More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5059 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1280  NADH-quinone oxidoreductase chain G  57.92 
 
 
797 aa  867    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.47873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0980  NADH dehydrogenase subunit G  59.3 
 
 
854 aa  865    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0475  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  55.83 
 
 
868 aa  808    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3174  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  60.3 
 
 
777 aa  820    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  59.48 
 
 
839 aa  952    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13172  NADH dehydrogenase subunit G  62.88 
 
 
806 aa  953    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  61.03 
 
 
829 aa  934    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  76.27 
 
 
827 aa  1218    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4552  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  62.75 
 
 
818 aa  904    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0545  NADH dehydrogenase subunit G  52.56 
 
 
862 aa  832    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.941021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  67.45 
 
 
801 aa  1056    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4059  NADH dehydrogenase subunit G  58.58 
 
 
839 aa  907    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0590  molybdopterin oxidoreductase  68.51 
 
 
807 aa  1084    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.726223  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0544  NADH dehydrogenase subunit G  62.24 
 
 
835 aa  951    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242771  normal  0.39762 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3223  NADH dehydrogenase subunit G  57.93 
 
 
820 aa  808    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0251183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  59.07 
 
 
839 aa  903    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1598  NADH dehydrogenase subunit G  66.58 
 
 
801 aa  966    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6676  NADH dehydrogenase subunit G  62.92 
 
 
815 aa  943    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0396  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  61.75 
 
 
799 aa  890    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6088  NADH dehydrogenase subunit G  63.53 
 
 
863 aa  908    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.012959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1544  NADH dehydrogenase subunit G  66.71 
 
 
801 aa  965    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2710  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  59.51 
 
 
884 aa  874    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1574  NADH dehydrogenase subunit G  66.58 
 
 
801 aa  966    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  63.82 
 
 
799 aa  981    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5059  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  100 
 
 
830 aa  1661    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697317  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07440  NADH dehydrogenase subunit G  57.35 
 
 
879 aa  852    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0653934 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1879  NADH dehydrogenase subunit G  65.22 
 
 
799 aa  934    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.780009  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0526  NADH dehydrogenase subunit G  59.27 
 
 
811 aa  840    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0273  NADH dehydrogenase subunit G  62.59 
 
 
830 aa  921    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4412  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  69.18 
 
 
815 aa  1070    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.38 
 
 
913 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.91 
 
 
823 aa  389  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.57 
 
 
903 aa  347  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.36 
 
 
833 aa  347  5e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  32.18 
 
 
850 aa  344  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.82 
 
 
923 aa  337  7.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.25 
 
 
918 aa  335  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.12 
 
 
788 aa  327  6e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.88 
 
 
797 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.39 
 
 
782 aa  318  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  29.82 
 
 
899 aa  318  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  32.39 
 
 
782 aa  318  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1538  molybdopterin oxidoreductase  31.31 
 
 
879 aa  314  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  34.26 
 
 
797 aa  310  9e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.96 
 
 
798 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  31.3 
 
 
797 aa  303  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  33.89 
 
 
744 aa  300  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  32.89 
 
 
791 aa  301  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  33.75 
 
 
744 aa  300  9e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  35.46 
 
 
744 aa  297  5e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  32.85 
 
 
795 aa  295  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  35.99 
 
 
689 aa  290  8e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3292  NADH dehydrogenase subunit G  34.59 
 
 
691 aa  290  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.995096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2580  NADH dehydrogenase subunit G  34.88 
 
 
691 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.105022  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  28.03 
 
 
822 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4627  NADH dehydrogenase subunit G  35.8 
 
 
692 aa  284  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2879  NADH dehydrogenase subunit G  33.89 
 
 
691 aa  280  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.644938  normal  0.120527 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  32.79 
 
 
685 aa  280  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  32.93 
 
 
670 aa  278  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2827  NADH dehydrogenase subunit G  35.03 
 
 
686 aa  278  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.655346  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  34.95 
 
 
667 aa  278  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2410  NADH dehydrogenase subunit G  34.34 
 
 
692 aa  277  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  hitchhiker  0.00632886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.95 
 
 
771 aa  277  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  29.37 
 
 
844 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1361  NADH dehydrogenase subunit G  34.01 
 
 
699 aa  276  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587534  normal  0.089712 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  27.48 
 
 
822 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.59 
 
 
898 aa  276  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1267  NADH dehydrogenase subunit G  31.83 
 
 
693 aa  275  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555052  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  27.75 
 
 
831 aa  275  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.64 
 
 
796 aa  275  4.0000000000000004e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2214  NADH dehydrogenase subunit G  34.28 
 
 
691 aa  275  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  31.04 
 
 
717 aa  274  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  29.88 
 
 
783 aa  273  9e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  30.38 
 
 
682 aa  271  2.9999999999999997e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  32.04 
 
 
783 aa  271  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1359  NADH dehydrogenase subunit G  32.29 
 
 
693 aa  271  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113832  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  30.8 
 
 
783 aa  270  8e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  31.76 
 
 
694 aa  270  8.999999999999999e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0803  NADH dehydrogenase subunit G  31.76 
 
 
694 aa  270  8.999999999999999e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.727429  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  33.49 
 
 
739 aa  270  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4132  NADH dehydrogenase subunit G  33.79 
 
 
693 aa  269  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.915862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  32.11 
 
 
791 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4555  NADH dehydrogenase subunit G  32.15 
 
 
689 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  32.98 
 
 
680 aa  267  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1881  NADH dehydrogenase subunit G  33.23 
 
 
691 aa  266  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.296161 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  33.84 
 
 
689 aa  266  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.29 
 
 
771 aa  266  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  30.92 
 
 
694 aa  266  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  33.54 
 
 
686 aa  265  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.73 
 
 
893 aa  265  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1182  NADH dehydrogenase subunit G  33.65 
 
 
673 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.577988  normal  0.579246 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  31.97 
 
 
784 aa  265  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1028  NADH dehydrogenase subunit G  31.41 
 
 
693 aa  265  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  29.21 
 
 
826 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  28.84 
 
 
787 aa  264  4.999999999999999e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  31.36 
 
 
783 aa  264  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4004  molybdopterin oxidoreductase  30.3 
 
 
821 aa  263  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08061e-23 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  28.84 
 
 
787 aa  263  8e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  31.07 
 
 
783 aa  263  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1183  NADH dehydrogenase subunit G  33.38 
 
 
672 aa  263  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.551845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>