More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3389 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  51.96 
 
 		 913 aa  895    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  85.05 
 
 		 918 aa  1555    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  54.17 
 
 		 903 aa  925    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  100 
 
 		 923 aa  1873    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4238  molybdopterin oxidoreductase  33.59 
 
 		 828 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  34.15 
 
 		 826 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  33.23 
 
 		 899 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.19 
 
 		 898 aa  423  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3349  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  35.78 
 
 		 828 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.407234  normal  0.217544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.68 
 
 		 893 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3132  molybdopterin oxidoreductase  37.48 
 
 		 815 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3920  molybdopterin oxidoreductase  36.02 
 
 		 821 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.403816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.36 
 
 		 900 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.26 
 
 		 893 aa  405  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4004  molybdopterin oxidoreductase  36.16 
 
 		 821 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08061e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.83 
 
 		 893 aa  398  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.24 
 
 		 823 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.2 
 
 		 917 aa  391  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.99 
 
 		 920 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1538  molybdopterin oxidoreductase  35.31 
 
 		 879 aa  384  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.65 
 
 		 886 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  30.26 
 
 		 844 aa  369  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.53 
 
 		 788 aa  363  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.05 
 
 		 900 aa  362  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  36.12 
 
 		 797 aa  361  4e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.1 
 
 		 911 aa  359  9.999999999999999e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.72 
 
 		 903 aa  357  3.9999999999999996e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.7 
 
 		 904 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0544  NADH dehydrogenase subunit G  36.02 
 
 		 835 aa  357  5e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242771  normal  0.39762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  32.91 
 
 		 831 aa  357  7.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.42 
 
 		 782 aa  350  5e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  35.42 
 
 		 782 aa  350  5e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.57 
 
 		 901 aa  347  8e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  35.21 
 
 		 839 aa  345  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.06 
 
 		 801 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  37.48 
 
 		 799 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4059  NADH dehydrogenase subunit G  35.47 
 
 		 839 aa  343  8e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  35.03 
 
 		 784 aa  343  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  32.64 
 
 		 822 aa  343  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  35.68 
 
 		 829 aa  342  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.03 
 
 		 1000 aa  342  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.27 
 
 		 960 aa  341  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  33.43 
 
 		 809 aa  340  9.999999999999999e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.17 
 
 		 960 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  33.74 
 
 		 777 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  35.81 
 
 		 839 aa  338  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  33.48 
 
 		 717 aa  338  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1080  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  29.65 
 
 		 960 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  32.38 
 
 		 822 aa  337  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  32.84 
 
 		 777 aa  337  5.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0590  molybdopterin oxidoreductase  35.27 
 
 		 807 aa  337  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.726223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.65 
 
 		 983 aa  337  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.79 
 
 		 984 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.79 
 
 		 984 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.79 
 
 		 984 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.79 
 
 		 984 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6088  NADH dehydrogenase subunit G  43.29 
 
 		 863 aa  336  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.012959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.06 
 
 		 960 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2741  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.63 
 
 		 960 aa  335  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.313061 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.79 
 
 		 984 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  33.65 
 
 		 777 aa  335  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2853  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.23 
 
 		 960 aa  335  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.771386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  31.07 
 
 		 982 aa  335  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.4 
 
 		 947 aa  334  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.03 
 
 		 959 aa  334  5e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  31.66 
 
 		 984 aa  334  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  33.29 
 
 		 715 aa  333  7.000000000000001e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.38 
 
 		 982 aa  333  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.53 
 
 		 944 aa  333  8e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.3 
 
 		 984 aa  332  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.66 
 
 		 984 aa  333  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.21 
 
 		 948 aa  333  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.81 
 
 		 959 aa  332  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.28 
 
 		 983 aa  331  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  32.57 
 
 		 808 aa  331  4e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0915  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.65 
 
 		 721 aa  331  4e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3174  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  41.56 
 
 		 777 aa  331  4e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  33.99 
 
 		 787 aa  330  6e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.1 
 
 		 946 aa  330  8e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  35.61 
 
 		 776 aa  330  9e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  33.99 
 
 		 787 aa  330  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  35.42 
 
 		 776 aa  329  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  34.93 
 
 		 776 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.3 
 
 		 983 aa  328  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.05 
 
 		 946 aa  328  4.0000000000000003e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  33.82 
 
 		 779 aa  327  5e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  35.52 
 
 		 776 aa  327  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.95 
 
 		 952 aa  327  6e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2710  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.54 
 
 		 884 aa  327  6e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.95 
 
 		 994 aa  327  7e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.22 
 
 		 959 aa  327  8.000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  34.9 
 
 		 776 aa  327  9e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.56 
 
 		 905 aa  326  9e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  35.34 
 
 		 827 aa  326  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3925  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.51 
 
 		 959 aa  326  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  28.14 
 
 		 977 aa  326  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  34.9 
 
 		 776 aa  326  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.49 
 
 		 959 aa  325  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.09 
 
 		 983 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.07 
 
 		 983 aa  326  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>