More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0110 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0110  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 998 aa  2046    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.42 
 
 		 893 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.52 
 
 		 893 aa  571  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.51 
 
 		 898 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.87 
 
 		 917 aa  553  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.65 
 
 		 920 aa  551  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  40.61 
 
 		 899 aa  545  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.68 
 
 		 900 aa  542  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.51 
 
 		 893 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.35 
 
 		 904 aa  522  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.21 
 
 		 900 aa  513  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.9 
 
 		 901 aa  512  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.54 
 
 		 911 aa  480  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.36 
 
 		 906 aa  479  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.04 
 
 		 905 aa  478  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.76 
 
 		 944 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.58 
 
 		 879 aa  464  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.01 
 
 		 886 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.07 
 
 		 903 aa  455  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.45 
 
 		 979 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1080  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  37.29 
 
 		 960 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2558  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.84 
 
 		 973 aa  452  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.779669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.15 
 
 		 948 aa  452  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2853  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.97 
 
 		 960 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.771386 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.17 
 
 		 966 aa  448  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.14 
 
 		 952 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2741  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.29 
 
 		 960 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.313061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.62 
 
 		 956 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.28 
 
 		 982 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  35.68 
 
 		 977 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.94 
 
 		 984 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.76 
 
 		 959 aa  448  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.02 
 
 		 959 aa  446  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.56 
 
 		 984 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  36.56 
 
 		 984 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.56 
 
 		 984 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.45 
 
 		 948 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.22 
 
 		 983 aa  445  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.51 
 
 		 946 aa  444  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.44 
 
 		 949 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  36.15 
 
 		 982 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  36.23 
 
 		 957 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.56 
 
 		 984 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.56 
 
 		 984 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.56 
 
 		 984 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.96 
 
 		 979 aa  440  9.999999999999999e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.29 
 
 		 959 aa  442  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4642  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.71 
 
 		 886 aa  442  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0800652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.47 
 
 		 956 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4998  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.44 
 
 		 953 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217845  hitchhiker  0.000835215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.11 
 
 		 978 aa  442  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.45 
 
 		 948 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.38 
 
 		 983 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.87 
 
 		 987 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.38 
 
 		 983 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3566  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.71 
 
 		 886 aa  442  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0757584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.25 
 
 		 983 aa  439  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.82 
 
 		 960 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.5 
 
 		 947 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4406  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.46 
 
 		 950 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.68 
 
 		 983 aa  439  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.56 
 
 		 960 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.14 
 
 		 994 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.53 
 
 		 1000 aa  437  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.94 
 
 		 960 aa  439  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.43 
 
 		 984 aa  439  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.34 
 
 		 950 aa  438  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.5 
 
 		 969 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.31 
 
 		 973 aa  436  1e-121  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.33 
 
 		 983 aa  439  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3925  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.3 
 
 		 959 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.05 
 
 		 959 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.2 
 
 		 983 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3656  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.94 
 
 		 948 aa  433  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.480327 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.89 
 
 		 925 aa  430  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.59 
 
 		 952 aa  432  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.92 
 
 		 950 aa  432  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.47 
 
 		 959 aa  432  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4523  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.67 
 
 		 886 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195662  normal  0.224956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.53 
 
 		 967 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1341  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.09 
 
 		 987 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4391  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.67 
 
 		 886 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.94 
 
 		 951 aa  428  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.27 
 
 		 948 aa  429  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.91 
 
 		 927 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.43 
 
 		 946 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.61 
 
 		 979 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.79 
 
 		 945 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3089  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.76 
 
 		 959 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2856  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.46 
 
 		 959 aa  426  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0655  molybdopterin oxidoreductase family protein  32.62 
 
 		 978 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.48 
 
 		 1012 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0499  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  32.66 
 
 		 978 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0501  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  32.66 
 
 		 978 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.3 
 
 		 937 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1636  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.48 
 
 		 979 aa  420  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.632493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.52 
 
 		 957 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.7 
 
 		 989 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0627  molybdopterin oxidoreductase family protein  32.41 
 
 		 978 aa  420  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0505  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.49 
 
 		 980 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>