More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0544 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0396  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  61 
 
 		 799 aa  858    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0980  NADH dehydrogenase subunit G  58.79 
 
 		 854 aa  857    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4552  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  64.26 
 
 		 818 aa  941    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3174  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  60.58 
 
 		 777 aa  828    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0590  molybdopterin oxidoreductase  62.12 
 
 		 807 aa  958    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.726223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  64.4 
 
 		 827 aa  985    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  58.75 
 
 		 829 aa  918    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4059  NADH dehydrogenase subunit G  61.04 
 
 		 839 aa  950    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1598  NADH dehydrogenase subunit G  64.53 
 
 		 801 aa  939    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5059  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  62.24 
 
 		 830 aa  918    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07440  NADH dehydrogenase subunit G  55.35 
 
 		 879 aa  810    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0653934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0526  NADH dehydrogenase subunit G  54.47 
 
 		 811 aa  777    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0545  NADH dehydrogenase subunit G  53.31 
 
 		 862 aa  835    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.941021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1544  NADH dehydrogenase subunit G  64.03 
 
 		 801 aa  930    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0544  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 835 aa  1642    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242771  normal  0.39762 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0475  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  55.31 
 
 		 868 aa  785    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6676  NADH dehydrogenase subunit G  60.73 
 
 		 815 aa  902    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  63.39 
 
 		 799 aa  969    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13172  NADH dehydrogenase subunit G  61.92 
 
 		 806 aa  935    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2710  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  58.72 
 
 		 884 aa  864    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1280  NADH-quinone oxidoreductase chain G  58.79 
 
 		 797 aa  907    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.47873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  63.68 
 
 		 801 aa  954    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  60.84 
 
 		 839 aa  962    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0273  NADH dehydrogenase subunit G  59.03 
 
 		 830 aa  898    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6088  NADH dehydrogenase subunit G  81.32 
 
 		 863 aa  1259    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.012959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1574  NADH dehydrogenase subunit G  64.53 
 
 		 801 aa  939    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1879  NADH dehydrogenase subunit G  62.59 
 
 		 799 aa  905    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.780009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4412  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  63.61 
 
 		 815 aa  940    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3223  NADH dehydrogenase subunit G  56.3 
 
 		 820 aa  800    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4457  NADH dehydrogenase subunit G  59.69 
 
 		 839 aa  939    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.76 
 
 		 913 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.84 
 
 		 903 aa  364  4e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.85 
 
 		 823 aa  355  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.85 
 
 		 923 aa  349  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.04 
 
 		 782 aa  343  8e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  35.04 
 
 		 782 aa  343  8e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  31.87 
 
 		 850 aa  340  7e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.95 
 
 		 788 aa  337  7e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.02 
 
 		 833 aa  337  7.999999999999999e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  42.04 
 
 		 918 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.48 
 
 		 798 aa  319  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  34.33 
 
 		 795 aa  316  9.999999999999999e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  34.05 
 
 		 797 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  30.19 
 
 		 899 aa  308  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  33.87 
 
 		 797 aa  308  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.1 
 
 		 898 aa  306  8.000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  34.83 
 
 		 791 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.23 
 
 		 797 aa  305  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  33.92 
 
 		 744 aa  305  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  32.58 
 
 		 744 aa  303  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  34.28 
 
 		 739 aa  301  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  32.65 
 
 		 790 aa  301  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  34.09 
 
 		 744 aa  301  4e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  33.78 
 
 		 715 aa  300  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  33.06 
 
 		 710 aa  300  7e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  33.78 
 
 		 791 aa  298  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  29.02 
 
 		 844 aa  298  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0661  molybdopterin oxidoreductase  30.59 
 
 		 808 aa  296  9e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.09 
 
 		 893 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  30.22 
 
 		 787 aa  295  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  33.19 
 
 		 721 aa  294  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  30.22 
 
 		 787 aa  294  6e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  32.39 
 
 		 776 aa  294  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  31.06 
 
 		 784 aa  293  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  33.51 
 
 		 719 aa  291  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  31.71 
 
 		 771 aa  291  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  28.98 
 
 		 783 aa  291  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  29.08 
 
 		 783 aa  291  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  31.29 
 
 		 717 aa  290  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  32.71 
 
 		 809 aa  290  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.22 
 
 		 900 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  33.19 
 
 		 776 aa  289  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  34.29 
 
 		 776 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  33.19 
 
 		 776 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  33.19 
 
 		 776 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  33.19 
 
 		 776 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  33.19 
 
 		 776 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  33.19 
 
 		 776 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  33.05 
 
 		 776 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  33.19 
 
 		 776 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  33.14 
 
 		 776 aa  287  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.8 
 
 		 796 aa  287  5e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  30.37 
 
 		 826 aa  287  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  31.51 
 
 		 707 aa  287  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  34.15 
 
 		 776 aa  287  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3639  molybdopterin oxidoreductase  27.67 
 
 		 843 aa  286  9e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.424964  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  32.7 
 
 		 777 aa  286  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  32.95 
 
 		 776 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  33.05 
 
 		 776 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  32.6 
 
 		 777 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.65 
 
 		 770 aa  283  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  36.43 
 
 		 689 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  29.99 
 
 		 822 aa  283  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  34.33 
 
 		 776 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  31.57 
 
 		 714 aa  282  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  30.14 
 
 		 831 aa  281  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  33.38 
 
 		 783 aa  281  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  33.23 
 
 		 783 aa  280  6e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  33.03 
 
 		 720 aa  280  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  32.54 
 
 		 783 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>