More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6088 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5059  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  63.37 
 
 		 830 aa  924    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4412  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  65.12 
 
 		 815 aa  947    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07440  NADH dehydrogenase subunit G  55.36 
 
 		 879 aa  810    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0653934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0590  molybdopterin oxidoreductase  61.65 
 
 		 807 aa  952    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.726223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1879  NADH dehydrogenase subunit G  63.24 
 
 		 799 aa  904    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.780009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0526  NADH dehydrogenase subunit G  55.38 
 
 		 811 aa  781    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4059  NADH dehydrogenase subunit G  62.03 
 
 		 839 aa  943    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  65.05 
 
 		 827 aa  982    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0273  NADH dehydrogenase subunit G  61.04 
 
 		 830 aa  913    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  64.43 
 
 		 799 aa  978    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4552  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  62.41 
 
 		 818 aa  926    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1598  NADH dehydrogenase subunit G  65.36 
 
 		 801 aa  945    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  63.49 
 
 		 801 aa  947    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0544  NADH dehydrogenase subunit G  80.79 
 
 		 835 aa  1319    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242771  normal  0.39762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6676  NADH dehydrogenase subunit G  62.47 
 
 		 815 aa  946    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0396  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  60.54 
 
 		 799 aa  867    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0545  NADH dehydrogenase subunit G  52.85 
 
 		 862 aa  829    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.941021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  61.49 
 
 		 839 aa  932    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3174  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  60.85 
 
 		 777 aa  828    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0980  NADH dehydrogenase subunit G  58.7 
 
 		 854 aa  861    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3223  NADH dehydrogenase subunit G  55.73 
 
 		 820 aa  778    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1544  NADH dehydrogenase subunit G  64.98 
 
 		 801 aa  937    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  61.59 
 
 		 839 aa  949    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1574  NADH dehydrogenase subunit G  65.36 
 
 		 801 aa  945    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2710  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  57.62 
 
 		 884 aa  858    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1280  NADH-quinone oxidoreductase chain G  59.54 
 
 		 797 aa  912    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.47873 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13172  NADH dehydrogenase subunit G  63.26 
 
 		 806 aa  966    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0475  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  54.89 
 
 		 868 aa  780    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6088  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 863 aa  1700    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.012959 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  60.24 
 
 		 829 aa  936    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.57 
 
 		 913 aa  399  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.52 
 
 		 903 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.94 
 
 		 823 aa  366  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.26 
 
 		 918 aa  363  6e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.03 
 
 		 923 aa  347  8e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.7 
 
 		 833 aa  344  4e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  34.54 
 
 		 782 aa  344  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.54 
 
 		 782 aa  344  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  32.4 
 
 		 850 aa  339  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.19 
 
 		 788 aa  339  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  32.47 
 
 		 797 aa  323  8e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  35.02 
 
 		 795 aa  321  5e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  32.86 
 
 		 744 aa  320  7.999999999999999e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.13 
 
 		 798 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  31.59 
 
 		 899 aa  315  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.4 
 
 		 893 aa  314  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  33.15 
 
 		 715 aa  314  4.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  33.79 
 
 		 791 aa  309  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  30.83 
 
 		 787 aa  308  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  35.56 
 
 		 791 aa  308  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  32.55 
 
 		 797 aa  308  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  30.83 
 
 		 787 aa  307  5.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.88 
 
 		 797 aa  305  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  33.83 
 
 		 710 aa  305  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  33.16 
 
 		 744 aa  304  6.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  34.03 
 
 		 776 aa  302  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.28 
 
 		 898 aa  302  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  32.88 
 
 		 790 aa  301  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  35.45 
 
 		 776 aa  300  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  28.9 
 
 		 844 aa  298  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  32.62 
 
 		 744 aa  298  3e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  33.51 
 
 		 739 aa  298  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  35.45 
 
 		 776 aa  298  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  35.61 
 
 		 776 aa  297  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  35.61 
 
 		 776 aa  296  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  34.02 
 
 		 777 aa  296  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  32.6 
 
 		 707 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  35.03 
 
 		 776 aa  295  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  30.8 
 
 		 783 aa  294  4e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  34.3 
 
 		 776 aa  293  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 		 721 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  32.2 
 
 		 717 aa  292  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  35.34 
 
 		 776 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  32.94 
 
 		 784 aa  291  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  35.34 
 
 		 776 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  35.34 
 
 		 776 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  35.34 
 
 		 776 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  35.34 
 
 		 776 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  31.1 
 
 		 771 aa  291  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  35.34 
 
 		 776 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  30.47 
 
 		 809 aa  290  6e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  30.81 
 
 		 783 aa  290  8e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  34.23 
 
 		 777 aa  289  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  34.65 
 
 		 682 aa  289  1e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3639  molybdopterin oxidoreductase  28.1 
 
 		 843 aa  290  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.424964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  35.19 
 
 		 776 aa  290  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.82 
 
 		 771 aa  288  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0661  molybdopterin oxidoreductase  30.15 
 
 		 808 aa  288  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  32.51 
 
 		 714 aa  288  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  32.5 
 
 		 719 aa  287  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.36 
 
 		 893 aa  287  5.999999999999999e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  31.38 
 
 		 777 aa  286  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  30.92 
 
 		 822 aa  286  9e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  34.45 
 
 		 716 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  35.28 
 
 		 776 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  32.34 
 
 		 808 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  32.56 
 
 		 783 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.75 
 
 		 796 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.97 
 
 		 771 aa  283  8.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  32.19 
 
 		 700 aa  283  9e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>