More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3132 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  61.06 
 
 		 826 aa  1033    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3132  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 815 aa  1667    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4004  molybdopterin oxidoreductase  62.62 
 
 		 821 aa  1009    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08061e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4238  molybdopterin oxidoreductase  61.06 
 
 		 828 aa  1050    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3349  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  61.08 
 
 		 828 aa  1019    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.407234  normal  0.217544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3920  molybdopterin oxidoreductase  62.5 
 
 		 821 aa  1027    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.403816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.7 
 
 		 898 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.18 
 
 		 900 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.87 
 
 		 893 aa  557  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.83 
 
 		 893 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  37.74 
 
 		 899 aa  547  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  36 
 
 		 917 aa  546  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.23 
 
 		 893 aa  548  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  37.17 
 
 		 831 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  36.5 
 
 		 822 aa  521  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.59 
 
 		 904 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3639  molybdopterin oxidoreductase  36.4 
 
 		 843 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.424964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  35.08 
 
 		 844 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.09 
 
 		 905 aa  504  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  36.03 
 
 		 822 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.92 
 
 		 900 aa  497  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.21 
 
 		 901 aa  488  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1538  molybdopterin oxidoreductase  36.69 
 
 		 879 aa  481  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.17 
 
 		 886 aa  464  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.04 
 
 		 920 aa  456  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0661  molybdopterin oxidoreductase  34.5 
 
 		 808 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.56 
 
 		 879 aa  444  1e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  32.27 
 
 		 850 aa  436  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.88 
 
 		 911 aa  435  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.63 
 
 		 923 aa  428  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.4 
 
 		 906 aa  428  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.57 
 
 		 903 aa  423  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.25 
 
 		 1000 aa  422  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0110  molybdopterin oxidoreductase  36.58 
 
 		 998 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.71 
 
 		 913 aa  413  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.52 
 
 		 918 aa  412  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.53 
 
 		 903 aa  411  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.65 
 
 		 949 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  31.17 
 
 		 982 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.72 
 
 		 982 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.08 
 
 		 960 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  31.73 
 
 		 984 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.84 
 
 		 984 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.73 
 
 		 984 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.88 
 
 		 966 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.62 
 
 		 984 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.1 
 
 		 960 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.62 
 
 		 984 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.62 
 
 		 984 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.42 
 
 		 944 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.62 
 
 		 984 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.09 
 
 		 967 aa  392  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.26 
 
 		 959 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.27 
 
 		 979 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.03 
 
 		 984 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.74 
 
 		 960 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.17 
 
 		 979 aa  386  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.74 
 
 		 947 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.61 
 
 		 983 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.17 
 
 		 983 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.69 
 
 		 983 aa  389  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.1 
 
 		 956 aa  389  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.33 
 
 		 988 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.62 
 
 		 983 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.06 
 
 		 983 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.61 
 
 		 983 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  30.98 
 
 		 977 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.81 
 
 		 952 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.61 
 
 		 983 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.3 
 
 		 969 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.89 
 
 		 952 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.01 
 
 		 950 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2684  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.05 
 
 		 951 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.801873  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.59 
 
 		 1428 aa  379  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.15 
 
 		 989 aa  379  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.6 
 
 		 989 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.19 
 
 		 948 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4406  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.59 
 
 		 950 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.13 
 
 		 1421 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.53 
 
 		 948 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.39 
 
 		 948 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  31.99 
 
 		 1385 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.33 
 
 		 959 aa  379  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.15 
 
 		 989 aa  379  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.9 
 
 		 989 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.59 
 
 		 950 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.37 
 
 		 946 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.04 
 
 		 973 aa  375  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.58 
 
 		 978 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.16 
 
 		 959 aa  376  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.42 
 
 		 946 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.5 
 
 		 957 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.39 
 
 		 925 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.14 
 
 		 988 aa  372  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.14 
 
 		 988 aa  372  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2741  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.67 
 
 		 960 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.313061 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.54 
 
 		 933 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  29.93 
 
 		 957 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4998  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.91 
 
 		 953 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217845  hitchhiker  0.000835215 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.46 
 
 		 994 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>