More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1954 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1954  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 818 aa  1663    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0209  NADH dehydrogenase subunit G  44.33 
 
 		 798 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0326  NADH dehydrogenase subunit G  45.69 
 
 		 631 aa  548  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0159  NADH dehydrogenase subunit G  45.25 
 
 		 642 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3439  NADH dehydrogenase subunit G  45.62 
 
 		 677 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0157  NADH dehydrogenase subunit G  42.52 
 
 		 648 aa  488  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.735826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0175  NADH dehydrogenase subunit G  42.22 
 
 		 648 aa  482  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1497  NADH dehydrogenase subunit G  39.1 
 
 		 908 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.838261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2545  NADH dehydrogenase subunit G  40.22 
 
 		 908 aa  411  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0568157  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02208  NADH dehydrogenase subunit G  39.05 
 
 		 910 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02168  hypothetical protein  39.05 
 
 		 910 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2827  NADH dehydrogenase subunit G  38.98 
 
 		 910 aa  406  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0965571  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1374  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.9 
 
 		 908 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00828707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3820  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.21 
 
 		 899 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2432  NADH dehydrogenase subunit G  38.9 
 
 		 908 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2437  NADH dehydrogenase subunit G  38.9 
 
 		 908 aa  405  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2767  NADH dehydrogenase subunit G  38.64 
 
 		 908 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1369  NADH dehydrogenase subunit G  38.9 
 
 		 908 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852491  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1122  NADH dehydrogenase subunit G  38.83 
 
 		 909 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.741047  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3422  NADH dehydrogenase subunit G  38.9 
 
 		 908 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2576  NADH dehydrogenase subunit G  38.8 
 
 		 908 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2659  NADH dehydrogenase subunit G  38.9 
 
 		 908 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1016  NADH dehydrogenase subunit G  33.44 
 
 		 909 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1565  NADH dehydrogenase subunit G  37.9 
 
 		 914 aa  399  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1018  NADH dehydrogenase subunit G  38.18 
 
 		 942 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1399  NADH dehydrogenase subunit G  39.08 
 
 		 908 aa  399  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1811  NADH dehydrogenase subunit G  37.75 
 
 		 914 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.821067 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1459  NADH dehydrogenase subunit G  37.9 
 
 		 914 aa  399  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2462  NADH dehydrogenase subunit G  38.52 
 
 		 908 aa  396  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289624  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2669  NADH dehydrogenase subunit G  38.52 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2507  NADH dehydrogenase subunit G  38.52 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2551  NADH dehydrogenase subunit G  38.43 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0113562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2562  NADH dehydrogenase subunit G  38.52 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0376  NADH dehydrogenase subunit G  36.71 
 
 		 909 aa  392  1e-107  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0886279  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3303  NADH dehydrogenase subunit G  37.5 
 
 		 915 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113952  normal  0.988711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3370  NADH dehydrogenase I, G subunit  37.52 
 
 		 905 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3608  NADH dehydrogenase subunit G  36.8 
 
 		 904 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0967194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2417  NADH dehydrogenase subunit G  36.77 
 
 		 902 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58498  normal  0.233551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1741  NADH dehydrogenase subunit G  37.83 
 
 		 904 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0398307  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1868  NADH dehydrogenase subunit G  37.75 
 
 		 904 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.052963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4124  NADH dehydrogenase subunit G  37.67 
 
 		 904 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3202  NADH dehydrogenase subunit G  36.59 
 
 		 905 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119939  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4738  NADH dehydrogenase subunit G  39.27 
 
 		 877 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656278  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3696  NADH dehydrogenase subunit G  37.83 
 
 		 904 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1331  NADH dehydrogenase subunit G  40.51 
 
 		 872 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2564  NADH dehydrogenase subunit G  37.19 
 
 		 905 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28490  NADH dehydrogenase subunit G  37.52 
 
 		 903 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45196  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4066  NADH dehydrogenase subunit G  38.35 
 
 		 871 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0945726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2865  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.08 
 
 		 947 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119541  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0713  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.92 
 
 		 896 aa  369  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29940  NADH dehydrogenase subunit G  36.56 
 
 		 905 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  37.62 
 
 		 929 aa  360  8e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3127  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.9 
 
 		 920 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1115  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.19 
 
 		 902 aa  354  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1352  NADH dehydrogenase subunit G  39.59 
 
 		 872 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.236873 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0589  NADH dehydrogenase subunit G  44.52 
 
 		 1030 aa  345  2e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0578  NADH dehydrogenase subunit G  44.29 
 
 		 1039 aa  344  4e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1694  NADH dehydrogenase subunit G  43.61 
 
 		 1010 aa  333  5e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  30.93 
 
 		 797 aa  321  3.9999999999999996e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1694  NADH dehydrogenase subunit G  42.03 
 
 		 860 aa  297  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0130655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  32.82 
 
 		 795 aa  294  6e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.01 
 
 		 782 aa  293  9e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  33.01 
 
 		 782 aa  293  9e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1741  NADH dehydrogenase subunit G  40.92 
 
 		 860 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.217192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0105  NADH dehydrogenase subunit G  40.66 
 
 		 860 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.831692  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  27.28 
 
 		 844 aa  284  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.35 
 
 		 797 aa  280  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.94 
 
 		 771 aa  278  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  30.23 
 
 		 700 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  31.32 
 
 		 777 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  29.6 
 
 		 771 aa  273  7e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  31.39 
 
 		 777 aa  273  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.66 
 
 		 823 aa  272  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  31.21 
 
 		 808 aa  271  5e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  29.44 
 
 		 717 aa  271  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  29.54 
 
 		 783 aa  270  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  28.53 
 
 		 783 aa  270  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  27.37 
 
 		 831 aa  270  7e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  31.02 
 
 		 776 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  29.82 
 
 		 771 aa  270  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  30.87 
 
 		 776 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  30.87 
 
 		 776 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  30.87 
 
 		 776 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  30.87 
 
 		 776 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  30.87 
 
 		 776 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  30.87 
 
 		 776 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  30.45 
 
 		 777 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  30.06 
 
 		 776 aa  267  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  30.06 
 
 		 776 aa  267  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  30.51 
 
 		 776 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  30.06 
 
 		 776 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  30.43 
 
 		 776 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  30.18 
 
 		 776 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.86 
 
 		 798 aa  265  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  30.03 
 
 		 776 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  30.51 
 
 		 790 aa  264  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  30.97 
 
 		 791 aa  263  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  26.77 
 
 		 796 aa  261  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  30.92 
 
 		 791 aa  260  9e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.74 
 
 		 770 aa  259  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>