More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7685 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3174  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  57.81 
 
 
777 aa  780    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1879  NADH dehydrogenase subunit G  61.85 
 
 
799 aa  893    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.780009  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0526  NADH dehydrogenase subunit G  55.7 
 
 
811 aa  804    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4059  NADH dehydrogenase subunit G  59.47 
 
 
839 aa  934    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1598  NADH dehydrogenase subunit G  62.45 
 
 
801 aa  920    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 
839 aa  1678    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6676  NADH dehydrogenase subunit G  57.88 
 
 
815 aa  856    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5059  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  59.48 
 
 
830 aa  930    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697317  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1280  NADH-quinone oxidoreductase chain G  58.43 
 
 
797 aa  897    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.47873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  63.35 
 
 
827 aa  983    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0590  molybdopterin oxidoreductase  61.67 
 
 
807 aa  959    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.726223  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3223  NADH dehydrogenase subunit G  53.44 
 
 
820 aa  750    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0251183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0475  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  51.35 
 
 
868 aa  723    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  63.24 
 
 
799 aa  956    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4412  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  63.13 
 
 
815 aa  955    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0545  NADH dehydrogenase subunit G  51.44 
 
 
862 aa  798    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.941021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2710  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  56.92 
 
 
884 aa  859    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4552  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  60.71 
 
 
818 aa  891    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0544  NADH dehydrogenase subunit G  60.84 
 
 
835 aa  962    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242771  normal  0.39762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6088  NADH dehydrogenase subunit G  61.98 
 
 
863 aa  927    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.012959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0980  NADH dehydrogenase subunit G  54.32 
 
 
854 aa  792    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07440  NADH dehydrogenase subunit G  54.13 
 
 
879 aa  801    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0653934 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0396  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  59.59 
 
 
799 aa  867    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1574  NADH dehydrogenase subunit G  62.45 
 
 
801 aa  920    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  62.94 
 
 
801 aa  966    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1544  NADH dehydrogenase subunit G  62.58 
 
 
801 aa  921    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  55.76 
 
 
829 aa  843    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  59.52 
 
 
839 aa  926    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13172  NADH dehydrogenase subunit G  62.99 
 
 
806 aa  984    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0273  NADH dehydrogenase subunit G  58.86 
 
 
830 aa  883    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.83 
 
 
823 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.19 
 
 
913 aa  366  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.66 
 
 
923 aa  331  4e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.58 
 
 
918 aa  326  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.87 
 
 
903 aa  325  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.43 
 
 
833 aa  323  9.999999999999999e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  31.37 
 
 
899 aa  313  9e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.4 
 
 
797 aa  310  5e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  29.58 
 
 
850 aa  310  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.05 
 
 
782 aa  305  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  33.98 
 
 
797 aa  305  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  31.05 
 
 
782 aa  305  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.86 
 
 
788 aa  304  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  36.23 
 
 
791 aa  297  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  30.31 
 
 
783 aa  293  8e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  31.73 
 
 
791 aa  293  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  30.2 
 
 
783 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.29 
 
 
798 aa  290  7e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  30.89 
 
 
790 aa  289  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1538  molybdopterin oxidoreductase  28.36 
 
 
879 aa  289  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  36.54 
 
 
689 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.28 
 
 
796 aa  284  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  32.93 
 
 
795 aa  281  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  30.71 
 
 
783 aa  279  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  31.62 
 
 
700 aa  279  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  32.51 
 
 
717 aa  278  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  32.13 
 
 
797 aa  278  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  32.4 
 
 
714 aa  276  9e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  31.12 
 
 
682 aa  276  1.0000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.32 
 
 
893 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  31.02 
 
 
844 aa  274  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  32.45 
 
 
715 aa  274  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  32.51 
 
 
707 aa  273  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  31.23 
 
 
777 aa  272  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.12 
 
 
898 aa  272  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  33.23 
 
 
686 aa  272  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.39 
 
 
900 aa  272  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  30.23 
 
 
777 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  30.98 
 
 
777 aa  270  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  32.6 
 
 
689 aa  270  8e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  32.28 
 
 
721 aa  270  8.999999999999999e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  31.34 
 
 
776 aa  269  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  30.33 
 
 
783 aa  270  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  32.45 
 
 
710 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  37.91 
 
 
685 aa  266  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  32.02 
 
 
776 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1182  NADH dehydrogenase subunit G  33.44 
 
 
673 aa  266  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.577988  normal  0.579246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.74 
 
 
893 aa  265  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  32.17 
 
 
776 aa  265  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  31.43 
 
 
783 aa  264  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3639  molybdopterin oxidoreductase  27.8 
 
 
843 aa  264  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.424964  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  31.14 
 
 
776 aa  263  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  28.96 
 
 
787 aa  263  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  32.12 
 
 
776 aa  263  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  30.99 
 
 
776 aa  263  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  29.87 
 
 
808 aa  263  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  31.19 
 
 
744 aa  262  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  31.67 
 
 
784 aa  262  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  31.03 
 
 
744 aa  262  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  32.02 
 
 
776 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  28.96 
 
 
787 aa  262  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  29.32 
 
 
777 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  30.43 
 
 
744 aa  261  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  32.69 
 
 
670 aa  261  4e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1320  NADH dehydrogenase subunit G  33.23 
 
 
672 aa  261  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568369  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  36.9 
 
 
680 aa  260  9e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  32.98 
 
 
776 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  32.98 
 
 
776 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  32.98 
 
 
776 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1361  NADH dehydrogenase subunit G  32.98 
 
 
699 aa  259  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587534  normal  0.089712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>