More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0545 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  55.2 
 
 
799 aa  853    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6088  NADH dehydrogenase subunit G  52.85 
 
 
863 aa  794    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.012959 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2710  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  63.21 
 
 
884 aa  1007    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0396  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  53.59 
 
 
799 aa  786    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4412  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  55.06 
 
 
815 aa  816    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1879  NADH dehydrogenase subunit G  55.31 
 
 
799 aa  810    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.780009  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0273  NADH dehydrogenase subunit G  51.33 
 
 
830 aa  751    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1280  NADH-quinone oxidoreductase chain G  52.05 
 
 
797 aa  815    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.47873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1544  NADH dehydrogenase subunit G  54.9 
 
 
801 aa  817    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  56.24 
 
 
827 aa  855    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5059  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  52.56 
 
 
830 aa  807    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697317  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6676  NADH dehydrogenase subunit G  54.08 
 
 
815 aa  815    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4552  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  52.84 
 
 
818 aa  810    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0526  NADH dehydrogenase subunit G  53.53 
 
 
811 aa  828    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0590  molybdopterin oxidoreductase  53.12 
 
 
807 aa  821    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.726223  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  52.57 
 
 
839 aa  821    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0544  NADH dehydrogenase subunit G  53.31 
 
 
835 aa  835    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242771  normal  0.39762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3174  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  53.98 
 
 
777 aa  741    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4059  NADH dehydrogenase subunit G  52.33 
 
 
839 aa  823    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0475  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  60.69 
 
 
868 aa  937    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3223  NADH dehydrogenase subunit G  56.56 
 
 
820 aa  874    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0251183 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13172  NADH dehydrogenase subunit G  55.85 
 
 
806 aa  855    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0980  NADH dehydrogenase subunit G  51.07 
 
 
854 aa  745    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0545  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 
862 aa  1734    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.941021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1574  NADH dehydrogenase subunit G  55.14 
 
 
801 aa  821    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  51.44 
 
 
839 aa  798    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1598  NADH dehydrogenase subunit G  55.14 
 
 
801 aa  821    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  53.94 
 
 
829 aa  833    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07440  NADH dehydrogenase subunit G  65.85 
 
 
879 aa  1058    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0653934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  53.83 
 
 
801 aa  833    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.07 
 
 
913 aa  332  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  28.37 
 
 
899 aa  314  4.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  30.58 
 
 
797 aa  310  8e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.39 
 
 
782 aa  308  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  31.39 
 
 
782 aa  308  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.3 
 
 
823 aa  303  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.2 
 
 
903 aa  300  8e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.74 
 
 
923 aa  295  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.38 
 
 
918 aa  295  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  31.24 
 
 
795 aa  287  5.999999999999999e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.55 
 
 
833 aa  286  9e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.24 
 
 
797 aa  285  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.69 
 
 
900 aa  282  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  31.84 
 
 
791 aa  281  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  30.23 
 
 
714 aa  280  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  30.5 
 
 
715 aa  279  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  28.64 
 
 
850 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.56 
 
 
893 aa  279  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.12 
 
 
788 aa  278  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  30.17 
 
 
717 aa  278  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  27.99 
 
 
783 aa  277  6e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  30.32 
 
 
721 aa  277  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.32 
 
 
798 aa  276  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.28 
 
 
770 aa  272  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  27.59 
 
 
783 aa  272  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  31.13 
 
 
784 aa  272  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.22 
 
 
898 aa  271  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  30.45 
 
 
710 aa  271  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  29.3 
 
 
791 aa  270  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  28.93 
 
 
700 aa  269  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  30.98 
 
 
771 aa  270  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  30.26 
 
 
776 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  30.94 
 
 
719 aa  268  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  30.2 
 
 
809 aa  266  8.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  30.32 
 
 
744 aa  266  8.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  30.58 
 
 
777 aa  266  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  31.47 
 
 
776 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  31.47 
 
 
776 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1538  molybdopterin oxidoreductase  28.11 
 
 
879 aa  265  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  30.68 
 
 
776 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  31.06 
 
 
776 aa  265  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  33.54 
 
 
808 aa  265  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  31.46 
 
 
680 aa  264  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  30.68 
 
 
776 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.85 
 
 
771 aa  264  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  31.43 
 
 
776 aa  264  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  28.08 
 
 
787 aa  264  6e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  30.07 
 
 
685 aa  264  6e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  29.27 
 
 
777 aa  263  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  28.08 
 
 
787 aa  263  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  29.47 
 
 
777 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  30.74 
 
 
669 aa  261  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  35.19 
 
 
797 aa  260  6e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  29.46 
 
 
783 aa  260  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  29.69 
 
 
682 aa  259  1e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  32.52 
 
 
689 aa  259  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  30.4 
 
 
739 aa  259  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  29.63 
 
 
776 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  29.63 
 
 
776 aa  259  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  29.63 
 
 
776 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  29.63 
 
 
776 aa  259  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  29.63 
 
 
776 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  29.87 
 
 
776 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  29.63 
 
 
776 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  28.31 
 
 
783 aa  258  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  28.41 
 
 
783 aa  258  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  34.32 
 
 
720 aa  258  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  34.77 
 
 
707 aa  257  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  31.32 
 
 
667 aa  257  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  31.03 
 
 
694 aa  256  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>