 		 828 aa  207  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.407234  normal  0.217544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  26.42 
 
 		 776 aa  207  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  25.07 
 
 		 682 aa  205  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  25.62 
 
 		 689 aa  205  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  24.78 
 
 		 683 aa  204  4e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  25.38 
 
 		 715 aa  205  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  26.07 
 
 		 797 aa  204  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  26.4 
 
 		 776 aa  204  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  26.14 
 
 		 776 aa  204  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  24.57 
 
 		 826 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  27.33 
 
 		 783 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  24.31 
 
 		 787 aa  203  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  26.25 
 
 		 776 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  26.47 
 
 		 776 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>