More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0287 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_07440  NADH dehydrogenase subunit G  55.14 
 
 
879 aa  827    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0653934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  100 
 
 
801 aa  1606    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6676  NADH dehydrogenase subunit G  60.59 
 
 
815 aa  926    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  62.94 
 
 
839 aa  986    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13172  NADH dehydrogenase subunit G  64.54 
 
 
806 aa  996    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0526  NADH dehydrogenase subunit G  57.5 
 
 
811 aa  827    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  72.36 
 
 
827 aa  1120    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5059  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  67.78 
 
 
830 aa  1051    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697317  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3174  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  60.25 
 
 
777 aa  848    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1598  NADH dehydrogenase subunit G  63.34 
 
 
801 aa  935    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0475  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  54.09 
 
 
868 aa  792    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0980  NADH dehydrogenase subunit G  55.32 
 
 
854 aa  820    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4552  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  62.02 
 
 
818 aa  901    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1280  NADH-quinone oxidoreductase chain G  59.45 
 
 
797 aa  917    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.47873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0544  NADH dehydrogenase subunit G  63.68 
 
 
835 aa  973    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242771  normal  0.39762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1544  NADH dehydrogenase subunit G  63.34 
 
 
801 aa  933    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0590  molybdopterin oxidoreductase  79.48 
 
 
807 aa  1286    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.726223  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  58.52 
 
 
829 aa  891    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3223  NADH dehydrogenase subunit G  56.14 
 
 
820 aa  805    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0251183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  59.43 
 
 
839 aa  907    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1879  NADH dehydrogenase subunit G  65.23 
 
 
799 aa  933    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.780009  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0273  NADH dehydrogenase subunit G  60.44 
 
 
830 aa  916    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2710  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  56.52 
 
 
884 aa  863    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1574  NADH dehydrogenase subunit G  63.34 
 
 
801 aa  935    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4412  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  72.7 
 
 
815 aa  1147    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4059  NADH dehydrogenase subunit G  58.82 
 
 
839 aa  909    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  65.27 
 
 
799 aa  999    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0545  NADH dehydrogenase subunit G  53.83 
 
 
862 aa  850    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.941021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0396  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  62.29 
 
 
799 aa  902    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6088  NADH dehydrogenase subunit G  63.49 
 
 
863 aa  926    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.012959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.98 
 
 
913 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.47 
 
 
903 aa  364  3e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.28 
 
 
823 aa  357  3.9999999999999996e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.39 
 
 
782 aa  356  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  34.39 
 
 
782 aa  356  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.76 
 
 
918 aa  351  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.91 
 
 
923 aa  349  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  32.14 
 
 
850 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.23 
 
 
833 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.52 
 
 
788 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  34.63 
 
 
797 aa  332  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  36.2 
 
 
791 aa  324  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.6 
 
 
797 aa  323  6e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.57 
 
 
798 aa  323  7e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  32.01 
 
 
797 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  32.8 
 
 
744 aa  320  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  32.52 
 
 
899 aa  315  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  30.33 
 
 
787 aa  311  2.9999999999999997e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  30.33 
 
 
787 aa  310  5e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  35.78 
 
 
744 aa  310  9e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  33.5 
 
 
795 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  32.65 
 
 
790 aa  307  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  31.97 
 
 
682 aa  306  1.0000000000000001e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  35.46 
 
 
744 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  35.23 
 
 
680 aa  305  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  29.78 
 
 
783 aa  303  8.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  34.96 
 
 
670 aa  302  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  33 
 
 
739 aa  302  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  33.59 
 
 
717 aa  300  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  33.58 
 
 
791 aa  297  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  29.18 
 
 
783 aa  297  6e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  44.23 
 
 
689 aa  295  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  35.53 
 
 
689 aa  294  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  32.8 
 
 
721 aa  291  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.09 
 
 
796 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  32.5 
 
 
714 aa  289  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  32.42 
 
 
808 aa  290  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  33.18 
 
 
685 aa  289  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  32.84 
 
 
771 aa  289  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2580  NADH dehydrogenase subunit G  34.13 
 
 
691 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.105022  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  31.31 
 
 
777 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4555  NADH dehydrogenase subunit G  33.18 
 
 
689 aa  288  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  33.69 
 
 
715 aa  287  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  33.53 
 
 
783 aa  287  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.81 
 
 
771 aa  287  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  33.23 
 
 
783 aa  286  8e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3292  NADH dehydrogenase subunit G  33.93 
 
 
691 aa  286  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.995096  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  33.18 
 
 
783 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  31.27 
 
 
777 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  34.76 
 
 
667 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2214  NADH dehydrogenase subunit G  34.68 
 
 
691 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1361  NADH dehydrogenase subunit G  35.76 
 
 
699 aa  285  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587534  normal  0.089712 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  30.45 
 
 
683 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4627  NADH dehydrogenase subunit G  35.47 
 
 
692 aa  284  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  32.51 
 
 
707 aa  283  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.04 
 
 
900 aa  283  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  33.13 
 
 
784 aa  283  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2879  NADH dehydrogenase subunit G  33.53 
 
 
691 aa  283  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.644938  normal  0.120527 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0421  NADH dehydrogenase subunit G  30.84 
 
 
683 aa  282  2e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  31.42 
 
 
776 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  33.54 
 
 
710 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  33.85 
 
 
686 aa  281  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.87 
 
 
898 aa  280  6e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0803  NADH dehydrogenase subunit G  32.4 
 
 
694 aa  280  6e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.727429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  32.4 
 
 
694 aa  280  7e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  32.78 
 
 
720 aa  280  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  30.58 
 
 
700 aa  279  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85822  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 78K chain precursor, 5-prime end  32.9 
 
 
722 aa  278  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.28905  normal  0.0501454 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1538  molybdopterin oxidoreductase  36.81 
 
 
879 aa  278  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1182  NADH dehydrogenase subunit G  34.64 
 
 
673 aa  277  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.577988  normal  0.579246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>