More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3439 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0326  NADH dehydrogenase subunit G  67.15 
 
 		 631 aa  863    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 677 aa  1384    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0157  NADH dehydrogenase subunit G  58.25 
 
 		 648 aa  717    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.735826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  85.76 
 
 		 642 aa  1089    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  58.41 
 
 		 648 aa  715    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  47.58 
 
 		 798 aa  545  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1954  NADH dehydrogenase subunit G  45.8 
 
 		 818 aa  515  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1122  NADH dehydrogenase subunit G  40.67 
 
 		 909 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.741047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3608  NADH dehydrogenase subunit G  39.47 
 
 		 904 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0967194  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3370  NADH dehydrogenase I, G subunit  39.57 
 
 		 905 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3202  NADH dehydrogenase subunit G  38.57 
 
 		 905 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119939  normal  0.155936 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02208  NADH dehydrogenase subunit G  38.31 
 
 		 910 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4124  NADH dehydrogenase subunit G  39.85 
 
 		 904 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2437  NADH dehydrogenase subunit G  38.15 
 
 		 908 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02168  hypothetical protein  38.31 
 
 		 910 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3696  NADH dehydrogenase subunit G  39.85 
 
 		 904 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1868  NADH dehydrogenase subunit G  39.38 
 
 		 904 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.052963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1741  NADH dehydrogenase subunit G  39.85 
 
 		 904 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0398307  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2827  NADH dehydrogenase subunit G  38 
 
 		 910 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0965571  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1374  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.15 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00828707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2576  NADH dehydrogenase subunit G  38.15 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2659  NADH dehydrogenase subunit G  38.15 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1369  NADH dehydrogenase subunit G  38.15 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852491  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2417  NADH dehydrogenase subunit G  38.17 
 
 		 902 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58498  normal  0.233551 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2432  NADH dehydrogenase subunit G  38.15 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3422  NADH dehydrogenase subunit G  38.15 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1018  NADH dehydrogenase subunit G  36.85 
 
 		 942 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181039  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1016  NADH dehydrogenase subunit G  37.36 
 
 		 909 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2562  NADH dehydrogenase subunit G  37.54 
 
 		 908 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2507  NADH dehydrogenase subunit G  37.54 
 
 		 908 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2545  NADH dehydrogenase subunit G  37.33 
 
 		 908 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0568157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  39.01 
 
 		 871 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  40.54 
 
 		 872 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2551  NADH dehydrogenase subunit G  37.54 
 
 		 908 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0113562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2462  NADH dehydrogenase subunit G  37.54 
 
 		 908 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289624  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2669  NADH dehydrogenase subunit G  37.54 
 
 		 908 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1399  NADH dehydrogenase subunit G  37.48 
 
 		 908 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1459  NADH dehydrogenase subunit G  36.88 
 
 		 914 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1811  NADH dehydrogenase subunit G  36.88 
 
 		 914 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.821067 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1565  NADH dehydrogenase subunit G  36.88 
 
 		 914 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0713  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.15 
 
 		 896 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2767  NADH dehydrogenase subunit G  36.83 
 
 		 908 aa  378  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3303  NADH dehydrogenase subunit G  36.22 
 
 		 915 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113952  normal  0.988711 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1497  NADH dehydrogenase subunit G  37 
 
 		 908 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.838261  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28490  NADH dehydrogenase subunit G  37.34 
 
 		 903 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4738  NADH dehydrogenase subunit G  39.27 
 
 		 877 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656278  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3127  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.1 
 
 		 920 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2564  NADH dehydrogenase subunit G  36.69 
 
 		 905 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29940  NADH dehydrogenase subunit G  37.15 
 
 		 905 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1352  NADH dehydrogenase subunit G  38.25 
 
 		 872 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.236873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3820  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  46.4 
 
 		 899 aa  360  7e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1115  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  46.65 
 
 		 902 aa  345  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0376  NADH dehydrogenase subunit G  44.01 
 
 		 909 aa  340  7e-92  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0886279  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  43.83 
 
 		 1030 aa  339  9.999999999999999e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  43.83 
 
 		 1039 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1694  NADH dehydrogenase subunit G  43.45 
 
 		 1010 aa  333  9e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2865  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.2 
 
 		 947 aa  331  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119541  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1694  NADH dehydrogenase subunit G  46.41 
 
 		 860 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0130655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  44.28 
 
 		 929 aa  327  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0105  NADH dehydrogenase subunit G  44.87 
 
 		 860 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.831692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1741  NADH dehydrogenase subunit G  44.87 
 
 		 860 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.217192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  31.37 
 
 		 782 aa  279  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.37 
 
 		 782 aa  279  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  33.39 
 
 		 744 aa  271  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  31.1 
 
 		 776 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  31.1 
 
 		 776 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.17 
 
 		 833 aa  268  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  31.1 
 
 		 776 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  29.17 
 
 		 714 aa  268  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  31.1 
 
 		 776 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  31.1 
 
 		 776 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  31.1 
 
 		 776 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  32.31 
 
 		 669 aa  268  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  30.94 
 
 		 776 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  32.72 
 
 		 670 aa  263  6e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  30.35 
 
 		 777 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  30.45 
 
 		 717 aa  262  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  31 
 
 		 776 aa  261  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  28.11 
 
 		 720 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  29.18 
 
 		 779 aa  257  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  30.41 
 
 		 783 aa  257  4e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  30.73 
 
 		 776 aa  257  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.76 
 
 		 770 aa  256  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  33.84 
 
 		 667 aa  256  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  28.46 
 
 		 808 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  30.19 
 
 		 771 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  29.97 
 
 		 784 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  35.28 
 
 		 777 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.77 
 
 		 771 aa  254  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  30.79 
 
 		 776 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  27.85 
 
 		 797 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  30.79 
 
 		 776 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  30.37 
 
 		 776 aa  253  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  29.03 
 
 		 777 aa  253  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  30.09 
 
 		 783 aa  253  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  29.94 
 
 		 783 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  30.21 
 
 		 776 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  30.18 
 
 		 715 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.37 
 
 		 797 aa  251  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  29.19 
 
 		 783 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>