More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2689 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0273  NADH dehydrogenase subunit G  64.9 
 
 
830 aa  972    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6088  NADH dehydrogenase subunit G  65.92 
 
 
863 aa  975    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.012959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0526  NADH dehydrogenase subunit G  60.57 
 
 
811 aa  879    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4059  NADH dehydrogenase subunit G  61.56 
 
 
839 aa  958    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  67.51 
 
 
799 aa  1033    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0980  NADH dehydrogenase subunit G  61.59 
 
 
854 aa  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 
827 aa  1654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  63.35 
 
 
839 aa  1012    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4412  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  74.48 
 
 
815 aa  1137    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1544  NADH dehydrogenase subunit G  67.65 
 
 
801 aa  998    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07440  NADH dehydrogenase subunit G  59.08 
 
 
879 aa  886    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0653934 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1598  NADH dehydrogenase subunit G  67.65 
 
 
801 aa  997    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3223  NADH dehydrogenase subunit G  58.63 
 
 
820 aa  845    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0251183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  62.3 
 
 
839 aa  952    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13172  NADH dehydrogenase subunit G  66.83 
 
 
806 aa  1020    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0544  NADH dehydrogenase subunit G  64.52 
 
 
835 aa  1025    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242771  normal  0.39762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3174  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  62.41 
 
 
777 aa  863    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  61.61 
 
 
829 aa  952    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6676  NADH dehydrogenase subunit G  63.81 
 
 
815 aa  974    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0475  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  56.11 
 
 
868 aa  823    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2710  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  59.95 
 
 
884 aa  911    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5059  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  76.27 
 
 
830 aa  1226    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697317  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1879  NADH dehydrogenase subunit G  67.87 
 
 
799 aa  970    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.780009  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0590  molybdopterin oxidoreductase  72.56 
 
 
807 aa  1162    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.726223  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1574  NADH dehydrogenase subunit G  67.65 
 
 
801 aa  997    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0545  NADH dehydrogenase subunit G  56.36 
 
 
862 aa  885    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.941021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0396  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  63.38 
 
 
799 aa  935    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1280  NADH-quinone oxidoreductase chain G  61.55 
 
 
797 aa  946    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.47873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4552  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  63.5 
 
 
818 aa  956    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  72.36 
 
 
801 aa  1137    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.54 
 
 
823 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.92 
 
 
913 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.62 
 
 
833 aa  355  1e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.82 
 
 
903 aa  350  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.63 
 
 
923 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.68 
 
 
918 aa  335  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.3 
 
 
797 aa  333  6e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  31.4 
 
 
850 aa  332  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  32.29 
 
 
782 aa  330  7e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.29 
 
 
782 aa  330  7e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.86 
 
 
788 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  34.59 
 
 
797 aa  320  5e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  34.17 
 
 
795 aa  318  3e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  32.35 
 
 
744 aa  311  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.27 
 
 
798 aa  310  9e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  29.26 
 
 
899 aa  308  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  34.99 
 
 
791 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  32.8 
 
 
744 aa  300  5e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  33.41 
 
 
797 aa  297  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1538  molybdopterin oxidoreductase  29.44 
 
 
879 aa  296  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  31.56 
 
 
844 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  32.08 
 
 
744 aa  295  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  32.85 
 
 
685 aa  294  5e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  28.45 
 
 
822 aa  290  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  33.66 
 
 
670 aa  288  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0915  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.67 
 
 
721 aa  288  2.9999999999999996e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4627  NADH dehydrogenase subunit G  35.99 
 
 
692 aa  288  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 
739 aa  287  5e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1182  NADH dehydrogenase subunit G  34.6 
 
 
673 aa  287  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.577988  normal  0.579246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  29.41 
 
 
831 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  34.14 
 
 
680 aa  285  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.1 
 
 
898 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1361  NADH dehydrogenase subunit G  34.32 
 
 
699 aa  284  5.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587534  normal  0.089712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  31.94 
 
 
791 aa  282  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.86 
 
 
900 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  31.72 
 
 
717 aa  281  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  30.52 
 
 
682 aa  281  4e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  31.35 
 
 
790 aa  281  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1267  NADH dehydrogenase subunit G  33.63 
 
 
693 aa  280  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555052  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  29.97 
 
 
822 aa  280  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3292  NADH dehydrogenase subunit G  33.63 
 
 
691 aa  280  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.995096  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  33.98 
 
 
689 aa  279  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  34.91 
 
 
667 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4555  NADH dehydrogenase subunit G  32.82 
 
 
689 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.86 
 
 
771 aa  277  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2580  NADH dehydrogenase subunit G  33.04 
 
 
691 aa  277  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.105022  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0803  NADH dehydrogenase subunit G  33.68 
 
 
694 aa  277  7e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.727429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  33.68 
 
 
694 aa  276  8e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  27.96 
 
 
826 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.92 
 
 
893 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  32.27 
 
 
784 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  40.9 
 
 
689 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2521  NADH dehydrogenase subunit G  34.68 
 
 
654 aa  275  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  31.27 
 
 
783 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  30.38 
 
 
700 aa  273  7e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  31.24 
 
 
776 aa  273  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3132  molybdopterin oxidoreductase  27.77 
 
 
815 aa  273  7e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.37 
 
 
796 aa  273  7e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  31.71 
 
 
714 aa  273  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  32.94 
 
 
694 aa  273  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1359  NADH dehydrogenase subunit G  32.78 
 
 
693 aa  273  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113832  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2214  NADH dehydrogenase subunit G  33.48 
 
 
691 aa  273  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2410  NADH dehydrogenase subunit G  33.04 
 
 
692 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  hitchhiker  0.00632886 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  30.1 
 
 
783 aa  271  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0751  NADH dehydrogenase subunit G  32.69 
 
 
660 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0442747  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2879  NADH dehydrogenase subunit G  32.79 
 
 
691 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.644938  normal  0.120527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1028  NADH dehydrogenase subunit G  33.99 
 
 
693 aa  271  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  32.93 
 
 
686 aa  271  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  31.84 
 
 
721 aa  269  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.8 
 
 
771 aa  269  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>