More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07440 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0396  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  56.28 
 
 		 799 aa  810    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1280  NADH-quinone oxidoreductase chain G  54.94 
 
 		 797 aa  843    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.47873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6088  NADH dehydrogenase subunit G  55.83 
 
 		 863 aa  810    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.012959 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0475  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  63.79 
 
 		 868 aa  984    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  58.53 
 
 		 799 aa  904    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0590  molybdopterin oxidoreductase  54.71 
 
 		 807 aa  841    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.726223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  58.74 
 
 		 827 aa  902    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3174  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  56.18 
 
 		 777 aa  763    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07440  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 879 aa  1732    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0653934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  53.98 
 
 		 839 aa  833    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13172  NADH dehydrogenase subunit G  57.63 
 
 		 806 aa  897    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  57.19 
 
 		 829 aa  865    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3223  NADH dehydrogenase subunit G  61.26 
 
 		 820 aa  918    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251183 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5059  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  57.71 
 
 		 830 aa  871    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0544  NADH dehydrogenase subunit G  55.51 
 
 		 835 aa  861    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242771  normal  0.39762 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0545  NADH dehydrogenase subunit G  65.85 
 
 		 862 aa  1107    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.941021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4552  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  57.21 
 
 		 818 aa  847    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  55.3 
 
 		 801 aa  847    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2710  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  69.08 
 
 		 884 aa  1090    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0273  NADH dehydrogenase subunit G  52.74 
 
 		 830 aa  773    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  54.57 
 
 		 839 aa  834    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6676  NADH dehydrogenase subunit G  57.11 
 
 		 815 aa  833    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1574  NADH dehydrogenase subunit G  59.05 
 
 		 801 aa  864    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4412  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  57.92 
 
 		 815 aa  884    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0526  NADH dehydrogenase subunit G  56.83 
 
 		 811 aa  847    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1879  NADH dehydrogenase subunit G  59.88 
 
 		 799 aa  866    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.780009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1544  NADH dehydrogenase subunit G  59.17 
 
 		 801 aa  867    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4059  NADH dehydrogenase subunit G  53.86 
 
 		 839 aa  835    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0980  NADH dehydrogenase subunit G  53.45 
 
 		 854 aa  782    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1598  NADH dehydrogenase subunit G  59.05 
 
 		 801 aa  864    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.86 
 
 		 913 aa  337  7.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.02 
 
 		 823 aa  329  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.75 
 
 		 923 aa  317  8e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.33 
 
 		 918 aa  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  32.98 
 
 		 797 aa  313  6.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.18 
 
 		 798 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.09 
 
 		 903 aa  302  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  31.24 
 
 		 782 aa  301  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.24 
 
 		 782 aa  301  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  32.38 
 
 		 795 aa  297  5e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.01 
 
 		 797 aa  296  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.65 
 
 		 788 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  31.81 
 
 		 791 aa  292  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.33 
 
 		 833 aa  288  4e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  32.17 
 
 		 744 aa  287  5.999999999999999e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  31.48 
 
 		 715 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  32.85 
 
 		 797 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  27.44 
 
 		 899 aa  282  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  31.82 
 
 		 776 aa  277  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  31.82 
 
 		 776 aa  277  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  31.82 
 
 		 776 aa  277  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  31.82 
 
 		 776 aa  277  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  31.5 
 
 		 710 aa  278  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  31.82 
 
 		 776 aa  277  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  31.82 
 
 		 776 aa  277  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  31.69 
 
 		 776 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  30.89 
 
 		 784 aa  275  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  29.67 
 
 		 808 aa  275  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1538  molybdopterin oxidoreductase  29.89 
 
 		 879 aa  274  5.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  31.8 
 
 		 783 aa  273  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  32.33 
 
 		 744 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  31.14 
 
 		 776 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  35.97 
 
 		 739 aa  271  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  31.63 
 
 		 776 aa  271  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4555  NADH dehydrogenase subunit G  32.66 
 
 		 689 aa  270  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  29.76 
 
 		 700 aa  270  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  32.7 
 
 		 776 aa  269  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1359  NADH dehydrogenase subunit G  31.66 
 
 		 693 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  32.97 
 
 		 776 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  30.18 
 
 		 850 aa  268  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  29.86 
 
 		 717 aa  267  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.13 
 
 		 770 aa  266  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1267  NADH dehydrogenase subunit G  31.76 
 
 		 693 aa  266  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  32.3 
 
 		 776 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  32.3 
 
 		 776 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  32.57 
 
 		 776 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  31.99 
 
 		 744 aa  265  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  31.51 
 
 		 777 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  29.86 
 
 		 771 aa  265  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  32.61 
 
 		 776 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  31.46 
 
 		 777 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  32.64 
 
 		 680 aa  264  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  30.74 
 
 		 777 aa  264  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  26.62 
 
 		 783 aa  263  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  30 
 
 		 714 aa  263  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  31.01 
 
 		 720 aa  263  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  30.86 
 
 		 721 aa  263  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  27.64 
 
 		 783 aa  261  4e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  29.96 
 
 		 783 aa  261  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  31.61 
 
 		 670 aa  260  6e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  30.33 
 
 		 783 aa  260  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2214  NADH dehydrogenase subunit G  33.24 
 
 		 691 aa  260  8e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.85 
 
 		 771 aa  260  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.25 
 
 		 898 aa  259  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  30.97 
 
 		 719 aa  259  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  29.48 
 
 		 809 aa  259  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3292  NADH dehydrogenase subunit G  31.78 
 
 		 691 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.995096  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  32.14 
 
 		 694 aa  258  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.74 
 
 		 771 aa  257  8e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1881  NADH dehydrogenase subunit G  32.15 
 
 		 691 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.296161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>